第6个春天来了，苹果树依然没开花。
这一次，木村被彻底击倒了。痛苦万状之际，他想到了死。一个月圆之夜，他拿起绳子，向附近的一座山上走去。他把绳子往树枝一扔，不料用力过猛，绳子飞了出去，木村走下山坡去捡绳子。
突然，他发现了一棵奇异的苹果树。“整棵树都在发光，仿佛是在叫我看它。”木村放下绳子，冲到那棵树跟前。“原来不是苹果树，而是一棵野生橡树。”野橡树没喷洒农药，树叶却非常茂盛。不是这一棵，树林里的树都无比茂盛。“没用农药，为何虫子和疾病不侵害它？”木村呆立树前，痴痴地想。
突然，他闻到一股浓浓的异味，拨开齐肩杂草，抓起一把泥土。“非常松软，有股刺鼻的异味。”而他果园的土壤是坚硬的，没有任何异味。木村振臂欢呼：“我终于找到答案了。”
“大自然中没有任何生命体是孤立的，各种生命互相联系，相互支援，树下的杂草为树提供了肥料，土壤中的微生物使土壤保持松软，各种微量元素源源不断从土壤输送到树木根部。橡树底下泥土中那股刺鼻的气味，后来我检测，来自一种放线菌，它可以吸收并贮存空气中的氮。”
木村以前一味在乎树之叶，却完全忘了树之根。“以前以为是病虫害导致苹果树衰弱，以为只要排除这些，果树就能恢复健康。事实上并非如此，病虫害只是结果。果树失去天性的坚强，才会招致病虫害。”
“我应该为苹果树找回大自然的感觉，而不是将它与大自然隔离起来。”一棵野生橡树，让绝望的木村彻底开悟。
第二天，为证实“开悟”的正确。木村再次来到野生橡树旁。他观察橡树周围，所有生物在这里自然生长，他们和周围的无机物一同构成橡树的生存环境，让它得以生长。“我终于找到了正确的密码。”
检测比较各种野生环境土质后，木村为苹果园引进了各种杂草。
第7年，当杂草长出来后，苹果树的树叶第一次停止了掉落。夏季，其他果园土壤表面温度达到35，“我的杂草果园，却只有22度。”其他果园需要经常浇水，“我的完全不用，杂草维系了土壤水分。”
木村开始在果园里大量撒大豆，“大豆可以固定空气中的氮，种豆可以让土壤变得肥沃。夏天，大豆长高了，我发现根部长满了根瘤菌。秋天，我再度拔起观察，发现根瘤菌消失了。根瘤菌把氮渗入土壤，为它提供养分。”
