专栏名称: 生信人
共同学习生物信息学知识,共同探究生物奥秘。
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推广:开学季—2017年9月培训班安排

生信人  · 公众号  · 生物  · 2017-08-21 07:05

正文

应广大学员需求,我们9月推出分子模拟与蛋白互作研习班、重测序分析与转录组分析在动植物研究中的应用专题班、生物信息学与精准医学培训班、基因组遗传变异与数据分析实用技术培训班、生物信息学软件与工具使用培训班邀请该领域内的专家和一线工程师,将其在项目执行过程中积累的宝贵经验,在课程中呈现并分享给各位同仁。

主办单位: 中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会 
承办单位:北京市计算中心 
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室 
                    中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会 
                    北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心 
                    中国生物工程杂志 
                    北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司

                    北京微生太科技有限公司


 

培训地点:北京海淀区丰贤中路7号3号楼,北京市计算中心三层会议室  

 

分子模拟与蛋白互作研习班

日期

授课题目

授课内容

第一天

蛋白数据库 
介绍

  1. 蛋白质结构分析与PDB数据库应用

  2. PDB文件格式详解

蛋白结构分析软件

  1. 蛋白结构可视化软件Pymol的应用

  2. Pymol的APBS插件使用

第二天

同源建模

       1、同源建模原理介绍 
       2、swiss-model在线同源建模

分子对接

  1. 分子对接理论及autodock介绍

  2. Autodock软件与小分子对接

第三天

虚拟筛选

  1. autodock vina介绍

  2. 分子库筛选实例操作

蛋白质相互作用与分子网络构建

  1. 大分子相互作用研究

  2. 蛋白质相互作用数据库概述

  3. Cytoskape软件应用与网络构建

(课程内容以实际授课为准) 
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。 
特色真正实战经验丰富的一线专业团队,与您一起交流、学习、探讨您工作中实际遇到和将要面对的问题。 
报名费用】  注册费3800元/人,含听课费、教材费、上机费和午餐。请自带笔记本电脑用以上机实习。材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。


 

重测序分析与转录组分析在动植物研究中的

应用专题班

日期

授课题目

授课内容

第一天上午

生物信息学在农业领域中的应用

1、生物信息学的前沿动态 
2、在农业领域的应用与研究热点分析

第一天下午

1、生物信息数据库介绍及在农业上的应用 
2、生物学软件及使用介绍

第二天上午

动植物基因组重测序分析

1、基因组重测序全套分析原理及流程 
2、经典案例分享与方案设计,经典文章分析,包括实验设计思路、实验过程中遇到的困难与解决方案

第二天下午

1、数据上机 
2、讨论与答疑

第三天上午

动植物转录组测序分析

1、转录组测序全套分析的原理及流程 
2、经典案例分享与方案设计,经典文章分析,包括实验设计思路、实验过程中遇到的困难与解决方案

第三天下午

1、数据上机 
2、讨论与答疑

(课程内容以实际授课为准) 
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。 

报名费用

  注册费: 3800元/人(含听课费、材料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。 材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。

 

生物信息学与精准医学培训班

日期

授课题目

授课内容

第一天

精准基因组医学研究基础

1、 1、基因组信息学概论 
2、 2、精准基因组医学的机遇和挑战

转录组学测序技术I

1、二代测序数据介绍 
2、转录组测序原理介绍 
3、转录组数据分析上机实践

第二天

转录组学测序技术II

1、 从转录组数据预测lncRNAs

TCGA项目及数据应用

1、TCGA项目及数据介绍 
1、 2、TCGA数据在医学应用中的案例分析

第三天

ENCODE计划及应用

1、 1、ENCODE计划介绍 
2、 2、利用ENCODE和GWAS数据进行疾病全基因组关联分析

ENCODE数据应用案例分析

ENCODE数据在医学应用中的案例分析

 (课程内容以实际授课为准) 
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。 

特色真正实战经验丰富的一线专业团队,与您一起交流、学习、探讨您工作中实际遇到和将要面对的问题。 
报名费用  注册费3800元/人,含听课费、材料费、上机费和午餐。请自带笔记本电脑用以上机实习。材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。

 

基因组遗传变异与数据分析实用技术培训班

日期

时间

授课题目

授课内容

第一天

上午

生物信息学概述及NGS原理与应用

  1. 生物信息学知识背景概述;

  2. 二代测序(NGS)的基本概况和技术发展简介;

  3. NGS建库原理与技术;

下午

Linux上机操作及生物信息学软件安装及使用 
(上机操作)

