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复旦大学IF10+的一区研究:多个热点结合如何做出新意?收下这份国自然申请的新方案!

i生信  · 公众号  ·  · 2024-09-25 16:09

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相信大家不难发现,多个热点结合是当前研究做出新意的突破方向。本期我们分享的 研究 涉及到三个 科研热点 :组蛋白乳酸化修饰、 RNA m6A 修饰以及细胞的铁死亡,这三个科研热点都是相对经典的主题了,近年的国自然项目如下:

组蛋白乳酸化

  • 树突状细胞中 STK40 通过糖酵解介导 组蛋白乳酸化 调控哮喘发生的机制研究

  • 基于 CD4+Treg 组蛋白乳酸化 修饰探究黄芩汤克服结直肠癌免疫治疗抵抗的作用机制

  • 组蛋白乳酸化 激活 ac4C 乙酰化促进葡萄膜黑色素瘤发展的作用机制研究

  • 肿瘤代谢产物 L-2-HG 调控 LDHA 乙酰化影响 组蛋白乳酸化 修饰促进肾透明细胞癌免疫逃逸的机制研究

  • 组蛋白乳酸化 修饰驱动 METTL3 参与镉诱导膀胱上皮细胞恶性转化的机制研究

m6A 修饰

  • METTL3 介导 PRSS22 m6A 甲基化修饰 调控巨噬细胞 M2 极化促进乳腺癌转移的作用机制

  • METTL3 介导 ECFCs 外泌体中 miR-194 m6A 甲基化 促进牵张成骨的机制研究

  • METTL3 介导 JunD m6A 甲基化 参与脂毒性损伤胰岛 β 细胞功能的作用及机制研究

  • VIRMA 介导 TRIM39 m6A 甲基化修饰 促进胃癌侵袭与淋巴转移的分子机制研究

  • 温郁金及莪术二酮类活性成分作用于 m6A 阅读蛋白 hnRNPA2B1 维持心肌铁代谢平衡抗心肌缺血再灌注损伤分子机制

铁死亡

  • 糖肾微宁方通过 SIRT3/HIF-1α 通路抑制肾小管上皮细胞 铁死亡 治疗糖尿病肾病的机制研究

  • 基于 ALDH2 探索解毒活血法防治心肌缺血再灌注后心肌细胞 铁死亡 的机制

  • 内皮细胞外泌体来源功能肽 EDEP1 通过 SLC47A1 调节脂质重塑并抑制 铁死亡 在缺血再灌注心肌损伤中的机制研究 Cav1/Nrf2/Hmox1 通路调节糖尿病心脏微血管内皮细胞 铁死亡 减轻心肌缺血再灌注损伤的机制研究

  • 基于神经血管单元探讨杜仲刺蒺藜组分药对调控 NTF3-GPX4 信号轴抑制 铁死亡 预防高血压缺血性脑卒中的机制研

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今天我们介绍一项由 复旦大学附属中山医院麻醉科研究团队 主导完成,近日发表在 Redox Biology 期刊( Q1, IF=10.7 )上的研究: Histone lactylation-regulated METTL3 promotes ferroptosis via m6A-modification on ACSL4 in sepsis-associated lung injury .一起来看看他们是如何把这3个热点结合起来,讲好故事的吧 ~

该研究探讨了 乳酸调控的组蛋白乳酰化如何通过调控 METTL3 介导的 m6A 修饰影响脓毒症相关的急性肺损伤( acute lung injury ALI )中的铁死亡过程 。乳酸作为一种损伤因子,通过促进组蛋白 H3K18la METTL3 启动子位点的结合,提高了 m6A 修饰水平,进一步通过 YTHDC1 依赖的通路影响 ACSL4 的稳定性,从而促进了线粒体相关的铁死亡。

研究的作用信号轴: GPR81/ 乳酰化 -METTL3-YTHDC1-ACSL4 在脓毒症相关肺损伤中的作用。

研究团队如何围绕研究主题探索作用信号轴?

团队首先抑制 GPR81 信号通路,发现该通路的阻断可以抑制乳酸诱导的 METTL3 上调,进而影响铁死亡信号,提示 GPR81 信号在乳酸诱导的铁死亡中发挥作用。随后,进一步探索 METTL3 的上游信号,验证了乳酸通过 GPR81 信号调控 METTL3 表达的过程。此外,团队还通过多种实验手段包括 RNA 测序、 siRNA 转染技术、斑点印记、免疫印迹实验、免疫共沉淀技术等全面探究了 METTL3 ACSL4 稳定性及铁死亡过程中的调控作用。


研究的 3 主要科学问题

问题 1 乳酸与脓毒症相关急性肺损伤之间有什么关联?乳酸如何影响铁死亡过程?

