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用TBtools下载核酸序列怎么分割？TBtools自带fasta文件分割功能使用以及与脚本分割的对比

生信石头 · 公众号 · · 2021-08-23 12:46

正文

最近需要下载一些核酸序列，之前介绍的ncbi-genome-download好像不能满足我的需要，于是使用TBtools进行下载。

打开TBtools>Sequence Toolkit>NCBI Sequence Fetch>Bulk NCBI Sequence Download

粘贴accession号，设置好输出文件夹和文件名，选择对应的核酸格式即可，点击Start.
下载得到一个fasta文件：

然后打开Sequence Toolkit > Fasta tools > Merge and split

把要分割的fasta文件拖进右边第一个框，输出的文件夹拖到右边第二个框，Split Mode 选择Record Per line，再点击Start，即可。

如果使用脚本的话，则只需

python

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