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每篇文章都是一出感情戏~最后一张图亮了

解螺旋  · 公众号  · 医学  · 2017-04-28 18:02

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作者: Lucky King (转载请注:解螺旋·医生科研助手)

长链非编码RNA00152通过与EZH2相互作用抑制IL24,促进肺腺癌增殖。(回复“ 170428 ”下载文献,一周有效)



只有不到3%的人类基因组编码蛋白质,而至少75%的基因组转录为非编码RNA,包括microRNA( 200nt)。


许多研究已经表明,miRNA可通过结合3'非翻译区,抑制转录调控靶基因的表达,来调控生物作用。 本期文章主角继续是长链非编码RNA(lncRNA)—LINC00152。


使用生物信息学工具 “ lncRNAtor ” (http://lncrnator.ewha.ac.kr/expression.htm) 分析肺腺癌(LAD)组织中的lncRNA表达(n = 291),LINC00152在LAD肿瘤组织中高度表达,比正常组织高出约2.63倍(Fig.1a)。


使用癌症基因组Atlas数据库,LAD组织中LINC00152表达量显著上调(Fig.1b)。


qRT-PCR检测60例样本,与相邻正常组织相比,LAD肿瘤样本中LINC00152的表达量增加(Fig.1c)。


qRT-PCR检测16HBE细胞和LAD细胞系中的表达水平:A549和SPCA1细胞LINC00152表达水平高,H1299表达水平最低(Fig.1d)。


(Fig.1e & f)Kaplan-Meier生存分析,用于检查LINC00152与LAD患者的预后关系,高表达患者无进展生存时间和总生存时间明显更短。


这些结果表明LINC00152在LAD发生和进展中具有重要的生物学作用。


表1. LINC00152表达与患者临床病理特征相关性。



LINC00152沉默抑制LAD细胞增殖


使用siRNA沉默LINC00152表达,转染48h后,与对照相比,A549和SPCA1细胞增殖能力显著降低(Figure S1a);


将pcDNA3.1-LINC00152载体转染H1299细胞,LINC00152表达显著上调(Figure S1b)。



(Fig.2 a) siRNA转染A549和SPCA1细胞,细胞活力显著降低。增加H1299细胞中LINC00152的表达水平,细胞活力显著增加(Fig.2 b)。


Colony Formation Assay集落形成实验,沉默LINC00152后,A549和SPCA1细胞的集落形成能力显著减少(Fig.2 c);H1299细胞LINC00152过表达后,集落形成能力显著增加(Fig.2 d)。EdU(红色)/DAPI(蓝色)免疫染色测定得到一致结果(Fig.2 e & f)。


表明LINC00152促进LAD细胞增殖。



流式检测细胞周期


用si-RNA转染A549和SPCA1细胞,流式细胞仪分析显示:细胞周期停滞在G1/G0期数量显著升高(Fig.3 a & b)。


LINC00152经siRNA沉默后可增加LAD细胞凋亡(Fig.3 c & d)。



WB检测凋亡抑制基因Bcl-xL,siRNA转染的细胞中Bcl-xL蛋白水平显著降低(Fig.S1c)。


LINC00152促进体内LAD肿瘤细胞发生


构建异种移植小鼠模型,以验证LINC00152在LAD肿瘤发生中的致癌作用。将转染sh-LINC00152和空载体的A549细胞注射到裸鼠中,18天后观察发现LINC00152沉默显著降低了肿瘤生长,sh-LINC00152组小鼠中形成的肿瘤小于对照组(Fig.4 a & b)。sh-LINC00152组肿瘤重量小于对照组(Fig.4c)。


将稳定转染pcDNA-LINC00152、空载的H1299细胞注射到裸鼠中,18天后观察发现LINC00152过表达可以促进肿瘤生长(Fig.S2 a & b)。



qRT-PCR分析显示,sh-LINC00152组LINC00152表达量低于空载组(Fig.4d)。免疫组化显示,LINC00152沉默组Ki-67染色降低,反映较低的增殖指数(Fig.4e)。


表明,LINC00152在体内参与了LAD的致癌活化。


说完LINC00152和表型的关系,接下来就该往通路上靠了~


(Fig.5a)A549和SPCA1,细胞核中LINC00152的表达量高于细胞质,作者认为LINC00152是转录水平的调节因子。


为了证明这个猜想,进行了RNA免疫沉淀(Fig.5b):LINC00152与A549 & SPCA1细胞中的EZH2和LSD1直接结合;RNA pulldown实验得出同样结论(Fig.5c): LINC00152与LAD细胞中的EZH2 / LSD1直接相互作用。



生物信息学分析:LINC00152敲除后,SPCA1中有基因上调,基因下调(表2);在这些基因中,挑选出和肿瘤相关的,上调倍数变化较大的IL24,再加WB印证一下(Fig.5 d & e)



使用染色质免疫沉淀( 教你撩5分傻白甜~ )来确定IL24和EZH2、LSD1间的关联。显示EZH2与IL24启动子位点结合(Fig.5h),然而,LSD1未结合IL24启动子位点(文献补充图)。


敲除LINC00152后,降低了IL24启动子基因座中H3K27me3的占有率(H3K27的甲基化在lncRNA表达调控中具有调控作用,即指标)(Fig.5h)。



这些结果表明LINC00152通过与EZH2的相互作用,部分抑制IL24的表达。

IL24与LAD细胞增殖关系


转染pcDNA3.1-IL24载体后,A549和SPCA1细胞中IL24表达量增加(Fig.6a S1f)。








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