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中共十八届六中全会闭幕，随后的人事变动陆续公布。继地方党政大员密集调整后，国务院部委系统也迎来一波新人。2016年11月7日，全国人大常委会接连任免了6名国务院部长，更早之前，国家民委、交通部、教育部的行政长官也已调整到位。
11月7日的任免中，全国人大常委会免去了耿惠昌、楼继伟、李立国、黄树贤的国安部长、财政部长、民政部长、监察部长职务，任命陈文清、肖捷、黄树贤为国安部长、财政部长和民政部长。而监察部长一职，暂时出缺。之前的调整中，接替原国家民委党组书记、主任王正伟一职的是蒙古族的巴特尔，教育部袁贵仁的继任者是陈宝生，比较特殊的是交通部，目前维持着杨传堂任党组书记、李小鹏任部长的“双首长制”。
其中，袁贵仁、耿惠昌、楼继伟均已年满65周岁，已届正部级退休年龄。他们的继任者，面临的最大任务是接棒前任，持续推进其所主管领域的渐进改革。不同寻常的是民政部，原部长、身为中央委员的李立国不但接连缺席多个重要会议和会见，就连领导班子调整的“交接”会议也没有出席。11月15日，民政部排名第一的副部长、曾主管福利彩票优抚安置工作的窦玉沛亦被免职。
11月7日晚，中央纪委监察部网站发布一条重磅消息：近日，中共中央办公厅印发《关于在北京市、山西省、浙江省开展国家监察体制改革试点方案》（下称《试点方案》），三个试点地区将设由人民代表大会产生的监察委员会，这一全新的机构，将是“行使国家监察职能的专责机关”。《试点方案》明确，监察体制改革，先行在北京、山西、浙江三地进行试点。
官方消息只有短短700多字，但信息量很大，监察体制改革一时间成为各界热议的话题。大陆媒体分析指，监察委有望成为“一府两院”之外的第四机关，再通过反腐“全面覆盖”以及资源整合，制度反腐迈出关键一步。目前，一场“事关全局的重大政治改革”已悄然启幕。
而这种涉及多个机构的系统性调整整合，预计将在接下来一段时间对大量相关人员的工作安排产生重大影响。最终能否在机构合并的基础上，形成具有自身使命的统一高效的新机构，将是判断改革成效的关键观察切入点。
面临类似机构和职能整合问题的，还有交通运输部。自深化大部门制改革后，这个部委已迎来两任部长，首任部长即是刚卸任的杨传堂，李小鹏是第二任。李小鹏是中国前总理李鹏之子。经过大部门制改革后的交通部管理着三个国家局：国家铁路局、中国民用航空局和国家邮政局。上任不久，接连三天，李小鹏就走访了上述三个副部级机构。
官方报道显示，9月8日，交通运输部部长李小鹏主持召开部务会，传达国务院第147次常务会议精神，审议并原则通过《关于促进多式联运发展的若干意见》。另据交通运输部官网报道，9月7日，交通运输部党组书记杨传堂主持部党组中心组2016年第七次集体学习，主题是深入学习贯彻《中国共产党问责条例》。以上消息显示，李小鹏和杨传堂在交通运输部的角色已定。李小鹏主持日常工作，杨传堂负责党务和纪检。
目前交通运输部官方网站显示的领导排名，党组书记杨传堂仍位居第一，李小鹏排名第二。有分析认为，中共近几年一直在加强党的领导。杨传堂留任党组书记，或许意味着未来中央部委可能会打破原有部长、书记“一肩挑”的惯例，在部长之外还设置专门的党组或党组书记，实行“双首长制”。“双首长”在各自部门中既分工又合作，一起搭档带好班子。
不过也有分析指出，这种“双首长制”应该不会成为趋势。因为“双首长制”容易造成责任不清，互相扯皮，对一个部门的工作未必有利。杨传堂留任党组书记，更可能是目前还没有确定去处，更重要的也是为了与李小鹏交接工作。毕竟，对于李小鹏来说，交通运输行业是一个全新的领域，需要一段时间来适应。
2008年5月，李小鹏从中国华能集团公司总经理任上被调往山西，出任副省长、省长。今年9月3日履新交通运输部部长。舆论认为，主政交通部后，李小鹏面临如何推进海陆空综合运输服务体系建设、构建物流大通道、建设海运强国、交通扶贫等艰巨任务。其中，公众比较关注的收费公路、网约车等热点问题，也是李小鹏必须面对的。
此前在国务院部委系统，部长和党组（党委）书记分设的还有外交部、科技部和国家安全部。如外交部党委书记是张业遂、部长是王毅；科技部党组书记是王志刚、部长是万钢；国家安全部党委书记是陈文清、部长是耿惠昌。但随着11月7日党委书记陈文清出任部长，国家安全部已经结束“双首长”履职局面。外交部部长与党委书记分设，是因为工作性质所致，常务副部长兼任外交部党委书记一直是惯例。科技部部长与党组书记分设，是因为部长万钢是致公党成员。
陈文清今年56岁，四川仁寿人，西南政法学院法律专业毕业，曾在公安、国安、检察、纪检等多系统任职。他42岁跻身副省级，曾是最年轻的省级检察长、最年轻的省级纪委书记、最年轻的中央纪委副书记。
2015年5月，中央纪委监察部网站更新显示，陈文清不再担任中央纪委副书记、常委职务，但仍保留中央纪委委员职务。此后，陈文清曾出现在官方报道画面中，不过具体职务并非正式公布。2015年5月12日，央视新闻联播画面显示，陈文清出席当天召开的国务院简政放权电视电话会议，就坐于时任公安部常务副部长、党委副书记杨焕宁和商务部副部长钟山之间。同年7月7日，新闻联播画面显示，陈文清出席了在京召开的中央党的群团工作会议，就坐于时任国家安全部部长耿惠昌右边。
今年11月7日履新时，官方公布的简历首次显示，陈文清已于2015年4月至2016年11月期间，担任国家安全部党委书记。此次履新后，陈文清是国家安全部第五任部长，此前四任分别是凌云、贾春旺、许永跃和耿惠昌。前任耿惠昌自2007年8月任该职已9年，今年年满65岁，属于到龄退休。目前，耿惠昌已转任全国政协港澳台侨委员会副主任。
