交互(
Crosstalk
)是国自然中最常用的一个
“
高级词汇
”
,今天我们就来简单梳理有哪些多维度、多尺度的交互(
Crosstalk
)。
注意:
“Crosstalk”
这个词是没有方向性的,所以如果要体现出方向性,还是直接说细胞
1
诱导、活化等更加合适。
不过一般情况下,细胞
1
和细胞
2
之间也要有分工和角色不同,如同相声里的逗哏和捧哏,需要有个浓眉大眼的,也需要有个贼眉鼠眼的。
1.
新细胞群和经典细胞群
,比如在肿瘤研究里面,发现某个新的中性粒细胞亚群可诱导
CD8+T
细胞耗竭,从而诱导肿瘤免疫抑制微环境和免疫逃逸;
2.
功能细胞群和调节细胞群
,比如纤维化过程中成纤维细胞的活化是常见的功能细胞群,而研究发现上皮细胞(原先的功能细胞群)有个新的亚群,可以分泌
TGFβ
等诱导成纤维细胞的活化。
1
)
建议研究分主次
,因为每个细胞群内部可能都会涉及调控相关机制,如果两个细胞群的机制都要做,故事会太大,即使一个面上项目的工作量也未必能
Cover
;
2
)
尽量不要选两个新的细胞群在一个项目里面研究
,这样会导致未知科学问题太多;
当然,细胞器(或者亚细胞结构)之间最常见的交互方式是
蛋白、
RNA
和代谢物等分子介导的交互
,比如线粒体功能障碍产生的代谢物对其它细胞器的损伤。
细胞器的异质性估计也是以后的研究趋势
,最近的
Nature
文章已经报道了细胞内有两种完全不同的线粒体:
器官间交互比较常用的方式是
内分泌途径
,当然不同系统疾病之间通过代谢物、炎症因子、循环免疫细胞亚群、生物活性物质等介导交互,最常见的是
A-B
轴,如
脑肠轴
等:
-
基于多组学联合技术探讨
肠道微生物群-肠-脑轴
稳态平衡及其失衡调控难治性癫痫的分子机制研究
-
基于“
脑-肠轴
"研究天麻对慢性脑缺血致血管性认知障碍的作用机制
-
基于“
肝-肠-菌
”轴探讨大黄灵仙方调控SCF/c-kit通路拮抗胆管炎的机制研究
信号通路间也可以交互,
不过由于每条信号通路包括的分子太多,调控网络太复杂,因此不建议在国自然里面以多条信号通路为主题进行机制研究。
从分子角度来说,蛋白与蛋白、蛋白与
RNA
、蛋白与代谢物等结合和作用也可以认为是交互,比如
蛋白
A
可以通过抑制靶基因
B mRNA
的降解从而参与靶基因
mRNA
的功能
1
(如细胞铁死亡),反之靶基因的蛋白也可以直接与蛋白
A
作用,参与蛋白
A
的另外一个功能
2
(如内质网应激),从而形成蛋白
A
与靶基因
B
的交互反馈轴
。
我想,这个就是国自然里面常说的多维度、多尺度的意思吧……
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