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这个方向CNS主刊和大子刊都发了这么多了,国自然项目还不多,你上车了吗?

小张聊科研  · 公众号  · 科研  · 2025-02-21 21:00

正文

今天介绍的方向是 R-Loop ,这个方向这几年发了很多“大文章”,已经有好多篇主刊了:

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今天我们就先简单介绍一下 R-loop ,并梳理近 1 年来的代表性文章思路。

R-loop 是一种由 RNA-DNA 杂交链和一条被置换的单链 DNA 组成的三链核酸结构 。它在基因组中广泛存在。 R-loop 的形成主要有两种方式:顺式形成,即新生 RNA 在转录过程中与 DNA 模板链重新结合;反式形成,如非编码 RNA 与远处的 DNA 链杂交。

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研究发现, R-loop 在多种生物学过程中发挥重要作用。在 转录调控 中,它可以促进或抑制基因表达,例如通过影响染色质结构和 DNA 甲基化状态。在 DNA 复制和修复 过程中, R-loop 既是关键中间体,也可能导致 基因组不稳定性 。此外,异常的 R-loop 积累与多种疾病相关, 如癌症和神经退行性疾病

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下面我们盘点相关文章的研究发现:

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疾病与临床问题: ARID1A 突变与免疫检查点阻断治疗( ICB )的响应相关;

细胞与分子过程: ARID1A 缺失导致 R-loop 积累,产生细胞质单链 DNA 激活 STING 信号轴。

研究主要发现 ARID1A 缺失通过 R-loop 介导的 STING-I 型干扰素信号激活抗肿瘤免疫,其中 R-loop 对细胞的影响是 促进细胞质单链 DNA 积累

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疾病与临床问题: R-loop 异常积累导致 DNA 损伤和基因组不稳定;

细胞与分子过程: hTERT RdRP 活性调节 R-loop 形成。

研究主要发现 hTERT 的磷酸化形式( p-hTERT )通过与 TERRA RNA 结合来解除 R-loop 结构,维持基因组完整性 。其中 R-loop 对细胞的影响是 导致 DNA 损伤和基因组不稳定。

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疾病与临床问题: R-loop 异常积累导致基因组不稳定,与癌症等疾病相关;

细胞与分子过程: PCAF 通过组蛋白乙酰化促进 R-loop 的释放。

研究主要发现 PCAF 通过促进组蛋白 H4K8 乙酰化,招募 MRE11 EXO1 ,进而激活 Fanconi 贫血蛋白(如 FANCM BLM )来释放 R-loop 结构,维持基因组稳定性 。其中 R-loop 对细胞的影响是 破坏基因组稳定性,影响正常细胞功能

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疾病与临床问题: ALT 阳性神经母细胞瘤( NB )的治疗;

细胞与分子过程: METTL3 通过 m6A 修饰促进 TERRA R-loop 形成。

研究主要发现 METTL3 驱动 lncRNA TERRA 通过 m6A 依赖的 R-loop 形成靶向端粒,维持 ALT 阳性 NB 的端粒长度 ,其中 R-loop 对细胞的影响是导致端粒损伤

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疾病与临床问题: 晚期前列腺癌的生长抑制及化疗敏感性增强;

细胞与分子过程: IGF2BPs 通过 m6A 依赖的方式识别并稳定 R-loop

研究主要发现 IGF2BPs 通过稳定 m6A 修饰的 R-loop ,抑制 DNMT1 结合 SEMA3F 启动子,从而上调 SEMA3F 表达,增强多西他滨化疗敏感性 ,其中 R-loop 对细胞的影响是抑制细胞迁移和生长

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