背景
2021年11月26日,世界卫生组织(WHO)正式将新冠病毒突变株B.1.1.529升级为令人担忧的突变株(Variant of Concern, VOC);其系统命名定为Omicron。
VOC是目前病毒监测系统中最高级别,也是最危险的突变株;上一个被纳入VOC的是给人类造成巨大危害的Delta突变株。
B.1.1.529突变株最早于2021年11月11日在非洲南部的博兹瓦纳发现,3天后即在南非的Gauteng省迅速蔓延。进入到11月份之后的短短两周内,B.1.1.529突变株的检测阳性比例就由1%上涨到30%!
Delta变种如果要达到类似感染比例需用时100天左右。
流行病学家通过使用
R值
(每一次感染传播的平均新病例数)来衡量流行病的增长。11月末,位于约翰内斯堡的南非国立传染病研究所(NICD)对豪登地区的R值进行了分析,结果发现该地区的R值高于2。
而上一次观察到这种增长水平还是在COVID-19大流行的早期。
这表明Omicron有可能传播得更快,感染的人数比德尔塔病毒多得多。
根据COVID-19病例的增加和测序数估计,在同一时期Omicron感染的人数是德尔塔的3至6倍。
著名的疾病建模科学家Weiland估计B.1.1.529突变株的传染性比原始毒株高500%,相对比Delta突变株的传染性可能比原始毒株高70%-200%。
B.1.1.529突变株突变株的Spike(S蛋白)
有32个突变,是目前突变株中S蛋白突变最多的
;相对比的是,Delta突变株在S蛋白上有9个突变。其与Delta和Alpha突变株有多处重合,因此该突变株可能有复制能力增强的特征。它的Furin切割位点附近有H655Y + N679K+P681H突变,也可能增强病毒复制能力和感染力。
这是为什么B.1.1.529突变株有高传染性特征。
Jeffery Barrett博士列出了这些突变,
其中红色意味着不好,B.1.1.529有9个
,其中P681R尤其令人担忧。紫色意味着新的突变,且实验室数据显示有威胁。黄色意味着这些突变位置很重的,但科学家还不知道其生物学特征。蓝色表示需要更多证据来验证。绿色表示这些突变已被验证过,不需要担心。其中Omicron综合了前几个VOC的关键突变:
即N501Y
(增强刺突蛋白与受体ACE2的结合能力);P681H和N679K(furin切割位点附近发生突变,能让刺突蛋白更容易被切割,从而增强病毒的感染能力);Beta的E484(免疫逃逸突变,导致RBD不被中和抗体识别)及Delta的T478K。
目前结合南非方面提供的住院数据来看,南非豪登省Omicron爆发中心的医院中,在12月2日之前接受COVID-19治疗的42人中,70%不需要吸氧;而在需要吸氧的患者中,有9人出现肺炎,其余4人因与COVID-19无关的潜在疾病而需要吸氧。
整体来看,Omicron整体症状为轻症和无症状感染者为主,但仍需继续追踪更多样本来判断,当下可以确定是Omicron传播能力极强。
而12月6日的南非COVID-19最新统计指出病死47人,ICU新增30人,呼吸机辅助呼吸增加了16人。随着新增病例的增加,南非的病重和病死人数已经出现增长。把新增病例、住院病例和病死病例放在一起看时,
可以看到Omicron极快的蔓延,病例数快速增长,住院数已经开始增长,但病死人数尚变化不大。
总的来看,住院和病死数据会滞后于新确诊病例,不过对比来看,南非Gauteng省经历24天Omicron突变株传播呈现的症状会比Delta突变株和原始病株更轻。此外也有学者指出因COVID-19的重症和病死与年龄最相关,而南非人口结构较为年轻。
但最需要警惕的是Omicron免疫逃逸更明显,传染性更强,导致感染者上升,从而病重的病死的绝对数更多。
根据不可能三角理论
,病毒的传染性,毒性,适应性不可能同一时间达到完美。
如高传染就很难高毒性,因高传染病毒带有高毒性,可能宿主还没有传播出去就死亡了。
基于Omicron高感染性和南非住院数据来看,
主流看法将Omicron是大号流感,但突变过多导致对当前疫苗和抗体类治疗方式发生免疫逃逸情况发生。
但在2021年11月27日,Cell杂志发表了一份关于COVID-19研究论文,报道了COVID-19引发ARDS(急性呼吸窘迫综合征)的机制,
发现部分患者有显著的肺纤维化特征,而流感是不会导致纤维化。