研究团队发现, ALI 患者 外周血炎症 因子水平明显升高,血清乳酸水平与血浆炎症因子浓度呈正相关。模拟临床脓毒症的盲肠结扎和穿刺 (CLP) 小鼠模型实验结果表明, CLP 组小鼠多器官出现炎症浸润,肺组织出现明显炎性渗出和组织水肿;用 2-DG 或草氨酸治疗的 CLP 组小鼠全身炎症减轻。上述结果提示: 抑制乳酸可有效改善脓毒症小鼠的全身炎症,减轻脓毒症相关肺损伤。

1 抑制乳酸可减轻脓毒症相关的肺损伤

进一步的, RNA-seq 结果与 GESA 分析 显示, CLP 小鼠肺组织中与铁死亡相关的基因显著富集。 RT-qPCR 、免疫印迹和免疫组织化学分析 结果显示, CLP 小鼠肺组织中 GPX4 显著下调, ACSL4 显著上调。乳酸会增加细胞内的 亚铁离子和 ROS 水平, 应用乳酸生成抑制剂 2-DG 和草氨酸钠时, CLP 组小鼠肺组织中亚铁离子浓度的上调受到抑制。 透射电子显微镜( TEM 结果显示, CLP 后小鼠肺组织中的线粒体出现了明显的铁死亡特征性改变,表现为线粒体萎缩、嵴变小, 乳酸抑制剂 可以保护线粒体。 综上所述,乳酸能够在体外诱导细胞发生铁死亡。

2 肺脓毒血症中,乳酸诱发铁死亡

蛋白印迹显示 CLP 小鼠肺组织中 泛赖氨酸乳酸化 (pan-Kla) 水平增加,组蛋白乳酸化显著上调。研究结果显示 CLP 小鼠肺中 p300 (赖氨酸乙酰化酶,可催化乳酰基从乳酰辅酶 A 转移到组蛋白)和 CREB 结合蛋白 (CBP) 表达增加, 乳酸通过 p300/CBP 依赖机制诱导肺泡上皮细胞乳酸化增加

3 乳酸诱导 ALI p300 介导的乳酸化修饰增加

问题 2 m6A 修饰与脓毒症肺损伤之间关联 METTL3 介导的 m6A 修饰调控铁死亡的机制是什么?

使用 斑点印迹法 比色 ELISA 定量小鼠肺组织 m6A 甲基化 RNA 水平,结果显示脓毒症小鼠肺组织中 m6A 显著上调; RNA-seq 分析 显示 m6A 修饰在脓毒症肺损伤发展中的重要作用。

敲低 METTL3 后, m6A 修饰被抑制,表明 METTL3 是乳酸介导的 m6A 修饰的关键调控因子 RT-qPCR 与免疫印迹 分析显示乳酸促进 ACSL4 表达, Me-RIP qPCR 分析表明乳酸上调 ACSL4 m6A 修饰;敲低 METTL3/YTHDC1 后,乳酸诱导的 ACSL4 上调得到恢复, GPX4 蛋白 表达下调被逆转,乳酸引起的细胞活力抑制被减弱。

这些发现揭示 METTL3 通过 YTHDC1 依赖性通路促进 ACSL4 m6A 修饰、稳定 ACSL4 ,从而加剧乳酸诱导的肺上皮细胞铁死亡。

4 乳酸 /H3K18la 轴上调 METTL3 并增加 m6A 修饰

5 METTL3 介导的 ACSL4 增加会诱导 ROS 积累和线粒体依赖性铁死亡

6 靶向 METTL3 可通过减少铁死亡来减轻脓毒症引起的肺损伤

问题 3 GPR81 信号通路如何调控 METTL3 表达及铁死亡过程?

GPR81 信号传导激活 METTL3 、促进 ACSL4 表达增加,诱导 ROS 积累,促进细胞铁死亡;下调 GPR81 时,乳酸诱导的 METTL3 激活和铁死亡过程受到抑制。

7 GPR81/METTL3/YTHDC1 轴通过 m6A 修饰调节 ACSL4 mRNA 稳定性,调节乳酸诱导的铁死亡。

研究亮点

1. 揭示了乳酸通过组蛋白乳酰化调控 METTL3 在脓毒症相关急性肺损伤中诱导铁死亡的全新分子机制。

2. 提出并验证了 GPR81/ 乳酰化 -METTL3-YTHDC1-ACSL4 信号轴作为治疗脓毒症相关肺损伤的潜在靶点。

3. 确立了乳酸在病理生理过程中作为信号分子和代谢物的双重作用,并探讨了其在炎症及细胞死亡中的具体功能。







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