专栏名称: 测序中国
测序中国(seq.cn):基因行业新媒体
目录
相关文章推荐
开平广播电视台  ·  年味“拉满”!开平乡镇花式贺新春! ·  13 小时前  
广东公共DV现场  ·  多地交警明确:不处罚! ·  2 天前  
广东公共DV现场  ·  又有新补贴!标准明确→ ·  5 天前  
广东台今日关注  ·  全红婵,已回湛江过年! ·  5 天前  
51好读  ›  专栏  ›  测序中国

Cell:基因编辑先驱 Doudna 给“基因魔剪”安“刹车”

测序中国  · 公众号  ·  · 2017-08-30 13:11

正文

受热捧的基因编辑技术 CRISPR-Cas9 并非完美,它犹如一辆没有刹车装置的汽车,可能失控伤及无辜,即产生脱靶效应——编辑了不该编辑的基因片段。从去年 12 月开始,科学家们争先恐后地开启为 CRISPR 安上“刹车”的研究,他们试图从自然界,找出这个“刹车”。

美国生物学家、最先提出 CRISPR-Cas9 可以进行基因编辑的詹妮弗·杜德纳(Jennifer Doudna)也是其中的一员。当地时间 8 月 24 日,她与同事的相关论文发表在顶级期刊《细胞》(Cell)杂志,揭示了两个可以为 CRISPR 的基因编辑画上停止键的蛋白质是如何发挥作用的。此外,这两个抑制蛋白具有广谱性,也就是说可以适用不同的 CRISPR 系统。

CRISPR 系统应用于基因编辑,是科学家从细菌身上取得的“经”。为了对付“杀手”噬菌体,细菌的免疫系统经过漫长的时间,进化出 CRISPR 系统。一旦有噬菌体入侵细菌,细菌的免疫系统会抓取一段噬菌体的 DNA 作为备份。等到下一次噬菌体再次来袭,细菌就可以根据备份,做出识别。识别成功时,细菌的 Cas9 蛋白会切断噬菌体的 DNA。这套系统为人类所用时,可以高效地对目标基因进行切割、添入等编辑。由于其高效,在业界有“基因魔剪”之称。

尽管 CRISPR 系统被广泛验证其有效性,成为全球各大生物实验室的宠儿,也有一些人体临床试验已经开展。但 CRISPR 的脱靶性问题尚未得到完全解决。一旦 CRISPR 系统进入工作模式,科学家们此前一直没有办法干预其过程,只能任其操作至自然结束,其中可能会发生错误编辑非目标基因的情况,带来安全性隐患。

可喜的是,科学家们发现,求生的本能同样让噬菌体想出对策,进化出了针对细菌 CRISPR 系统的抑制蛋白,用来逃避细菌免疫系统的攻击。这些抑制蛋白被称为 ACR 蛋白。

杜德纳与同事此次研究的 AcrIIC1 和 AcrIIC3 便是其中两种。

AcrIIC1 和 AcrIIC3 是通过什么方式来对付难缠的 CRISPR 系统呢?杜德纳和同事发现,当 AcrIIC1 和 Cas9 蛋白相遇时,AcrIIC1 会紧紧结合 Cas9 用来抓取 DNA 的位置,从而使得 Cas9 无法捣乱。打个比方,这相当于给 Cas9 这把锋利的剪刀套上了外壳,无法再做出“剪”的行为。

不仅如此,AcrIIC1 可以抑制多种 Cas9 蛋白,具有广谱性。

相比之下,AcrIIC3 能发挥作用的范围要小,只能抑制一种 Cas9 蛋白。而且,和 AcrIIC1 不同,AcrIIC3 不结合 Cas9 蛋白,而是将两个 Cas9 蛋白拉拢在一起,改变它们的结构,从而使得 Cas9 对 DNA 无计可施。

值得一提的是,杜德纳并不是第一个发现 CRISPR 系统“关闭开关”的人。

在 2016 年 12 月,来自加拿大多伦多大学和美国马萨诸塞大学的科学家们首次 发现 了自然界隐藏的这类“关闭开关”。但当时,科学家们还不清楚,这些抑制蛋白是如何发挥“关闭开关”作用的。

数个月后,来自不同国家的两个科研小组先后通过解析蛋白结构是什么样的,来揭示抑制蛋白防守 CRISPR 系统的机制。其中就包括哈尔滨工业大学教授黄志伟的课题组。但他们所解析的和杜德纳此次解析的都为不同种类的抑制蛋白。

不久的将来,科学家或许就能找到最合适的“关闭开关”,不由 CRISPR 系统任性,为其安全性“保驾护航”。

参考资料:

Naturally Occurring Off-Switches for CRISPR-Cas9

A Broad-Spectrum Inhibitor of CRISPR-Cas9

来源:生物360

· END ·

▼ NGS接龙第二季精彩回顾(点击关键词即可阅读)

中科晶云  赵屹至本医疗  王凯 丨慧渡医疗  贾士东 丨 百世诺  刘哲 丨 中科院北京基因组所  胡松年 丨恒特基因  郑宗立 丨诺禾致源  成岗 丨 水母基因  赵南 丨 中科院计算所  于军 丨安可济  林盛榕 丨 亿康基因  陆思嘉 丨 华点云  张端阳

加入NGS接龙第二季,讲述你的NGS故事!


▼ 往期热文推荐(点击关键词即可阅读)

生殖健康基因检测 | 金域检验 | 合成酵母染色体 | Solexa GA装机十年 | DNA聚合酶 | 基因行业女神 | 癌症早筛及溯源 | 贝瑞和康上市 | 院士候选人 | NGS检测政策解读


▼ NGS接龙第一季精彩回顾(点击关键词即可阅读)

23GENEBANK 钱夔 | 深圳农业基因组研究所 黄三文 | 哈佛大学 刘小乐 | 上海睿昂 熊慧 为朔医学大数据 全雪萍 | 优迅医学 周晔 | 谱元科技 覃俊杰(上篇)/(下篇)赛默飞 柴映爽(上篇)/(下篇)上海伯豪 肖华胜 | 华中科技大学 薛宇 | 武汉未来组 汪德鹏(上篇)/(下篇)原国家基因库负责人 张勇 | 迈基诺 伍建 | 雅康博 许军普 | 圣谷同创 史荣 | 安诺优达 梁峻彬 | 奇云科技 罗奇斌 | 华大基因 王威 | 誉衡药业 吕强 |  华大基因 阿叁次仁 | 华大基因 杨爽 | 前华大科技微生物研究部总监 戴文魁 | 裕策生物 高志博 | 百迈客 郑洪坤 | 为朔医学大数据 郝占平 |  立迪生物 闻丹忆 | 瑞奥康晨 杨旭 药明康德 茅矛 | 海普洛斯 许明炎 | 元码基因 田埂 | 贝瑞和康 周代星(上篇)/(下篇)