专栏名称: 解螺旋
解螺旋——医生科研最好的帮手。无论你是科研零基础,抑或初窥门径,你都可以在解螺旋获得极大的提升,从而面对基金、论文、实验游刃有余。解螺旋课堂是所有热爱科研技能学习的医生聚集地,解螺旋会员是医生科研全方位的贴心助手,加入我们,体验改变。
目录
相关文章推荐
51好读  ›  专栏  ›  解螺旋

每篇文章都是一出感情戏~最后一张图亮了

解螺旋  · 公众号  · 医学  · 2017-04-28 18:02

正文

科研经验 | 文献 | 实验 | 工具 | SCI写作 | 国自然

作者: Lucky King (转载请注:解螺旋·医生科研助手)

长链非编码RNA00152通过与EZH2相互作用抑制IL24,促进肺腺癌增殖。(回复“ 170428 ”下载文献,一周有效)



只有不到3%的人类基因组编码蛋白质,而至少75%的基因组转录为非编码RNA,包括microRNA( 200nt)。


许多研究已经表明,miRNA可通过结合3'非翻译区,抑制转录调控靶基因的表达,来调控生物作用。 本期文章主角继续是长链非编码RNA(lncRNA)—LINC00152。


使用生物信息学工具 “ lncRNAtor ” (http://lncrnator.ewha.ac.kr/expression.htm) 分析肺腺癌(LAD)组织中的lncRNA表达(n = 291),LINC00152在LAD肿瘤组织中高度表达,比正常组织高出约2.63倍(Fig.1a)。


使用癌症基因组Atlas数据库,LAD组织中LINC00152表达量显著上调(Fig.1b)。


qRT-PCR检测60例样本,与相邻正常组织相比,LAD肿瘤样本中LINC00152的表达量增加(Fig.1c)。


qRT-PCR检测16HBE细胞和LAD细胞系中的表达水平:A549和SPCA1细胞LINC00152表达水平高,H1299表达水平最低(Fig.1d)。


(Fig.1e & f)Kaplan-Meier生存分析,用于检查LINC00152与LAD患者的预后关系,高表达患者无进展生存时间和总生存时间明显更短。


这些结果表明LINC00152在LAD发生和进展中具有重要的生物学作用。


表1. LINC00152表达与患者临床病理特征相关性。



LINC00152沉默抑制LAD细胞增殖


使用siRNA沉默LINC00152表达,转染48h后,与对照相比,A549和SPCA1细胞增殖能力显著降低(Figure S1a);


将pcDNA3.1-LINC00152载体转染H1299细胞,LINC00152表达显著上调(Figure S1b)。



(Fig.2 a) siRNA转染A549和SPCA1细胞,细胞活力显著降低。增加H1299细胞中LINC00152的表达水平,细胞活力显著增加(Fig.2 b)。


Colony Formation Assay集落形成实验,沉默LINC00152后,A549和SPCA1细胞的集落形成能力显著减少(Fig.2 c);H1299细胞LINC00152过表达后,集落形成能力显著增加(Fig.2 d)。EdU(红色)/DAPI(蓝色)免疫染色测定得到一致结果(Fig.2 e & f)。


表明LINC00152促进LAD细胞增殖。



流式检测细胞周期


用si-RNA转染A549和SPCA1细胞,流式细胞仪分析显示:细胞周期停滞在G1/G0期数量显著升高(Fig.3 a & b)。


LINC00152经siRNA沉默后可增加LAD细胞凋亡(Fig.3 c & d)。



WB检测凋亡抑制基因Bcl-xL,siRNA转染的细胞中Bcl-xL蛋白水平显著降低(Fig.S1c)。


LINC00152促进体内LAD肿瘤细胞发生







请到「今天看啥」查看全文