铜死亡生信分析课程上新

额，这个太新，距离烂大街还有很大的空间。那么这个热点就有学习的空间。

生信人目前已有多篇铜死亡文章发表的经验，但是觉得这个方向可以做的还很多，于是录制了这个培训课程。希望大家都能蹭到最新的热点，然后多发paper。

铜死亡分型降维+单细胞分析思路

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那么问题来了，铜死亡有什么生物信息可以发挥的思路吗。

当然，之前生信人公众号就推荐过六大切入方式。

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基于某个基因集合的分子分型可以很好的关联临床，同样是非常经典的思路。当然与思路一的区别在于分析内容相对较多，书写起来相对难一点。不过如果结果很好的话，是有机会冲高分的。同样以铁死亡和细胞焦亡为例，我们可以看到两篇文章都在8分以上，并且来自于同一个杂志。既然编辑愿意接收，那我们换一个死亡方式为什么不试试呢？

单细胞虽然风头不再，但是目前还是文章很好的加分项。以铁死亡为例，我们可以看到，单纯的单细胞数据挖掘或者联合bulk RNA数据，能够轻松做到6-7的水平。只不过与前两个比起来，分析难度提升了不少。

针对某个基因集合的泛癌刻画现在已经趋于成熟了，基本上只要基因集合挑得好，连单细胞数据都不用加就能做到10以上。从去年的两篇文章我们可以看到，审稿人对这种形式还是非常愿意接收的。

非编码RNA其实都不用多说，前几天为大家介绍的铁死亡lncrRNA是能够发到Nature Communications的。不过目前不建议从非编码RNA的角度切入，毕竟到时候可能不好找证据来证明其调控作用。

FerrDB这个数据库相信大家都知道，铁死亡研究利器。虽然现在铜死亡的概念刚提出，但是如果想冲击一下16分的NAR，现在就可以开始收集文章了。不过这个活周期较长，比较磨人，如果人手不足不建议轻易去尝试。

各位爷，今天来着了，生信人按照肾透明细胞癌为例，录制了常规转录组+单细胞的常见分析思路和讲解，大家可以试着操作下，这个铜死亡方向，换个分组就能继续。希望大家23年多蹭热点，多发paper。

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撰稿小编｜SXR

图文排版｜CY

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