环球视野,深度视角
马上美国的AGBT要开了,测序圈很热闹。
Element Biosciences掏出了他们家的AVITI24,口号是“High Dimensional Biology”。
意思很明确,管你几维,我高维就完事了。
华大智造很实在,AGBT就是发新品的好时候嘛,看这图很明显,又要发新测序仪了。
具体就不猜了...算算时间也该是那位了。
不过,今天的主角是Illumina因美纳。
作为老大哥,他怎么会缺席呢?
2025年2月19日,在美国AGBT(Advances in Genome Biology and Technology)年会前夕,Illumina突然宣布:
进军空间生物学!
呃,这怎么说呢,有句话叫“好菜不怕晚”。
但是,在空间生物学领域Illumina发力的也实在是太晚太晚了。
甚至,有人都等不及“帮”Illumina做好了方案。
比如,来自比利时VIB的一个团队就基于NovaSeq S4测序芯片进行了“魔改”实现了空间转录组测序。
简单的说,就是在S4芯片上加载Oligo作为地址标签,这包括一个32bp的UMI序列和能够捕获RNA的序列,测序后芯片被切开用以加载组织并捕获其中的RNA。
(以上抄袭自我是建设者公众号,感兴趣的可以看下,
链接放这里
,里面还有不少“魔改”方案)
是不是很眼熟?跟华大的Stereo-seq类似啦。
作为根正苗红的Illumina,倒是老神在在,丝毫不急。
一直等到2025年,才端出来这盘菜。
那么,这盘菜怎么样?
据悉,这款空间生物学产品有两种不同捕获面积的芯片。
能够捕获多达30000-40000个转录本,分辨率达到1um。
其中1款芯片的捕获面积为15mmX50mm(1.5cm*5cm),单个细胞捕获转录本600-1000个。
这个捕获面积。
而10x Genomics的Visum HD捕获区域为6.5mmX6.5mm(有2个捕获区域),分辨率为2umX2um。
算算数,Illumina宣传稿说的似乎没错。
9倍的捕获面积,4倍的分辨率。
不过,是不是忘了中国还有个华大啊亲。
咱能不能有点全球视野...
人家最大能干到13cmX13cm啊...500nm分辨率啊...
就算这超大尺寸的不是一般人能玩的,那么常规的Stereo-seq捕获面积也有1cmX1cm的。
由此可见,选择对标很关键。
定睛一看,擦,2026年上市。
期货啊!
散了散了。
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相关资料:
注1:https://www.illumina.com/company/news-center/press-releases/press-release-details.html?newsid=10a7ec49-da37-40d8-8aff-0e8e149b9534
注2:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2667237524002042?via%3Dihub
注3:https://www.genengnews.com/topics/omics/illumina-unveils-spatial-technology-days-before-agbt-meeting/