维吉尼亚大学医学院细胞生物学系 Karen Hirschi实验室正在招聘一名Research Scientist
弗吉尼亚大学也是美国最著名、最悠久的大学之一,于1819年由美国第3任总统托马斯·杰斐逊创立。杰斐逊是一位
偶像级的全才,
他既是美国《独立宣言》的起草人之一,也是
土地测量师、建筑师、古生物学家、哲学家、音韵学家和作家
。他懂得五门外语,还对数学、农艺学和建筑学,甚至提琴感兴趣。
在美剧《BONES》中,主角法医科学家小组所在的研究所也以他的名字命名表示敬意。
Jefferson认为当时美国各大学的宗教势力对教育的影响过大,和自己的挚友、美国第4任总统的詹姆斯·麦迪逊先生联手创立了“独立于宗教之外,具有独立和创新精神”的弗吉尼亚大学
此次发布招聘的Hirschi实验室正参与
建立一个基因组学中心
的合作项目,计划将其建成临床医生、生物信息学家和实验生物学家之间进行合作研究的科学中心,用来从事生物学方面的前沿研究。而Hirschi实验室将在该中心负责协调和管理,是合作研究人员和进行实验研究的联络点。
任职者将担任发展基因组学中心的首席生物信息学家,并在首席研究员(PI – Hirschi博士)和其他研究人员的监督下,支持在该中心进行的实验研究。在分析一种或多种高通量测序或组学方法(例如RNA单细胞测序方法)时,其必须具有高度的协作能力和精通的知识。
图源课题组主页:
https://med.virginia.edu/cell-biology/our-research/cell-biology-labs/hirschi-lab/
该课题组的研究方向是调节血管细胞的定型,分化和细胞周期进程以及定义可调节这些过程的信号传导途径,以及某些血管细胞如何获得专门功能,例如多谱系干/祖细胞的生成、维持等
预计工作内容为:
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使用内部开发的工具以及开源和第三方基因组软件和预测算法独立进行生物信息学数据分析;
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开发包括深度学习在内的计算方法,以分析与发育生物学模型相关的基因组、转录组和蛋白质组学模式;
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与其他计算和实验实验室成员及合作者合作,将新发现转化为可在实验和计算上检验的假设。
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任职者将参加与PI进行的每两周一次的会议,以讨论开发基因组学中心的进展,实验室管理问题以及实验结果。
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每两周参加一次Hirschi实验室会议和发展基因组学中心研讨会系列。
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任职者将在独立和道德的监督下工作,适当记录所有研究数据,并协助实验室和中心的其他成员。
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具有良好的职业道德,对细节,组织和沟通技巧的关注,学习新技能以及独立和协作工作能力的积极进取的人
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拥有博士学位。
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在计算机科学,物理科学或生物科学领域具有丰富的生物信息学,数据分析和可视化能力(R和/或Python,lineage projection programs“谱系投影程序”?例如PHATE)。
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需要使用大型数据集的技能以及开发用于分析大型数据集的工具和算法的技能。
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具有基因组学,基于MS的蛋白质组学或网络科学的背景知识者优先。
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至少三年的计算生物学和数据分析经验。
(*PHATE应该一种降维可视化方法,那lineage projection programs是什么呢,求教。。。)