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怎么从NCBI上批量下载基因序列

VG生信软件 · 公众号 · · 2017-07-12 16:06

正文

少量的基因序列下载再简单不过，直接进入NCBI主页，点击数据库，输入AC号或GI号，点击下载就OK了。

如果需要大批量下载数据，又需要指定的AC号或GI号序列，这时候就要借助到一些生物软件工具了。在这里，小编告诉你，不用为选择那一款软件烦心了，在NCBI上就有自带的Batch Entrez,只需3步就能完成基因序列大批量下载，操作步骤如下，有必要的可以收藏！

首先做好准备工作，创建一个需要下载的序列如AC的列表文件，每行一个独立的AC号，保存为文本文件。
打开链接：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/batchentrez 如下图所示：
点击“浏览”，选择事先准备的带AC的文本文件，点击“Retrieve”开始检索，数秒后即可返回检索的序列记录。
点击检索到的“Retrieve records for 48 UID(s)”序列记录即可，点击send to,保存要下载的序列，下面的步骤就不一一说了。