是时候轮到下一代测序技术了吧（2024年诺贝尔生理学或医学奖金花落谁家！）

众所周知，我所推广的生物信息学数据处理技能，基本上都是依托于下一代测序（Next-Generation Sequencing, NGS），恰好在朋友圈看到了关于2024年诺贝尔生理学或医学奖金 的预测，其中比较热门的是免疫疗法里面的cGAS-STING通路的发现，以及CAR-T细胞疗法。然后是ai蛋白质组以及NGS ：

不知道为什么，这个下一代测序（Next-Generation Sequencing, NGS）就触动了我，是时候为它打call了！

第一代测序技术：Sanger测序法已经获得了诺贝尔奖

Sanger测序法，也称为双脱氧链终止法或链终止法，是一种DNA测序技术，由弗雷德里克·桑格（Frederick Sanger）发明。这项技术是DNA测序领域的一个重大突破，因为它使得科学家能够快速、准确地确定DNA分子中的核苷酸序列。弗雷德里克·桑格因其在DNA测序领域的贡献，两次获得了诺贝尔化学奖：

1. 1980年，桑格首次获得诺贝尔化学奖，以表彰他与沃尔特·吉尔伯特（Walter Gilbert）和保罗·伯格（Paul Berg）共同在DNA结构的化学和生物分析法方面的贡献。桑格的获奖工作包括他发明的链终止法（Sanger测序法）。
2. 桑格第二次获得诺贝尔化学奖是在1958年，当时他与阿瑟·科恩伯格（Arthur Kornberg）共同获奖，以表彰他们在理解DNA复制机制方面的工作。

桑格测序法是第一个允许快速、准确测定DNA序列的方法，它在分子生物学、遗传学、医学研究和诊断等领域有着广泛的应用。尽管随着技术的发展，出现了如下一代测序（NGS）等更先进的测序技术，但Sanger测序法仍然是许多实验室常用的测序方法之一，尤其是在需要高精度和可靠性的场合。

🔍 Sanger测序法与下一代测序有何不同？

Sanger测序法和下一代测序（Next-Generation Sequencing, NGS）是两种不同的DNA测序技术，它们在原理、操作方式、成本、通量和应用范围等方面都有显著的差异。以下是这两种技术的比较：

Sanger测序法（链终止法）

1. 原理 ：通过DNA聚合酶在DNA合成过程中添加双脱氧核苷酸（ddNTPs），这些ddNTPs缺乏一个羟基，因此无法形成磷酸二酯键，导致DNA链的合成终止。通过使用不同的ddNTPs和相应的引物，可以合成一系列不同长度的DNA片段，然后通过凝胶电泳分离这些片段，根据条带的位置确定DNA序列。

2. 操作方式 ：是一种单分子测序方法，每次反应只测序一个DNA分子。

3. 成本 ：相对较高，因为需要对每个样本进行单独的反应和电泳分析。

4. 通量 ：较低，每次实验只能测序少量的DNA片段。

5. 准确性 ：非常高，可以达到99.999%的准确率。

6. 应用 ：适用于已知序列的验证、小规模基因组的测序、特定基因的测序等。

下一代测序（NGS）

1. 原理 ：通过大规模并行测序技术，可以同时测序数百万个DNA分子。NGS技术包括多种不同的方法，如Illumina的边合成边测序（Sequencing by Synthesis, SBS）、Ion Torrent的半导体测序等。

2. 操作方式 ：通过构建DNA片段库，然后并行测序这些片段，最后通过生物信息学工具进行数据分析和组装。

3. 成本 ：相对较低，因为可以同时测序大量的DNA分子，分摊了成本。

4. 通量 ：非常高，可以在短时间内完成大规模的基因组测序。

5. 准确性 ：通常低于Sanger测序，但随着技术的进步，准确率也在不断提高。

6. 应用 ：适用于大规模基因组测序、转录组分析、表观遗传学研究、群体遗传学研究等。

总结

• Sanger测序 适合于小规模、高精度的测序需求，如单个基因的测序或已知序列的验证。
• 下一代测序 适合于大规模、高通量的测序需求，如全基因组测序、转录组分析等。

随着技术的发展，下一代测序技术在成本、通量和应用范围上具有明显优势，已经成为基因组研究的主流技术。然而，Sanger测序法在某些特定应用中仍然不可替代，特别是在需要极高准确率的场合。

大家希望ngs技术获奖吗

做一行爱一行， 已经在生物信息学领域（基于ngs）摸爬滚打十年的我是力挺这个技术！ 让我们一起期待吧！