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【分析】原位基因编码级联信号放大用于RNA亚细胞定位成像

X-MOL资讯  · 公众号  ·  · 2020-03-07 08:09

正文


原位信号放大方法如杂交链反应等有较高的灵敏度和较低的检测限,对于测量目标分子的亚细胞空间分布和位置有重要意义。然而,由于探针运载效率低、易降解和潜在的生物安全性,这些方法仍然难以用于活细胞成像。基于基因编码的荧光RNA传感器可以在细胞内转录生成,已被用于检测活细胞内的各种小分子、离子和蛋白质。但是由于缺少信号放大,这些方法对于低含量目标物的成像和定位仍具有挑战,尤其是在哺乳动物细胞中。

近日, 美国马萨诸塞大学 尤明旭 教授(通讯作者)等报道了 一种基因编码原位杂交信号放大技术,命名为INSIGHT,并将其应用于活细胞内RNA位置和分布高灵敏成像 。荧光RNA适体Broccoli被分成两条没有荧光的片段,并与发夹H1和H2的两端连接。在没有引发剂 RNA存在时,发夹H1和H2不发生反应,无荧光信号产生。当加入引发剂RNA后,发夹H1与其杂交并被打开。打开的H1可以将发夹H2打开,然后再与下一个H1杂交。基于该原理,一个引发剂RNA可以诱导多个H1和H2发生级联杂交反应,组装生成多个Broccoli,产生可放大的荧光信号。由于组装形成的Broccoli与引发剂RNA相连接,该方法可以用于定位和追踪细胞内RNA目标分子。通过引入一个RNA分子信标,该研究可以被扩展用于多种RNA检测,为活细胞内生物分子传感和定位开辟了新的道路。


这一成果在近期发表于 Journal of the American Chemical Society ,文章的第一作者 任克维 博士在南京大学 鞠熀先 教授组里取得博士学位,后于2018年至今在马萨诸塞大学从事博士后研究。

原文(扫描或长按二维码,识别后直达原文页面):
In Situ Genetically Cascaded Amplification for Imaging RNA Subcellular Locations
Kewei Ren, Rigumula Wu, Aruni P.K.K. Karunanayake Mudiyanselage, Qikun Yu, Bin Zhao, Yiwen Xie, Yousef Bagheri, Qian Tian, Mingxu You*
J. Am. Chem. Soc. , 2020 , 142 , 2968-2974, DOI: 10.1021/jacs.9b11748


导师介绍
尤明旭
http://www.x-mol.com/university/faculty/49888




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