专栏名称: 植物科学最前沿
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即将开课| 从数据分析到精美科研绘图,只需三天,利用R进行数据分析与科研绘图培训班

植物科学最前沿  · 公众号  ·  · 2024-05-07 21:46

正文

助推科研

不知道选择什么类型的可视化图表;图形无法准确传达我们想要表达的意义;图表配色 旧不够吸睛;投稿返修之后发现图表某些参数需要更改,然后从头返 让您精通科研绘图(理论学习+实操演练),只需三天!

一图胜千言,如何将纷繁庞杂的试验数据经过合理的加工处理后呈现出精美准确的可视化图表是科研人员发表高质量论文的关键。 论文撰写过程中我们经常会有这样的经历:不知道选择什么类型的可视化图表;图形无法准确传达我们想要表达的意义;图表配色土旧不够吸睛;投稿返修之后发现图表某些参数需要更改,被迫从头返工……因此,从数据处理分析到最后的可视化都需要我们采用合理高效的方法,避免占用过多的时间精力进而影响文章投稿的节点,尽可能降低论文被抢发的风险。

作为广泛应用于数据科学和统计分析领域的编程语言, R 已经发展成为一个成熟的集数据处理、统计分析、绘图于一体的强大系统 ,特别是它所拥有的一系列丰富的可视化扩展包( lattice plotly ggplot2 ggplot2 衍生的一系列程序包),不仅提供了丰富的模板,还可以根据需求创建高度自定义的图形,从而帮助科研工作者更快速地创建高质量的可视化图表,而且编程语言的特性使我们在修改或者再次绘制图表时非常便捷快速。

去年 3 月份,我们成功举办了第一期科研绘图学习交流会,得到了广大学员的一致好评,基于大家对学习数据分析和科研绘图的热切需求, 我们特定于 4 27~29 日举办第二期 《基于 R 语言的数据分析与科研绘图》 课程。 届时我们将邀请数据处理与可视化实战专家夏冰博士带团队助理为我们进行为期三天的系统讲授,夏冰博士多年来致力于机器学习与数据挖掘在营养学与交叉学科研究中的应用,善于利用 R 进行数据处理、数据可视化与统计建模,精通各类生物信息学复杂图表的制作,具有丰富的组学数据处理与可视化实战经验。

本次课程,我们依然遵循 “理论学习 + 实操演练” 的原则,兼顾身处不同层次学员的需求, R 软件入门到数据分析再到基本绘图以及 ggplot2 数据可视化 ,带大家一起学习掌握科研绘图的精髓,让您实现从零基础到熟练掌握的转变,为您撰写高水平论文加油助力。



R软件数据分析及绘图效果(示例)




培训形式


形  式:线上直播(课程回放三个月)

时  间:2024年4月27-29日


课程对象


农学(作物学、园艺学、农业资源与环境、植物保护、畜牧学、兽医学、林学、水产、草学)、理学(生物学、生态学)、工学(农业工程、环境科学、食品科学)、医学等相关专业的教研工作者、在读研究生及广大基层科研工作者


课程收获


  • 系统学习数据分析与科研绘图的理论知识
  • 熟练掌握利用R进行数据处理的方法
  • 根据不同实验目的对数据进行相应 的统计分析
  • 精通各类科研图表的制

课程安排


上午 8:30-11:30

下午 14:00-17:00

5 18

星期

R 软件入门及利用 tidyverse 处理数据

l R 语言的基本操作

l 数据集的创建、管理、导出

l 利用 tidyverse 进行数据管理

l 数据读写

l 数据重塑

l 数据连接

l 基本数据操作(选择、修改、筛选、分组操作等)

l 数据处理难题的有关解决方案

重复循环

条件执行

整合转置

5 19

星期

数据分析

l 描述性统计分析

l 相关统计( pearson spearman kendell 相关、相关检验、相关可视化)

l 参数检验和非参数检验( t 检验、方差分析、 Kruskal-Wallis Friedman test

l 回归统计(线性回归、逐步回归、多项式回归、偏最小二乘回归、 Logistic 回归)

l 主成分分析、因子分析与聚类分析

5 2 0

星期

基本绘图与 ggplot2 数据可视化

l 相关绘图包的介绍、安装与加载

l R 语言中不同的图形系统

l 基本图形(条形图、饼图、直方图、散点图、线图、箱线图等)

l 使用 ggplot2 进行数据可视化(数据、映射、几何对象、统计变化、坐标系、分面、标度)

l ggplot2 高级可视化图形案例(三元图、火山图、哑铃图、金字塔图、 Manhattan 图、冲击图等)



主讲专家

夏冰

博士,副教授




夏冰,博士、副教授,北京市青年托举人才,博士毕业于营养学国家重点实验室,读博期间荣获 NOVUS 国际优秀研究生奖学金、中国营养学会缤纷科学奖。主要研究方向为机器学习与数据挖掘在营养学及其交叉学科研究中的应用。担任多本 SCI 期刊审稿人,熟练运用 R Python SAS 等主流数据分析挖掘软件,善于利用 R 进行数据处理、数据可视化与统计建模,精通各类生物信息学复杂图表的制作,具有丰富的组学数据处理与可视化实战经验。以第一作者在 Microbiome Int J Biol Macromol Food Function 等国际著名 SCI 期刊上发表论文 13 篇,授权国家发明专利 3 项,参编专著一部。


课程助理,中国科学院博 士后,主持及参与国家自然科学基金与十三五国家重点研发项目 3 项,精通生物信息学数据分析、数据挖掘与机器学习,具备多年数据分析及可视化实操经验。在中科院 1 区、 2 区发表 SCI 科研论文 13 篇。


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