日期 | 时间
| 课程名称 | 课程内容 |
第一天 上午 | 09:30-10:30 | 生物信息学 概述与前沿 | 1. 基因组学与生物信息学背景知识介绍; 2. 生物信息进展与前沿技术介绍; |
10:30-12:00 | NCBI数据库 | 1. NCBI数据库介绍:PubMed、Nucleotide(GenBank)、Genome、Structures(MMDB)、Taxonomy、UniGene、Entrez等,数据查询检索; |
第一天 下午 | 13:30-15:00 | NCBI数据库 | 2. NCBI数据库数据上传提交与批量下载; 3. NCBI数据库实例讲解与练习; |
15:00-17:00 | Blast与序列比对 | 1. Blast与序列检索比对及参数; 2. Blast建库与Blast本地化; 3. 实例讲解与练习; |
第二天 上午 | 09:30-12:00 | MEGA软件与分子进化 | 1. 分子进化理论基础; 2. MEGA与系统发育树构建; 3. 实例讲解与练习; |
第二天 下午 | 13:30-17:00 | 基因组注释 | 1. 基因本体数据库GO及GO注释; 2. 生物学通路KEGG注释方法与实现; 3. David与基因注释; 4. IPA简介,查询搜索,通路分析与网络构建; |
第三天 上午 | 09:30-12:00 | 分子网络与生物学通路分析 | 1. 分子相互作用数据库与通路概述(Uniprot,String,DIP数据库); 2. 分子网络分析工具Cytoscape及插件使用; 3. 实例讲解与练习; |
第三天 下午 | 13:30-15:30 | 疾病和基因突变数据库 | 1. GeneCard数据库介绍及使用; 2. HGMD(人类基因突变数据库)数据库介绍及使用; |
15:30-17:00 | 药物基因组数据库 | 1. PharmGKB数据库介绍及使用; 2. PGMD数据库介绍及使用;
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第四天 上午 | 09:30-12:00 | 表观遗传学 | 1. Encode数据库介绍及使用; 2. Roadmap数据库介绍及使用; 3. RegulomeDB数据库介绍及使用; |
第四天 下午 | 13:30-15:30 | 蛋白质3D结构 | 1. 蛋白质结构分析概述; 2. PDB数据库介绍与使用; 3. PyMol蛋白质结构分析软件介绍与使用; |
15:30-17:00 | SPSS软件与生物统计应用 | 1. 生物统计概述; 2. SPSS使用与生物统计应用; 3. 实例讲解与练习; |