招生招聘信息
中山大学公共卫生学院（深圳）流行病计算系统生物学实验室招收硕士生、博士生、博士后以及专职科研人员。欢迎对传染病、公共卫生、生物信息学、计算系统生物学、演化、生态学、网络动力学以及理论建模领域有强烈兴趣，有一定数理基础的你加入我们的研究小组，让我们一起量化生命，呵护健康！
博士招生（11月24日截止）：2018年“申请-考核”制招收博士生（点击链接）
专职科研和博士后人员享多重优惠政策支持（广东+深圳）！
联系人：杜向军
联系方式：[email protected], [email protected], [email protected]
关于中山大学公共卫生学院（深圳）
关键词：聚焦新发突发传染病，跨越式发展
2015年11月，深圳市政府与中山大学签署合作协议，市校合作通过十年左右的努力，将深圳校区建成具有中国特色、传承中山大学办学传统，具有世界一流水平的大学校区，使之成为支撑引领深圳经济社会发展，辐射粤港澳大湾区及亚太地区的高层次创新人才重要培养基地。公共卫生学院（深圳）作为中山大学深圳校区首批建设学院之一，以“面向学术前沿、面向国家重大战略需求、面向国家和区域经济社会发展”为基本导向，将在五年内建成以新发突发传染病防控为特色，专业齐全的国内领先、国际一流的公共卫生学院。中山大学公共卫生学院（深圳）将与位于广州的公共卫生学院错位发展，以新发突发传染病的病原学、流行病学和防控技术为重点，通过科学研究、人才培养和社会服务等方面，为我国乃至全球传染病防控提供理论和技术支撑。
参见：http://www.sysu.edu.cn/2012/cn/zhsxy/zhsxy10/31099.htm
新网站即将上线
关于流行病计算系统生物学实验室
关键词：传染病，学科交叉，定量模拟
本课题组通过计算系统生物学的方法，通过数据分析以及理论建模，定量的研究多种相关因素与传染病的产生、演化、传播以及致病的关系，揭示传染病背后的生物学机制，量化模拟，指导传染病的日常监测、防控与治疗。实验室的研究方向包括：
1. 生物信息学/计算系统生物学
2. 传染病病原体演化
3. 传染病理论生态学
4. 宿主感染免疫通路重构与定量模拟
导师简介
杜向军 教授（博士生导师）
工作经历
2018/01 - 至今 中山大学，公共卫生学院（深圳）教授
2015/12-2017/12 芝加哥大学生态进化系，研究专员
2015/04-2015/11 芝加哥大学生态进化系，研究助理
2014/10-2015/11 霍华德休斯医学研究所（HHMI），研究助理
2014/10-2015/03 密歇根大学生态与进化生物学系，研究助理
2010/09-2014/09 美国国立卫生院（NIH）国立生物信息学中心（NCBI），博后
教育经历
2005/09-2010/07 中国科学院生物物理研究所，生物信息学，理学博士
2001/09-2005/07 华中科技大学物理系，应用物理学，理学学士
发表文章
到目前为止共发表学术论文10篇，其中以第一作者在Science Translational Medicine、Nature Communication、Genome Research、Nucleic Acids Research、Genome Biology and Evolution等主流国际学术期刊共发表论文6篇，平均影响因子大于10，代表文章如下：
1. Xiangjun Du, Aaron A. King, Robert J. Woods, Mercedes Pascual. Evolution-informed forecasting of seasonal influenza A (H3N2). Science Translational Medicine, 9(413) (2017)
2. Yousong Peng, Lei Yang, Honglei Li, Yuanqiang Zhou, Lizong Deng, Aiping Wu, Xiangjun Du, Dayan Wang, Yuelong Shu, Taijiao Jiang. PREDAC-H3: A User-friendly Platform for Antigenic Surveillance of Human Influenza A (H3N2) Virus Based on Hemagglutinin Sequence. Bioinformatics, 32(16):2526-2527 (2016)
3. Mi Liu, Xiang Zhao, Sha Hua, Xiangjun Du, Yousong Peng, Xiyan Li, Yu Lan, Dayan Wang, Aiping Wu, Yuelong Shu, Taijiao Jiang. Antigenic Patterns and Evolution of the Human Influenza A (H1N1) Virus. Scientific Reports, 5:14171 (2015)
4. Xiangjun Du, E. Michael Gertz, Damian Wojtowicz, Dina Zhabinskaya, David Levens, Craig Benham, Alejandro A. Schaffer, and Teresa Przytycka. Potential non-B DNA Regions in the Human Genome are Associated with Higher Rates of Nucleotide Mutation and Expression Variation. Nucleic Acids Research, 42(20):12367-79 (2014)
5. Xiangjun Du, Damian Wojtowicz, Albert A. Bowers, David L. Levens, Craig J. Benham and Teresa M. Przytycka. The Genome-wide Distribution of Non-B DNA Motifs is Shaped by Operon Structure and Suggests the Transcriptional Importance of Non-B DNA Structures in Escherichia coli. Nucleic Acids Research 41(12):5965-77 (2013)
6. Xiangjun Du, David J. Lipman and Joshua L. Cherry. Why Does a Protein’s Evolutionary Rate Vary over Time? Genome Biology and Evolution, 5:494-503 (2013)
7. Xiangjun Du, Libo Dong, Yu Lan, Yousong Peng, Aiping Wu, Ye Zhang, Weijun Huang, Dayan Wang, Min Wang, Yuanji Guo, Yuelong Shu, Taijiao Jiang. Mapping of H3N2 Influenza Antigenic Evolution in China Reveals a Strategy for Vaccine Strain Recommendation. Nature Communications 3:709 (2012).
8. Yang Cao, Xiaoying Koh, Libo Dong, Xiangjun Du, Aiping Wu, Xilai Ding, Hongyu Deng, Yuelong Shu, Jianzhu Chen, Taijiao Jiang. Rapid Estimation of Binding Activity of Influenza Virus Hemagglutinin to Human and Avian Receptors. PLoS ONE 6(4): e18664 (2011).
9. Aiping Wu, Yousong Peng, Xiangjun Du, Yuelong Shu, Taijiao Jiang. Correlation of Influenza Virus Excess Mortality with Antigenic Variation: Application to Rapid Estimation of Influenza Mortality Burden. PLoS Computational Biology 6(8): e1000882 (2010).
10. Xiangjun Du, Zhuo Wang, Aiping Wu, Lin Song, Yang Cao, Haiying Hang, Taijiao Jiang. Networks of genomic co-occurrence capture characteristics of human influenza A (H3N2) evolution. Genome Research 18:178-187 (2008).
发明专利
1. 通过模型预测流感抗原的方法及应用，2012年，发明专利，专利号：ZL201010147536.8；
获奖情况
1. NIH Fellows Award for Research Excellence, 2012
2. 中科院三好学生标兵，2010
3. 吴瑞奖学金，2009
4. 中国科学院刘永龄奖学金优秀奖，2008
5. 中国科学院三好学生，2008
6. 中国科学院生物物理所所长论文奖特等奖，2007
