细心的小伙伴,应该看到在官网的
课题/国自然板块
,新增了3个工具:
Idealgnit高分选题、细胞系/动物模型查询助手,和实验方案设计助手。
很多基础研究的同学,课题开始的第一步,选题就蒙了,不知道研究啥,无从下手。这个时候就可以使用
Id
eaIgnite高分选题
来锻炼下发散思维。
高质量的文献,可以帮助我们获得发散思维,和开拓课题思路。比如Nature上发现了一个新的肿瘤耐药基因,那针对这个基因和其他已知基因/通路作用关系的课题就可以被开展。
再比如,文献里研究了生物学功能,那是不是就可以联想到相关的生物学功能也可以研究呢。
这个工具可以根据最新发表的
CNS文献
,也可以
上传文献
,总结
潜在的、新的
课题思路,同时查看每个思路在
已有文献
的发表情况,如果没有被报道过,那恭喜你
。
选好题了,比如
“SALL2基因缺失诱导乳腺癌内分泌耐药的分子机制”
,但又有同学开始懵了,这实验该怎么设计呢?
这个时候就可以使用
实验方案设计助手
了,直接题目扔进去就行,直接给出
研究内容,实验方案,高分建议,和思维导图
,思维导出直接导出了,可以做组会报告了
1.研究内容:
1. 首先,需要确定SALL2基因缺失与乳腺癌内分泌耐药之间的关系。可以通过对乳腺癌患者样本进行基因组测序,比较SALL2基因在耐药和非耐药乳腺癌患者中的表达水平差异。
2. 接下来,需要确定SALL2基因缺失对乳腺癌细胞内分泌耐药的影响。可以选择具有不同SALL2基因表达水平的乳腺癌细胞系,通过细胞增殖实验、细胞周期分析和细胞凋亡检测等方法,评估SALL2基因缺失对乳腺癌细胞内分泌耐药的影响。
3. 进一步,需要探究SALL2基因缺失对乳腺癌细胞内分泌耐药的分子机制。可以通过转录组测序和蛋白质组学分析等方法,比较具有不同SALL2基因表达水平的乳腺癌细胞系中基因表达和蛋白质表达的差异,寻找与内分泌耐药相关的信号通路和分子机制。
详细实验方案:
实验目的1:确定SALL2基因缺失与乳腺癌内分泌耐药之间的关系
实验设计:
1. 收集乳腺癌患者样本,包括耐药和非耐药患者。
2. 提取样本中的RNA,进行基因组测序。
3. 对测序数据进行比对和分析,比较SALL2基因在耐药和非耐药患者中的表达水平差异。
4. 使用统计学方法验证差异的显著性。
所用材料和仪器:
1. 乳腺癌患者样本
2. RNA提取试剂盒
3. 基因组测序仪器
4. 生物信息学分析软件
实验目的2:确定SALL2基因缺失对乳腺癌细胞内分泌耐药的影响
实验设计:
1. 选择具有不同SALL2基因表达水平的乳腺癌细胞系。
2. 分别将这些细胞系分为实验组和对照组。
3. 对实验组和对照组的细胞进行细胞增殖实验,比较细胞生长曲线和增殖速率。
4. 对实验组和对照组的细胞进行细胞周期分析,比较细胞周期的分布情况。
5. 对实验组和对照组的细胞进行细胞凋亡检测,比较细胞凋亡率。
所用材料和仪器:
1. 具有不同SALL2基因表达水平的乳腺癌细胞系
2. 细胞培养基和培养器具
3. 细胞增殖检测试剂盒
4. 流式细胞仪
实验目的3:探究SALL2基因缺失对乳腺癌细胞内分泌耐药的分子机制
实验设计:
1. 选择具有不同SALL2基因表达水平的乳腺癌细胞系。
2. 分别对这些细胞系进行转录组测序和蛋白质组学分析。
3. 对测序和分析结果进行差异基因和差异蛋白的筛选和注释。
4. 对差异基因和差异蛋白进行功能富集和信号通路分析,寻找与内分泌耐药相关的分子机制。
所用材料和仪器:
1. 具有不同SALL2基因表达水平的乳腺癌细胞系
2. RNA提取试剂盒
3. 转录组测序仪器
4. 生物信息学分析软件
5. 蛋白质提取试剂盒
6. 质谱仪