我的博士生师兄说他对于线粒体代谢课题手到擒来！但他看了这篇SCI文章后，就不再回我微信了，也不知道他是咋了……优秀的文章，都是从现有的线索开始，逐步推理，然后形成完整的理论（Theory），这个推理的过程是一般使用所谓科研套路的文章替代不了的（
科研的推理过程，需要通过假设，并在得到一定的结果后，对假设进行不断迭代，才能获得的，而所谓的科研套路，只是一种欠拟合模型，不清楚科研推理以及科研套路的话，可以去看看《科研的推理和逻辑：从实验台到咖啡桌》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼？》系列
）。今天讲的这篇文章，是中山大学孙逸仙纪念医院的博士生发表在11.4分的Journal of Advanced Research上的文章，讲的是CAFs（肿瘤相关成纤维细胞）和PCa（前列腺癌）细胞之间的互作，通过诱导PCa细胞线粒体和有氧呼吸的增强，促进了肿瘤细胞的化疗耐药性。我们就来看看他们都是怎么通过推理和假设迭代，一步步做出这篇文章的吧：
首先他们提出一个假设，假设CAFs能与PCa细胞之间产生Crosstalk的一个细胞间的互作，也就是细胞间的通讯（
提出假设是一个课题产生的关键，这个假设必须是可以证伪的，也就是可以验证的，且需要验证的命题相对来说不能有太多复杂因素参与，这里的假设就只涉及了CAFs和PCa细胞，不清楚如何提出假设的话，可以去看看《科研的推理和逻辑：从实验台到咖啡桌》
），通过使用CAF-CM（肿瘤相关成纤维细胞的培养基）来孵育PCa细胞系，他们发现CAF-CM和PCa细胞孵育后，会导致PCa细胞的增殖增强：
那么从这个实验，可以得到什么样的结果呢？首先是CAFs能影响PCa细胞，其次是，CAFs影响PCa细胞的关键，在于CAFs的分泌产物，可能是通过旁分泌或者细胞代谢产物引发的PCa细胞增殖。那么，PCa细胞在受到了CAF-CM影响后，产生了什么变化呢？他们通过SeaHorse实验发现，受到CAF-CM影响后，PCa细胞的有氧呼吸增强了（
下图的OCR图，就是反应细胞有氧呼吸变化的，通过中间加入了解偶联剂后及加入鱼藤酮和抗霉素前产生的峰，来判断细胞氧化呼吸的能力，这个在《信号通路是什么鬼？》系列的铜死亡那几章中，也给大家解释过，不清楚的话，可以回去复习下
）。那么有氧呼吸是为什么会产生的呢？：
他们通过电镜及线粒体荧光定位后发现，在CAF-CM处理后PCa细胞的线粒体数量明显增多。而通过筛选发现，CAF-CM处理后，PCa细胞中线粒体生成相关的基因PGC1α的表达明显增加。但在敲减了PGC1α后，PCa细胞的线粒体不再受CAF-CM处理影响而增多（
这个验证方法，其实就是柯霍氏法则的验证，但是这里有一点并不严谨，就是作为线粒体生成相关的基因PGC1α，在这里通过直接敲减，来分析CAF-CM处理后对线粒体的影响，其实这里犯了肯定后件的逻辑谬误，不清楚柯霍氏法则的验证以及肯定后件逻辑谬误的话，可以去看看《科研的推理和逻辑：从实验台到咖啡桌》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼？》系列
）。
既然找到了可能与线粒体生成相关的蛋白PGC1α，就需要将CAF-CM处理与PGC1α表达关联起来，于是他们就通过质谱分析了CAF-CM中潜在的能与PGC1α表达关联的蛋白。他们发现在CAFs及CAF-CM中，ANGPTL4的表达明显增多，这是一个配体，其受体是IQGAP1。而在使用ANGPTL4后，可以增加PGC1α的表达，同时会促进IQGAP1可以与c-Raf、MEK以及ERK1/2结合（
熟悉MAPK信号通路的话，应该知道c-Raf、MEK以及ERK1/2都属于MAPK信号通路的一个分支，通过激活ERK1/2激活该通路起到最终的作用，不熟悉的话可以去看看《信号通路是什么鬼？》系列复习下
），他们在这里想要试图解释的是ANGPTL4通过激活c-Raf-MEK-ERK1/2，影响了PGC1α的表达。同时在分别敲减了肿瘤细胞的IQGAP1、ERK1/2和PGC1α后，都对肿瘤细胞的有氧呼吸造成了抑制作用：
最后他们通过分子对接和筛选，找到了一个能结合并抑制IQGAP1的化合物——QGGP，加入QGGP后能抑制IQGAP1的表达。而使用QGGP后，可以增强在含有ANGPTL4或CAF-CM处理后，肿瘤细胞对于化疗药的敏感性：
最后就形成了这样的示意图（
这个示意图其实是我画的，在《轻松的文献导读》里也介绍过了哈，这种图画出来，不得让你师兄、师姐在组会上高低高看你一眼啊，不清楚的话，回去看看《轻松的文献导读》复习下
），CAFs通过旁分泌释放配体ANGPTL4，配体ANGPTL4与PCa细胞上的膜受体IQGAP1结合，促进了IQGAP1结合c-Raf、MEK以及ERK1/2，激活ERK1/2的磷酸化，促进了PGC1α的表达。而PGC1α通过促进线粒体发生，增强了肿瘤细胞的氧化呼吸，增强了肿瘤细胞的化疗耐受：
总的来说，这篇文章推理的过程是值得肯定的，通过不断地假设，验证获取结果，再进行假设迭代，逐步推进课题。但在很多细节上，验证还是有一定的缺陷，比如在验证IQGAP1-ERK1/2-PGC1α轴的过程中，他们分别敲减了肿瘤细胞的IQGAP1、ERK1/2和PGC1α，这就是妥妥的肯定后件的逻辑谬误（
由于MAPK信号通路并不会只有这么一个受体能激活，而激活MAPK信号通路后下游的变化也不止是PGC1α，所以这个命题中，概念的外延都是不一致的，由于概念外延的不一致，就会造成肯定后件或者中项不周延的逻辑谬误，这样的验证获得的结果也不够严谨，不清楚肯定后件或者中项不周延的话可以去看看《科研的推理和逻辑：从实验台到咖啡桌》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼？》系列
）。总的来说这篇文章的推理过程还是比较值得借鉴的，细节上还需要打磨。好了，今天就先策到这里吧，有兴趣的话可以看看原文，祝你们心明眼亮。
喜欢夏老师讲文献
的话，
可以点点星标，点点赞，点点“在看
”，多分享多转发。
公众号回复“公克”，没事可以翻翻精华帖，里面有不少宝藏工具，
当作是科研过程中的一种调剂也是不错的选择哦
，
科研并不一定要这么无聊又尴尬
：
目前夏老师已正式出版11本书，想要的可直接点以下微店小程序直接购买：
