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肿瘤研究不再愁:样品制备也能这么简单!

医麦客  · 公众号  ·  · 2024-12-27 07:20

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2024年12月27日

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基因和蛋白质生物标记物获取上不断涌现出的新技术,推动了肿瘤研究在诊断、预后和治疗方面取得重大进展。RT-qPCR和NGS等先进的基因分析方法,以及高质量DNA和RNA的提取,提升了生物标记物鉴定的可靠性和灵敏度。蛋白质生物标记物的研究有助于早期发现癌症、理解其机制和监测治疗反应。通过综合分析基因和蛋白质生物标记物,可以更全面地了解癌症,从而提高诊断准确性、优化风险分层,并开发更具针对性的个性化疗法。


那如何才能获得更高质量的DNA、RNA和蛋白来确保下游获得更可靠的数据呢?赛默飞针对肿瘤研究中的样品制备,给出了全方面的解决方案,随着小编一起来围观。


实体瘤

用于研究的实体瘤样本可以以新鲜冷冻(FF)组织或福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织的形式。分析这些样本需要多种方法,包括免疫组化(IHC)、荧光原位杂交(FISH)、RT-qPCR和NGS等。FFPE组织可用于直接研究和分析切除的活组织切片,通过FISH和IHC等传统方法鉴定基因突变或分子变化,RT-qPCR和NGS则能对多个基因位点进行多重分析。 qPCR和NGS等分子应用是实体瘤分子图谱分析的驱动力,需高质量的核酸技术以简化分离流程,快速高效地获得结果。


使用 Applied Biosystems™ AutoLys™ M管 MagMAX™ FFPE DNA/RNA Ultra试剂盒 相结合,可通过安全方便的磁珠分离法从FFPE组织中提取高质量的DNA和RNA,节省动手时间,避免使用危险化学品,并减少组织损失。



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液体活检

液体活检利用尿液、全血、血清或血浆等体液中的循环肿瘤细胞(CTC)、循环肿瘤DNA(ctDNA)和外泌体等循环生物标志物,可反映疾病的存在和进展。液体活检作为一种 低侵入性 的辅助手段,特别适用于不能进行侵入性检测的病例,或用于监测和研究癌症的长期进展。随着技术的进步,液体活检在癌症研究中的重要性日益增加。


循环肿瘤 DNA(ctDNA): 可以从血浆或血清等样本中分离出来,作为一种侵入性较小的生物标记物,用于监测肿瘤动态、评估治疗反应、检测最小残留病或检测抗药性突变的出现。 MagMAX™ 游离 DNA 分离试剂盒 可确保浓缩较短的片段 DNA,为敏感的下游分析做好准备。基于大小的高分辨率回收有助于提高 ctDNA 的浓度,从而改进检测。



循环肿瘤细胞(CTC): 完整的肿瘤细胞可以脱离母体肿瘤,在血液中循环。循环肿瘤细胞可提供更多有关肿瘤组成和行为的有价值信息。不过,CTCs 的数量比 ctDNA 少。捕获和检测它们需要高灵敏度的方法。在某些情况下,CTCs 会固定在一个新的位置开始繁殖,从而成为肿瘤转移的媒介。CTC 的完整细胞结构有助于确定转移性癌症的最初来源。


Invitrogen™ Dynabeads™ Epithelial Enrich磁珠 可直接从全血、骨髓或 PBMC 悬浮液富集上皮肿瘤细胞。裂解富集的肿瘤细胞用于 mRNA 分离和 RT-qPCR 扩增。



Invitrogen™ Dynabeads™ MyOne™ CD45白细胞去除磁珠 是共价偶联抗人 CD45 抗体的超顺磁性微球,可在约30分钟内从全血、白细胞层或 PBMC 悬浮液中高效去除 CD45 + 细胞。




外泌体

外泌体是一种小型(30-150 nm)的细胞外囊泡(EV),由体外和体内细胞分泌到多种体液中,携带核酸和蛋白质作为生物标志物评估母细胞的状态。肿瘤细胞分泌的外泌体比非肿瘤细胞更多,参与细胞间信号传递,跨越生物屏障。外泌体在原发性和继发性肿瘤间传递信息,影响肿瘤的生长、侵袭和耐药性。外泌体数量通常比循环肿瘤细胞(CTCs)更多,成为转移性恶性肿瘤的重要低侵入性信息来源。


相比传统的超速离心等富集方法, Invitrogen™ Dynabeads™ Intact Virus Enrichment 磁珠 操作简便、时间更短,并且对起始材料的需求量较小,同时可以获得较高的外泌体产量。



Dynabeads磁珠能帮助研究人员通过免疫亲和捕获直接分离特定的外泌体亚群。该过程使用 Dynabeads磁珠和针对常见外泌体表面标志物(CD9、CD63、CD81和EpCAM)


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血液肿瘤







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