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Nature子刊3连发!深度迁移学习又开挂了!顶刊热点果然名不虚传,快冲!

AI算法科研paper  · 公众号  ·  · 2024-12-31 19:01

正文

深度迁移学习 最近取得了相当大的进展,很多成果登上了各大一区TOP期刊,比如发表于Nat. Commun.的深度迁移学习新框架TransDSI、scDEAL;Nat Biomed Eng上深度迁移学习在AD治疗中的应用...

实际上,这种结合了深度学习和迁移学习的技术, 在学术界和工业界一直广受欢迎, 因为它可以在新任务上快速达到高性能,无需从头开始训练模型, 极大减少了运算时间和资源消耗 ,非常适用于医学影像分析等这类数据稀缺或计算资源有限的领域。

另外,深度迁移学习还可以 提高模型的泛化能力 ,这意味着模型能在未见过的数据上保持高预测准确性,从而在各种任务和领域中表现出色,也说明了深度迁移学习的应用前景之广阔。

本文分享 10篇 深度迁移学习最新论文 ,包含多篇顶刊,有论文需求的同学可以直接拿来作参考,开源代码也附上了,方便大家复现。

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A protein sequence-based deep transfer learning framework for identifying human proteome-wide deubiquitinase-substrate interactions

方法: 论文提出了基于蛋白质序列的深度迁移学习框架,用于识别人类蛋白质组范围内的去泛素化酶与底物之间的相互作用。这个框架名为TransDSI,它通过转移蛋白质组规模的进化信息来预测未知的DSIs,即使在训练数据不足的情况下也能有效工作。

创新点:

  • 基于蛋白序列的迁移学习:TransDSI通过蛋白序列预训练解决数据不足问题。
  • 解释性模块:PairExplainer解释预测结果,揭示DSI结构基础。
  • 新功能视角与药物靶点发现:TransDSI助力发现新药物靶点和精准医疗。

Deep transfer learning of cancer drug responses by integrating bulk and single-cell RNA-seq data

方法: 论文提出了一种名为scDEAL的深度迁移学习框架,通过整合大规模的多细胞系RNA-seq数据,预测单细胞-癌症药物反应。scDEAL框架的核心在于将与药物相关的bulk RNA-seq数据与单细胞RNA测序数据进行协调,并转移在bulk RNA-seq数据上训练的模型来预测scRNA-seq中的药物反应。

创新点:

  • scDEAL框架利用深度迁移学习将bulk RNA-seq模型应用于单细胞数据,以预测药物反应。
  • 该框架采用整合梯度方法识别关键基因,揭示药物反应机制。
  • scDEAL通过DAE和细胞类型正则化保留单细胞数据的多样性。

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