在这期间,陈正致力于代数拓扑学的研究,并带领青年人学习这一崭新的学科。在陈的指导下,吴创造了奇迹。在短短一年的时间内,他就在号称“难学”的代数拓扑学上做出了重要成果,给出了 Whitney 示性类的乘积公式的较简单的证明。这一公式的原证,由
H. Whitney 本人给出,是极为复杂的,以至于 Whitney 在论文发表后仍不得不保留更为详细的娠稿以备忘。
一九四七年吴考取了中法交换生,并于十一月份去法国斯德拉斯堡,从师 C. Ehresmann 教授,不久 Ehresmann 为他申请到了法国科学院的资助(CNRS)。在斯德拉斯堡两年,他就取得了法国国家博士学位。他的博士论文与 G. Reeb 的一起,以专著的形式出版。随后,他去巴黎,与 H. Cartan 教授一起工作。
在法国不到四年的时间里,吴在代数拓扑学上取得了辉煌的成就,其时,正是代数拓扑从艰难迟缓的发展走向突飞猛进。在 J. Leray, H. Cartan, C. Ehresmann 等著名教授的影响和带领下,吴文俊,R. Thom, J.P. Serre, A. Borel 等四员年青闯将,开创了法国代数拓扑学的黄金时代,站在世界最前列。吴和 Thom 首先证明了 Stiefel-Whitney 示性类的拓扑不变性。随后,吴又定义了吴示性类,并给出了由吴示性类与 Steenrod 运算表达 Stiefel-Whitney 示性类的著名的吴公式。这一公式最终揭开了笼罩 Stiefel-Whitney 示性类的神秘面纱,使之变得极易计算,在另一个吴公式中,他给出了 Whitney 示性类之间的后来被证明是所有可能的关系。此外,关于 Steenrod 运算的著名的 Cartan 公式是吴向 H. Cartan 建议的。吴的这一系列成就为代数拓扑学的进一步发展和微分拓扑学的兴起作出了影响深远的贡献,吴示性类和吴公式已成为拓扑学家手中最常用和最有力的武器的一部分,据不完全统计,以吴公式为题目的拓扑学的论文就有儿十篇之多。
一九七六年底,他忽然形成了一个初等几何定理的机械化证明的思想,也就是说,用一套统一的方法去证明一大类几何定理。经过几个月的试验,终于在一九七七年春节前成功地用这一思想证明了不平凡的定理。事后,他想起了 J. F. Ritt 的一本书中曾有多项式组的整序方法。经过他的加工,形成了 Ritt-吴整序原理,为初等几何和初等微分几何的机械化证明奠定了理论基础。他和他的学生于是开始在计算机上实施,证明和发现了许多难度很大的几何定理。一九八四年,他的专着《几何定理机器证明的基本原理(初等儿何部分)》出版。