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环状RNA
(CircRNAs)
是一类主要的非编码RNA。随着高通量测序技术的发展,许多环状RNA被鉴定和注释,但阐明其生物学的却不多,尤其明确功能的植物环状RNA寥寥无几。近日,
Plant Biotechnology Journal
在线发表了电子科技大学
张勇
课题组及其合作者题为“
Efficient deletion of multiple circle RNA loci by CRISPR-Cas9 reveals Os06circ02797 as a putative sponge for OsMIR408 in rice
”的研究论文。该研究基于CRISPR-Cas9介导的基因组长片段缺失策略实现植物环状RNA功能鉴定
该研究基于CRISPR-Cas9介导的基因组长片段缺失策略实现了四个水稻CircRNAs的敲除和功能鉴定。结果表明,水稻CircRNA基因Os02circ25329、Os06circ02797、Os03circ00204和Os05circ02465在原生质体和稳定转基因T0系中的缺失率均达到10%以上。表型鉴定结果显示,这些CircRNAs参与了种子萌发过程中的盐胁迫反应,尤其是Os05circ02465缺失突变体表现出较高的耐盐性。值得一提的是Os06Circ02797突变体的幼苗在种子萌发后表现出较快的生长特性,其叶绿素A/B含量较高。进一步的分子和计算分析结果表明,Os06circ02797在CircRNA-miRNA-mRNA调控网络中发挥结合OsMIR408的功能。
该研究不仅提供了植物CircRNA位点通过海绵吸附(sponge)响应来负调控miRNA的明显证据,而且还为进一步通过编辑植物CircRNA位点改良农艺性状提供了新思路。
Os06cic02797 negatively regulates OsMIR408 expression
电子科技大学
张勇
教授、马里兰大学
Yiping Qi
博士为该研究工作通讯作者,电子科技大学
周建平
副教授、电子科技大学硕士生
袁明珠
为论文共同第一作者,研究工作得到了国家自然科学基金、四川省科技项目和水稻生物学国家重点实验室开放基金等项目资助。