  1. linux基础与基本操作;

  2. 生物信息学软件应用及常用软件介绍;

  3. 重测序相关分析软件介绍及安装;

第二天

上午

基因组重测序技术应用理论与策略

  1. 基因组重测序的理论与研究方法及意义;

  2. 全基因组数据分析策略;

  3. 全外显子数据分析方法与应用;

  4. 目标区域测序的策略应用与技术前沿应用;

下午

基因组变异分析 
(上机操作)

  1. 重测序的分析流程;

  2. 原始测序数据的质控及过滤;

  3. 学习BWA,samtools等工具的使用,进行calling SNP,INDEL;

  4. sam/bam文件处理、VCF文件与基因组变异位点分析

第三天

上午

基因组变异分析 
(上机操作)

  1. 利用重测序数据检测拷贝数变异(CNV);

  2. 利用重测序数据检测易位、转置等结构变异(SV)

下午

基因组变异注释与功能分析 
(上机操作)

  1. 基因组注释工具Annovar的应用;

  2. 功能分析工具David的使用;

  3. 基因组变异数据库Genecard、HGMD等以及功能分析的应用;

  4. 药物基因组学与靶向药突变位点查询;

  5. 基因组变异位点筛选与过滤分析

(课程内容以实际授课为准) 
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。 

报名费用  注册费3800元/人,含听课费、材料费、上机费和午餐。请自带笔记本电脑用以上机实习。 材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。

 

生物信息学软件与工具使用培训班

日期

时间

课程名称

课程内容

第一天 
上午

09:30-10:30

生物信息学 
概述与前沿

1. 基因组学与生物信息学背景知识介绍; 
2. 生物信息进展与前沿技术介绍;

10:30-12:00

NCBI数据库

1. NCBI数据库介绍:PubMed、Nucleotide(GenBank)、Genome、Structures(MMDB)、Taxonomy、UniGene、Entrez等,数据查询检索;

第一天 
下午

13:30-15:00

NCBI数据库

2. NCBI数据库数据上传提交与批量下载; 
3. NCBI数据库实例讲解与练习;

15:00-17:00

Blast与序列比对

1. Blast与序列检索比对及参数; 
2. Blast建库与Blast本地化; 
3. 实例讲解与练习;

第二天 
上午

09:30-12:00

MEGA软件与分子进化

1. 分子进化理论基础; 
2. MEGA与系统发育树构建; 
3. 实例讲解与练习;

第二天 
下午

13:30-17:00

基因组注释

1. 基因本体数据库GO及GO注释; 
2. 生物学通路KEGG注释方法与实现; 
3. David与基因注释; 
4. IPA简介,查询搜索,通路分析与网络构建;

第三天 
上午

09:30-12:00

分子网络与生物学通路分析

1. 分子相互作用数据库与通路概述(Uniprot,String,DIP数据库); 
2. 分子网络分析工具Cytoscape及插件使用; 
3. 实例讲解与练习;

第三天 
下午

13:30-15:30

疾病和基因突变数据库

1. GeneCard数据库介绍及使用; 
2. HGMD(人类基因突变数据库)数据库介绍及使用;

15:30-17:00

药物基因组数据库

1. PharmGKB数据库介绍及使用; 
2. PGMD数据库介绍及使用;

第四天 
上午

09:30-12:00

表观遗传学

1. Encode数据库介绍及使用; 
2. Roadmap数据库介绍及使用; 
3. RegulomeDB数据库介绍及使用;

第四天 
下午

13:30-15:30

蛋白质3D结构

1. 蛋白质结构分析概述; 
2. PDB数据库介绍与使用; 
3. PyMol蛋白质结构分析软件介绍与使用;

15:30-17:00

SPSS软件与生物统计应用

1. 生物统计概述; 
2. SPSS使用与生物统计应用; 
3. 实例讲解与练习;

(课程内容以实际授课为准) 
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。 

报名费用  注册费3800元/人,含听课费、材料费、上机费和午餐。请自带笔记本电脑用以上机实习。 材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。


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【付费方式 】

现金、刷卡、支票、银行转账、银行汇款 
           单位全称:北京市计算中心 
           账    号:0200151819100023937 
           开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行 
          (备注:在汇款明细里加上“生物—您的姓名”) 

报名优惠政策

1、1人报2个及以上培训班的可优惠200元; 

2、3人以上团体报名每人可减少300元; 

3、4+1团报,可免费赠送一个名额; 

上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。


请联系

QQ号:2814500767

电话:010-59341771

邮箱:[email protected]