科研作图班课程安排
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日期
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时间
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内容安排
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第一天上午
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8:00-9:00
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软件安装
Origin, ImageJ, Adobe Illustrator, UCSF Chimera
。
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9:05-10:00
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Origin
数据导入,如何根据任何方程导入新数据,根据行与列进行统计分析,如每一列的均值
、
方差
、
均值方差等。
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10:05-11:00
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Origin
内数据的线性和非线性拟合,药物靶点结合竞争与非竞争性分析。根据任何已知方程对实验数据的模拟,柱状图和线型图制作及
error bar
画法。图与原始数据的对应。
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11:05-12:00
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Origin
数据图格式修改
、
颜色修改
、
数据区间修改
、
横坐标线性到指数修改
、
坐标轴大小设置
、
标记修改。
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12:00-13:30
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统一午餐
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第一天下午
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13:30-14:30
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Adobe illustrator
画图优势
、
画板概念
、
层(
layer
)概念
、
添加及删除画板和层
、
画板和层大小设置
、
画板内的分格。
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14:35-15:30
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Selection
和
direct selection
工具差别及使用
、
标准形状物体的画法
、
标准形状通过
pathfinder
整合成多样不规则形状物体
、
颜色样品板
swatches
设置
、
eyedropper
工具使用
、
pencil
与
pen
工具使用
、
颜色梯度使用。
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15:35-17:00
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Origin
图表如何导入
illustrator
、
图表在
illustrator
内的修改对齐
、
坐标轴粗细调整
、
标记重拍对齐
、
图表层内对齐
、
代表论文内的制图训练;细胞信号转导通路模式图和实验路线图制作。
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17:00-18:00
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基金标书与高分文章用的分子机理模式图的
制作
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晚上
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18:30-20:00
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作图实操串联加强训练
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第二天上午
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9:00-10:00
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ImageJ
界面介绍
、
识别格式,图像和小电影的保存,图像对比度调整
、
图像序列堆叠与解堆叠
、
堆叠图像到
montage
转换
、
去除和提取图像序列或者小电影中特定的一帧或者几帧图像
、
图像
crop
、
图像区间选取及强度面积计算
、
凝胶电影条带强度计算。
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10:05-11:00
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荧光显微镜照片标尺
scale bar
放置及大小设置
、
图像平滑处理及背景去除
、
plungin
的安装使用
、
time series
的分析
、
图像内任意切线的强度分布图。
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11:05-12:00
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ImageJ plugin
的介绍及
java
编写
imageJ plugin
简单介绍
、
循环操作如何生成
batch script
(群操作脚本语言)。
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12
:
00-13
:
30
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统一午餐
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第二天下午
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13:30-14:30
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蛋白结构解析方法介绍及如何用
UCSF chemira
显示蛋白结构、
PDF
文件格式及内容介绍、结构图像导出。
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14:35-15:30
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Snapview
软件演示,蛋白质数据库讲解及
pdb
数据格式介绍。
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15:35-17:00
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通过最新发表文章图讲解理解科研作图基本规则,不同类型文章图制作流程,如何
highlight
图上重要的区域或者数据点。
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PS:
务必携带电脑,要求windows系统。MAC请提前做好双系统或自己装好上课软件
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软件安装
Origin, ImageJ,Adobe Illustrator,UCSF Chimera, 3Dmax
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