近日，华大智造发布了新一代StandardMPS 2.0（简称SM 2.0）测序试剂，
该产品不仅使得测序数据的产量和Q30等参数均获得有效提升，而且使DNBSEQ平台的测序质量达到了Q40(>85%)。
StandardMPS 2.0测序试剂的发布,将开启基因测序行业测序质量达Q40的时代，可为全球用户带来全新的产品体验。本文总结了SM 2.0测序试剂搭配不同DNBSEQ测序平台得到的测试结果，并涵盖两家早期用户基于SM 2.0的实测表现。
数据显示，华大智造StandardMPS 2.0测序试剂可使得DNBSEQ测序平台中＞85%的碱基测序质量达Q40，
全基因组测序(Whole Genome Sequencing,WGS)、单细胞以及微生物研究均可受益于测序数据质量的提升。
经过不断地筛选与测试，采用了具有更高聚合效率的DNA 聚合酶以及拥有更好二链置换功能的 MDA（多重置换扩增）酶。
通过优化dNTP上的荧光染料，降低碱基之间的crosstalk， 从而提升碱基识别的准确度。
利用高保真酶和PCR-Free建库方法，降低上游实验引入的错误，用更准确的模型训练，提高数据的解读精度，生成更精确的Q值表。
StandardMPS 2.0适配多款测序仪(DNBSEQ-G99，MGISEQ-2000，DNBSEQ-T7等)以满足用户不同的应用场景需求。
测序质量达到Q40代表碱基识别准确度达到了99.99%级别
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，从Q30 （99.9%）的碱基识别质量跃升至新的高度。
测序质量达到Q40将为科学研究和临床应用等提供更多可能：如更准确地检测低丰度碱基，进而促进肿瘤学研究中的低频突变
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、传染病研究中的低频耐药突变
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、液体活检中的新型生物标志物如ctDNA
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的发现。同时，测序质量达到Q40也有助于WGS研究中的SNP（单核苷酸多态性）及InDel （插入 / 缺失）等变异的发现
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，提高细菌等微生物的鉴定准确度
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等。
测序平台：DNBSEQ-G99, MGISEQ-2000, DNBSEQ-T7
应用方向：WGS，肿瘤检测
测序质量获得极大提升
SM 2.0搭配不同DNBSEQ平台（DNBSEQ-G99, MGISEQ-2000以及DNBSEQ-T7）Q40超过85%。Total reads数，Q30及其他测序数据参数相较于上一代试剂SM均有提高（表1），测序质量达Q40的碱基比例显著增加（图1）。
表1. SM 2.0可显著提高DNBSEQ测序平台的数据质量。
注：
ESR(%)：
Effective Spot Rate，ESR=(Total Reads / DNB Numbe
r)×100%；
以上文库均为
E. coli
文库。
图1. SM 2.0显著提升DNBSEQ平台测序数据质量。
SM或SM 2.0搭配DNBSEQ-G99(A)、MGISEQ-2000(B)或DNBSEQ-T7(C)得到的不同Q值下的碱基比例分布；
SM 2.0搭配MGISEQ-2000(D)或DNBSEQ-T7(E)所获测序数据质量与其他厂商测序平台的比较分析。
其中A为
E. coli
文库，B-E均为NA12878文库。
有效提高WGS研究中的变异检测效率
SM 2.0搭配MGISEQ-2000对SNP和InDel检测的准确度超过行业同类平台，分别达到了99.8%和99%(图2A)。测序质量的提升亦降低了对数据量的需求，达到30×平均测序深度所需的原始数据量显著低于120 Gb的行业标准以及行业同类平台所需数据量(图2B)。
图2. SM 2.0搭载DNBSEQ测序平台可极大提高WGS研究中的SNP/InDel检测精度，并降低所需测序数据量。
以上测序文库均为NA12878文库。
测序平台：MGISEQ-2000
应用方向：单细胞RNA测序 (scRNA-seq)
在单细胞测序场景下，
相较于上一代测序试剂SM，SM 2.0搭配MGISEQ-2000使测序质量达Q40的碱基比例高达90.88%。
得到的高质量reads (Total Read
s)更多，比对率（Mapping rate）更高，错误率（Mismatch rate）更低，对特异等位基因表达水平的检测更为准确。
Xpress Genomics公司首席执行官Christoph Ziegenhain表示
：“我们对StandardMPS 2.0测序试剂的发布感到激动，它能够将测序质量提升到Q40。它的早期测试数据表现非常出色，这有助于我们拓展单细胞测序的应用。”
测序平台：DNBSEQ-T7
应用方向：微生物研究，宏基因组测序
强效助力微生物领域研究
在微生物研究领域，SM 2.0搭配DNBSEQ-T7可使Q40高达90.75%，Q30亦提升至94.22%。
Ambiogen公司首席执行官Maike Seifert表示
：“在宏基因组测序的早期测试中，StandardMPS 2.0试剂表现出卓越的Q40测序质量。它让测序数据具有很高的准确性和可靠性，能够帮助我们对复杂微生物群落进行更精确的分析和研究。”
以上实测数据表明，华大智造StandardMPS 2.0测序试剂可使得DNBSEQ测序平台中＞85%的碱基测序质量达Q40，WGS、单细胞以及微生物研究均可受益于测序数据质量的提升。
StandardMPS 2.0测序试剂搭配DNBSEQ平台测序可进一步提升测序质量，降低测序成本，这对于深入解析生物体内错综复杂的生物学过程至关重要，将极大地推动高通量测序技术在肿瘤学研究、传染病领域、遗传病诊断等领域的广泛应用。
