专栏名称: 生物极客
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如何提取RNA-#大程给你讲分子克隆#【附第四版分子克隆提RNA部分详细内容】

生物极客  · 公众号  · 生物  · 2017-07-13 14:24

正文

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音频部分为大程讲解

提取RNA的实验中各个试剂的作用是什么?


用Trizol进行抽提,基本就是酸性酚抽提法。

RNA提取主要是内源和外源RNase

trizol中有酚和异硫氰酸胍,和B-巯基乙醇

trizol中有酚和异硫氰酸胍,和B-巯基乙醇

酚能使核蛋白质与核酸解聚(氯仿也可以),酚虽可有效的变性蛋白质,但是它不能完全抑制RNA酶活性,可以加入0.1%的8-羟基喹啉,与氯仿联合使用可增强对RNase的抑制。

异硫氰酸胍属于解偶剂,是一类强力的蛋白质变性剂,可溶解蛋白质,并使蛋白质二级结构消失,细胞结构降解,核蛋白迅速与核酸分离。

B-巯基乙醇主要破坏RNase蛋白质中的二硫键。


加入氯仿,虽然有变性蛋白质的作用,但是其主要用处是用来分相,实际上是加速有机相和水相的分层。一般的trizol试剂在4度下是油状悬浮液,提高温度,放置一段时间,自然也会分相。

上层水相,PH 5.1左右,当溶液pH在酸性的时候,DNA分子就会沉淀在酚与溶液的界面,只有RNA分子留在水相。而当pH接近中性时,DNA就会溶解在水相,(导致PH中性的大概原因是trizol与样品比例不对,应该尽量保证提取量的前提下使trizol过量)

氯仿还可以去除植物色素和蔗糖。在氯仿中加入少许异戊醇目的很简单,为了减少蛋白质变性操作过程中的气泡。

氯仿可以去除核酸溶液中的痕量的酚。


异丙醇沉淀,优点是容积小且速度快,主要沉淀DNA和大分子rRNA和mRNA,对5sRNA、tRNA及多糖不产生沉淀,所以RNA电泳的标志性三条带中5sRNA带很不清楚,未必是你的RNA降解。但是难以挥发出去。


最后的乙醇主要是洗涤异丙醇,也可以溶解一部分蛋白,痕量的乙醇很容易挥发掉。

附件第四版分子克隆详细protocol:














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