科研必读：从零开始做医学基础科研，发 SCI 文章

科研工作这个领域 虽然开放性比较好，但是十几年科研经历总结下来的经验和套路多数人是不愿意分享的，因为教会徒弟，饿死师傅，与其传授给别人，不如自己守着多年总结的经验刷出几十篇文章，看着别人挣扎，这就是现实。

所以大家渴望这些经验和套路的总结， 今天我们就把这些套路进行梳理和总结。 一个从临床问题出发的基础课题，一般来说包括：临床、细胞、动物和机制四个部分。

临床部分大家最为熟悉，平时接触到大量的病例信息，最关键的实验材料——样本也是很容易拿到的，所以只用临床的样本和资料也可以发文章，问题在于怎么做才能把文章发到最高，以及能发几篇文章。现总结 程咬金的三板斧： 差异+相关+预后或者诊断，逻辑基础就是相关。

第一步差异 ：就是明确实验组和对照组的差异因素，这里的因素可以是基因分子也可以是某个我们干预的措施，也就是说某个因素伴随着疾病的发生发展有变化；

第二步相关 ：就是这个因素与疾病其它因素相关性，比如某个蛋白在动脉粥样硬化发病时表达升高，那这个蛋白是否与血脂含量有关，因为血脂含量是动脉粥样硬化的危险因素，如果两者显著相关，这个蛋白与动脉粥样硬化的关系就更进一步了，因为可能存在蛋白——血脂含量——动脉粥样硬化这样的发病机制。

第三步预后或者诊断 ： 最后我们要考虑的就是这个蛋白作为疾病诊断和预后标志物的表现，我们常用 ROC 曲线来评价这个指标的灵敏度和特异性，用生存分析和单/多因素 COX 分析来看这个指标是否可以独立的指征患者预后。

差异+相关+预后/诊断，这个就是临床层面研究的基本套路，我们可以看到成百上千篇这样的文章，分数有高有低，高的 5 分+，低的 1 分，最常见的一个主题就是分子标志物。影响分数的因素有很多，样本量、创新性、结果好坏、分子和杂志的选择等等。

三步走： 选细胞+因素干预+表型检测，做研究多了后会把这三个步骤固定下来，变化的是因素，即所有的四个层面都会遇到的关键问题：如何选择要研究的分子，这个问题视频课程中详细说。

选细胞： 一个疾病的病因太多了，所以我们选择细胞的时候就要考虑从哪个角度展开了，比如研究肿瘤的时候我们可以选择肿瘤细胞，微环境中的细胞（比如肿瘤相关成纤维细胞CAF），也可以选择免疫细胞，大家最常选的是肿瘤细胞，做多了以后就会把其它的可能性忽略了，以至于看到有人研究CAF、TAM的时候认为很新，其实这是思维角度的局限。

因素干预 ： 选好细胞以后，干预的因素这点大家最为熟悉的就是基因沉默、过表达，方式是siRNA和shRNA，只此一点同样会遇到很多问题，比如基因的干扰效率很低，干扰后RNA表达有差异，蛋白表达没有差异等等。