专栏名称: 生信技能树
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2024-06数据挖掘答疑

生信技能树  · 公众号  ·  · 2024-07-21 17:47

正文

我们已经开始2024-07的马拉松直播互动授课(7月1)。前面的马拉松在线互动授课答疑精选已经是整理完毕。 如果你想看历史的全部的精选的答疑记录,也可以关注这个专辑哈!


上一期 的答疑互动也是彩蛋多多,现在整理完毕马不停蹄的分享给大家。马上7 月29号就开始最新一期的八月份的直播互动授课啦,有需要的朋友赶快上车哈

下面是优秀实习生的整理和分享


Q1:R版本有要求吗?还是必须要安装发的4.3.1

A1:4.3以上都可以

Q2:Rstudio里第36行代码工具包运行时报错,library(clusterProfiler), 跳过这个剩下的都过了。截图如下

A2:运行前面的 option代码设置镜像,,然后用 BiocManager::install("GO.db")安装缺的R包

Q3:cluster Profiler运行还是有报错

A3:这个包呀,你再试试 先运行前面的 option代码设置镜像,,然后用 BiocManager::install("HDO.db")安装缺的R包

Q4:有什么问题吗

A4:回答n,在问你要不要更新包

Q5:哪里错误了?

A5:有个提示,需要你回答一个yes或no,但是你运行了一句代码,在提示后面,输入一个yes,回车

Q6:请问这个报错应该怎么解决呢?

A6:需要卸载重装 cli 包,remove.packages('cli'),然后重新安装

Q7:plot面板用不了有影响吗?

A7:提示函数不存在,这个问题现在对你来说有点超纲了,建议在学习完接下来的课程之后,再继续处理这个数据

Q8:没看到这种错误怎么处理

A8:这个并不是错误,就是反反复复安装同一个包的警告

Q9:这个for函数怎么运行不了

A9:左下角窗口都是加号,没有返回大于号了.因为前面某一句代码运行不完整,有可能是少了引号或者括号。你按下Esc键然后重新运行。

Q10:运行两条,不能出现对应情况

A10:截图里总共三段代码,第一段少个逗号,第二段没有问题,运行成功了。第三段多个逗号。

Q11:关于分组的问题,三个组,k1挑出来了5个,k2怎么试只出4个样品。但是我如果用pd = pd[1:10,],就出来10个。不明白k2怎么就只跳出来4个。Liver都是大写

A11:liver的l大小写







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