网格矢量如何计算莫兰指数
引言
遇到一个问题,计算矢量网格的莫兰指数。
概念解释
莫兰指数
莫兰指数(Moran's Index)是一种空间自相关指标,用于衡量空间数据的相似性和聚集程度。它可以用来描述一个区域与其邻近区域之间的属性值的相关性。莫兰指数的取值范围通常在-1到1之间。
当莫兰指数接近1时,表示空间数据呈现出正相关,即相似的值倾向于聚集在一起。
当莫兰指数接近-1时,表示空间数据呈现出负相关,即不同的值倾向于聚集在一起。
当莫兰指数接近0时,表示空间数据呈现出随机分布,没有明显的空间自相关性。
knearst=4?
knearst=4矩阵是一种空间权重矩阵,用于定义空间数据中每个观测点的邻域。在这种矩阵中,每个观测点的邻域由其最近的4个点组成。
示意图,这个用距离小时
解决思路
计算矢量数据中每个要素(网格)的局部莫兰指数,并将计算结果添加到矢量数据的属性表中。我做了一个示意矢量,如图所示:
因为需要涉及到矢量数据的操作,这里我们使用
gdal
。
还涉及到莫兰指数,我们使用pysal,这个包用于空间权重矩阵的构建、空间自相关指标的计算、空间回归模型的估计等。
初始化和读取矢量数据
import numpy as np import pysal from osgeo import ogr driver = ogr.GetDriverByName('ESRI Shapefile' ) SHP_PATH = r"矢量数据.shp" dataset = driver.Open(SHP_PATH, 1) layer = dataset.GetLayer()
使用
ogr
库打开矢量数据文件(ESRI Shapefile),以读写模式打开。
提取属性值和坐标
values = [] coords = []for feature in layer: geom = feature.GetGeometryRef() centroid = geom.Centroid() coords.append([centroid.GetX(), centroid.GetY()]) values.append(feature.GetField('singlearea' )) values = np.array(values) coords = np.array(coords)
获取要素的几何体(geometry),并计算其质心坐标。
将指定字段('singlearea')的属性值添加到
values
列表中。
创建权重矩阵
knn = pysal.lib.weights.KNN(coords, k=4) knn.transform = 'r'
使用
pysal
库的
KNN
函数创建 k 最近邻权重矩阵,设置
k=4
。
local_moran = pysal.explore.esda.Moran_Local(values, knn)print ("局部莫兰指数:" , local_moran.Is) // 标准化局部莫兰指数 min_value = np.min(local_moran.Is) max_value = np.max(local_moran.Is) normalized_local_moran = (local_moran.Is - min_value) / (max_value - min_value) * 2 - 1print ("标准化后的局部莫兰指数:" , normalized_local_moran)
使用
pysal
库的
Moran_Local
函数计算每个网格的局部莫兰指数。
lisa_field = ogr.FieldDefn('LISA_I' , ogr.OFTReal) layer.CreateField(lisa_field) dataset = None dataset = driver.Open(SHP_PATH, 1) layer = dataset.GetLayer()for i in range(layer.GetFeatureCount()): feature = layer.GetFeature(i) feature.SetField('LISA_I' , float (local_moran.Is[i])) layer.SetFeature(feature)
创建一个新的字段('LISA_I')来存储局部莫兰指数。
使用
layer.GetFeature(i)
获取要素,并将对应的局部莫兰指数赋值给新字段。
关闭数据集并销毁数据源
dataset.Destroy() dataset = Noneprint ("局部莫兰指数已成功添加到矢量数据属性表中。" )
打印提示信息,表示局部莫兰指数已成功添加到矢量数据的属性表中。
完整代码
import numpy as npimport pysalfrom osgeo import ogr // 打开矢量数据文件(以读写模式打开) driver = ogr.GetDriverByName('ESRI Shapefile' ) SHP_PATH = r"矢量数据 - 副本.shp" dataset = driver.Open(SHP_PATH, 1 ) layer = dataset.GetLayer() // 提取属性值和坐标 values = [] coords = []for feature in layer: geom = feature.GetGeometryRef() centroid = geom.Centroid() coords.append([centroid.GetX(), centroid.GetY()]) values.append(feature.GetField('cenlan' )) // 将属性值和坐标转换为NumPy数组 values = np.array(values) coords = np.array(coords) // 创建k最近邻权重矩阵(knearst=4 ) knn = pysal.lib.weights.KNN(coords, k=4 ) // 行标准化权重矩阵 knn.transform = 'r' // 计算每个网格的局部莫兰指数 local_moran = pysal.explore.esda.Moran_Local(values, knn) print("局部莫兰指数:" , local_moran.Is) // 标准化局部莫兰指数 min_value = np.min(local_moran.Is) max_value = np.max(local_moran.Is) normalized_local_moran = (local_moran.Is - min_value) / (max_value - min_value) * 2 - 1 print("标准化后的局部莫兰指数:" , normalized_local_moran) // 将标准化后的局部莫兰指数添加到矢量数据属性表,使用有效的字段名称 lisa_field = ogr.FieldDefn('LISA_I' , ogr.OFTReal) layer.CreateField(lisa_field) // 重新打开数据集并获取图层 dataset = None dataset = driver.Open(SHP_PATH, 1 ) layer = dataset.GetLayer() // 使用 layer.GetFeature(i) 获取要素并更新,使用更新后的字段名称for i in range(layer.GetFeatureCount()): feature = layer.GetFeature(i) feature.SetField('LISA_I' , float(normalized_local_moran[i])) layer.SetFeature(feature) // 关闭数据集并销毁数据源 dataset.Destroy() dataset = None print("标准化后的局部莫兰指数已成功添加到矢量数据属性表中。" )
效果展示
运行完代码,效果为:
总结
使用
gdal
负责空间数据处理,使用
pysal
完成莫兰指数的计算,最后把计算结果写入到属性表里。