刘如谦
教授先后开发了两种精准基因编辑工具——
碱基编辑器
(Base Editor)
和
先导编辑器
(Prime Editor)
,相比CRISPR-Cas9,这两种新型基因编辑工具不会产生DNA双链断裂
(DSB)
,被认为是更安全的新一代基因编辑工具。
限制碱基编辑和先导编辑应用的主要障碍是递送,对于体内基因编辑,目前的标准递送方式是使用病毒载体,然而,碱基编辑和先导编辑及其guide RNA超过了
慢病毒
(LV)
和
腺相关病毒
(AAV)
的载体容量限制。此外,这些病毒载体递送后长时间表达基因编辑器,从而增加脱靶编辑
(off-target editing)
以及旁观者编辑
(bystander editing)
的风险。病毒载体自身还可能带来整合风险。
因此,相比使用病毒载体递送基因编辑工具进行体内基因编辑,将基因编辑工具以
核糖核蛋白
(RNP)
的形式递送到体内进行基因编辑更安全,然而,RNP的瞬时活性通常难以产生最佳基因编辑效果。
2024年11月28日,
刘如谦
团队联合加州大学欧文分校的研究人员在
Nature
子刊
Nature Biomedical Engineering
上发表了题为:
Safer and efficient base editing and prime editing via ribonucleoproteins delivered through optimized lipid-nanoparticle formulations
的研究论文。
该研究通过优化
脂质纳米颗粒
(LNP)
配方以
核糖核蛋白
(RNP)
的形式递送
碱基编辑器
(Base Editor)
和
先导编辑
(Prime Editor)
,实现了更安全、更高效的基因编辑。
Spark公司开发的AAV基因疗法Luxturna于2017年获得美国FDA批准上市,通过AAV病毒载体递送正确的RPE65基因治疗Leber氏先天性黑蒙症2型
(LCA2)
,真实世界数据显示,治疗效果可持续7年甚至更久,这表明了使用AAV病毒载体递送的转基因可持续表达。
对于
核糖核蛋白
(RNP)
,将纯化的蛋白质
(例如Cas9)
与合成的guide RNA复合,从而无需转录和翻译,可在细胞内最快速地启动基因编辑活性,且持续编辑的时间最短。
在这项最新研究中,研究团队证实了
细胞穿透肽
(CPP,构建融合蛋白或作为辅料)
可以提高递送RNP的效率,并且封装RNP的脂质纳米颗粒
(LNP)
可以优化以增强RNP的稳定性、递送效率和基因编辑效力。
具体来说,在筛选合适的可电离阳离子脂质并通过优化合成脂质DMG-PEG 2000的浓度后,研究团队表明,使用可电离脂质SM102,通过微流控混合,将
腺嘌呤碱基编辑器
(ABE)
和先导编辑器
(Prime Editor)
以RNP形式封装在LNP内,相比直接递送裸RNP,可将体内基因编辑效率提高300倍以上,在遗传性视网膜变性小鼠体内日,成功修复了Rpe65基因突变,显示出了视觉功能的恢复,且没有检测到脱靶编辑。
总的来说,该研究通过化学定义的LNP配方的优化,提高了封装RNP稳定性和递送效率,从而产生了更安全的碱基编辑和先导编辑。
论文链接:
https://www.nature.com/articles/s41551-024-01296-2