食品生产许可申请人应当遵守国家产业政策，执行《国务院关于发布实施的决定》（国发[2005]40号）、《国务院关于实行市场准入负面清单制度的意见》（国发[2015]55号）、国家发展改革委关于《产业结构调整指导目录》有关规定以及质检总局、国家发展改革委《关于工业产品生产许可工作中严格执行国家产业政策有关问题的通知》（国质检监联[2006]632号）。各省在产业政策执行方面存在争议的，报省级人民政府协调解决。
2关于出口加工区内食品生产企业及仅以出口为目的食品生产企业取证问题。
根据《中华人民共和国食品安全法》、《出口加工区加工贸易管理暂行办法》（商务部2005年第27号令）有关规定：
出口加工区内食品生产企业无需申请办理食品生产许可证。
出口加工区外的食品生产企业仅以出口为目的，无需申请办理食品生产许可证。
如果食品生产企业所生产的食品在国内销售，应当依法取得食品生产许可证。
3关于农民专业合作经济组织能否作为食品生产许可申请主体问题
根据《农民专业合作社登记管理条例》（国务院令第498号），农民专业合作组织可以经登记机关依法登记，领取农民专业合作社法人营业执照，取得法人资格。
因此，农民专业合作组织可以作为食品生产许可申请主体，以营业执照载明的主题名称作为申请人的名称。
对于外设仓库的监管，食品生产者所在地行政许可机关做出准予许可的决定后，应将外设 仓库相关审查材料通报食品生产者外设仓库所在地食品药品监督管理部门，由其纳入日常监督检查范围，强化日常监督管理。食品药品监管部门应将用于贮存即将入厂查验的食品生产原辅材料外设仓库和用于贮存出厂检验成品的第一道外设仓库作为 监督检查重点。
原食品生产许可审查细则未明确的食品品种且《食品生产许可分类目录》中食品明细未包含的食品品种，食品药品监管部门可以根据产品的产品属性、工艺特点、生产要求等，按照相类似产品审查细则及相关食品安全标准制定审查方案， 组织进行审查。
各地在实施食品生产许可工作中，应当采集食品生产者执行标准有关信息，并纳入许可管理系统和许可档案中妥善保存，以便日常监督管理中予以对照检查，但在其许可证书上无需载明标准信息。
食品生产许可证超过有效期限、被撤回、被吊销或者被撤销的，食品生产者应当依法办理食品生产许可注销手续；未办理注销手续继续开展食品生产活动的，视为未取得食品生产许可从事食品生产违法行为。
《食品生产许可管理办法》第三十四条规定：食品生产者需要延续依法取得的食品生产许可有效期的，应当在该食品生产许可有效期届满30个工作日前，向原发证的食品药品监督管理部门提出申请。
食品生产许可有效期届满前不足30日提出申请的，按重新申办食品生产 许可受理，有效期届满前无法做出许可决定的，企业应当在许可有效期届满后停止生产，待许可机关做出准予许可决定后方可恢复生产。
重新办理的食品生产许可证编号可沿用原许可证编号。食品生产许可证有效期届满后再提出申请，视为重新申办食品生产许可。
4关于“QS”及“XK”编号证书更换“SC”编号证书有关问题
食品生产者在2015年10月1日后取得食品生产许可，证书编号仍为“QS”及“XK”编号证书的，各地食品药品监管部门应督促企业在2018年10月1日前将所持证书更换为“SC”编号证书。 2018年10月1日起，食品生产者生产的食品不得再使用原包装、标签和“QS”标志。
食品生产者持有多张旧版食品生产许可证的，按照“一企一证”的原则，换发新版食品生产许可证时，如果不是同时换发，后换证的食品类别应当按照变更进行申请，发证日期为食品药品监管部门做出变更许可决定的日期，有效期与首次发放的“SC”编号证书一致。
获证食品生产者因季节性或其他原因停产半年以上的，恢复生产时应当向负责实施日常监管的食品药品监管部门报告，由食品药品监管部门开展一次日常监督检查。
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