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老板让我博士编个乳酰化课题,发几篇10分文章毕业,看了人家上海交通大学的13.7分乳酰化SCI文章,我估计我是够呛……

实验万事屋  · 公众号  · 科研  · 2024-11-28 08:20

正文

乳酰化和线粒体其实都算是近几年来比较热的点,特别是在国自然上,都比较受追捧。今天讲的这篇文章,就是上海交通大学医学院附属任济医院的住院医师,发表在13.7分的Cell Death Differ上的乳酰化相关文章,我们就来看看他们都做了点什么吧:



他们做的是TBI(创伤性脑损伤)中的线粒体自噬现象(其实线粒体自噬这个大家应该都不陌生了,在《信号通路是什么鬼?》系列里都有过介绍,就是通过对于损伤的线粒体的自噬,缓解细胞的ROS压力,从而让细胞苟延残喘的过程),他们首先发现,在TBI患者中存在着较多的高乳酸水平,并且乳酸水平的升高与TBI的不良结局相关。而乳酸含量的增多,其实也预示着可能产生的蛋白乳酰化。于是他们进行了TBI样本以及小鼠CCI(受控皮质影响)模型中,总乳酰化的检测,结果发现TBI会增加受伤神经元的蛋白总乳酰化水平:



那么在这么多蛋白的乳酰化过程中,是否有一个蛋白的乳酰化,对于TBI的恶化会有更多的贡献呢?于是他们对CCI模型小鼠,进行了赖氨酸乳酸组分析。在蛋白差异中,有很多乳酰化的蛋白,位于线粒体,而其中TUFM与TBI的相关性更大。在CCI模型小鼠中,TUFM的乳酰化明显增加,而TUFM的乳酰化位点则是K286(这其实就是柯霍氏法则的验证,通过TBI对于蛋白乳酰化的关联性,发现了TUFM的K286乳酰化,使之与TBI建立了关联,不清楚柯霍氏法则的话,可以看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》和《轻松的文献导读》):



TUFM在从细胞质转位到线粒体后,主要参与了线粒体自噬的调节。而随着乳酰化的增多,TUFM的线粒体定位就明显降低了,也就是说乳酰化抑制了TUFM的线粒体分布。为了证明乳酰化对于TUFM的定位影响,他们对TUFM进行了K286R的突变,导致TUFM在K286位点无法被乳酰化。在敲除了TUFM后,分别表达野生型的TUFM和突变的TUFM,结果发现,野生型的TUFM会响应乳酸增多导致的线粒体定位丧失,而突变体则对于乳酸增多没有影响(这样的突变验证,可以更有效地验证TUFM的乳酰化,对于TUFM的线粒体定位的影响,这是单纯过表达TUFM或敲减TUFM能做到的,可以有效避免肯定后件的逻辑谬误,不清楚肯定后件逻辑谬误的话,可以去看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼?》系列)。通过这样的验证,他们明确了乳酰化抑制TUFM的线粒体定位:



那么乳酰化抑制TUFM的线粒体定位的机制又是什么呢?于是他们对TUFM进行了免疫共沉淀,并通过质谱分析,发现TUFM会与TOMM40(线粒体外膜转位酶40)结合。而当TUFM的K286位点乳酰化后,则TUFM与TOMM40的结合就会被抑制。TUFM的K286R突变则不受乳酰化影响,可以与TOMM40结合,而TOMM40是线粒体外膜上的蛋白,这也就是TUFM的线粒体定位受到乳酰化影响的关键:



线粒体上的TUFM会通过招募LC3,促进线粒体自噬。于是他们用TOMM40做了个自噬的报告基因,也就是在TOMM40后串联了mCherry-EGFP标签(线粒体自噬产生后,自噬体被溶酶体整合,TOMM40-mCherry-EGFP的绿色荧光在酸性条件下被淬灭,取而代之的是酸性条件下仍能产生荧光的mCherry,这个在《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼?》系列里有介绍过,可以去看看)。他们还是通过TUFM的野生型和K286R突变体进行了验证,结果发现TUFM的K286位点乳酰化,抑制了线粒体自噬,并促进细胞凋亡:



在体外实验做完之后,他们又进行了TUFM的野生型和K286R突变体小鼠的体内验证在验证的过程中,将关键的验证节点都锁定在了赖氨酸的乳酰化这一点上,不扩大命题的外延,避免了肯定后件的逻辑谬误,不熟悉肯定后件和命题的内涵以及外延的话,可以看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼?》系列,同样在敲除了TUFM野生型后,敲入TUFM的K286R突变体的小鼠,在TBI后表现出线粒体自噬增加和细胞凋亡减少:



而由于TUFM的乳酰化导致的线粒体自噬被抑制后,小鼠在TBI后细胞凋亡和神经功能也受到了影响。也就是说TUFM的乳酰化,在体内调节TBI后的细胞凋亡和神经功能:



最后就形成了这样的示意图,在人脑收到了创伤性损伤后,会产生大量的乳酸累积,乳酸促进了TUFM的乳酰化。而K286位点乳酰化的TUFM,则会失去与TOMM40的结合,导致无法定位到线粒体,抑制了线粒体自噬,导致细胞凋亡的促进。而未被乳酰化修饰的TUFM,可以与TOMM40结合,促进线粒体自噬从而使得细胞凋亡被抑制,缓解TBI的症状:



这篇文章在验证过程中,都是踩在点上的,也就是这篇文章优秀之处。好了,今天就先策到这里吧,有兴趣的话就看看原文,祝你们心明眼亮。

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