目的:
构建头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)免疫相关基因预后指数(IRGPI),阐明 HNSCC 中由IRGPI定义的亚组的分子和免疫特征以及免疫检查点抑制剂(ICI)治疗的获益情况。
实验设计:
基于癌症基因组图谱HNSCC免疫数据集(n = 546),通过加权基因共表达网络分析确定了22个免疫相关枢纽基因。使用Cox回归方法确定了三个基因来构建IRGPI,并使用基因表达综合数据库(GEO)数据集(n = 270)进行验证。随后,分析了由IRGPI定义的亚组的分子和免疫特征以及ICI治疗的获益情况。
结果:
IRGPI基于SFRP4、CPXM1和COL5A1 基因构建。IRGPI高的患者总体生存期优于IRGPI低的患者,这与GEO队列中的结果一致。综合结果表明,高IRGPI评分与DNA修复相关通路相关;TP53突变率低;CD8 T细胞、CD4 T细胞和 M1巨噬细胞浸润高;免疫活跃且表型侵袭性较低;从ICI治疗中获益更多。相反,低IRGPI评分与癌症和转移相关通路相关;TP53和PIK3CA 突变率高;B 细胞、M0巨噬细胞和M2巨噬细胞浸润高;免疫抑制且表型更具侵袭性;从ICI治疗中获益较少。
结论:
IRGPI是一种有前景的生物标志物,可用于区分HNSCC的预后、分子和免疫特征以及从ICI治疗中获得的免疫益处。