如题,今天我们来梳理国自然科研热点“乳酸化”,近一年来的高分文章研究。
肿瘤来源乳酸通过促进自噬增强蛋白
RUBCNL
表达增强结直肠癌对贝伐珠单抗治疗的耐药性。
研究主要关注
肿瘤来源乳酸通过组蛋白
H3
赖氨酸
18
乳酸化(
H3K18la
)促进自噬增强蛋白
RUBCNL
表达,增强结直肠癌对贝伐珠单抗治疗的耐药性
。研究发现,结直肠癌肿瘤环境中乳酸积累,作为组蛋白乳酸化的底物,这一过程在缺氧条件下被细胞增强的糖酵解进一步诱导。具体机制为
组蛋白乳酸化促进
RUBCNL/Pacer
的转录,通过与
BECN1
相互作用促进自噬体成熟,并在缺氧癌细胞增殖和存活中发挥关键作用
。
NBS1乳酸化对DNA修复和化疗抗性至关重要。
研究主要关注
乳酸驱动的
NBS1
乳酸化如何促进同源重组(
HR
)介导的
DNA
修复。
研究发现,
NBS1
在赖氨酸
388
(
K388
)位点的乳酸化对于
MRE11-RAD50-NBS1
(
MRN
)复合体的形成以及
HR
修复蛋白在
DNA
双链断裂位点的积累至关重要。具体机制为
TIP60
作为
NBS1
赖氨酸乳酸转移酶,负责
NBS1 K388
位点的乳酸化,而
HDAC3
则作为去乳酸化酶
。
线粒体丙酮酸载体1调节脂肪酸合成酶乳酸化并介导非酒精性脂肪肝病的治疗。
研究主要关注
线粒体丙酮酸载体
1
(
MPC1
)在非酒精性脂肪肝病(
NAFLD
)相关肝脂代谢中的作用及其在
NAFLD
进展中的影响
。研究发现
MPC1
表达水平与
NAFLD
患者肝脂沉积呈正相关。
MPC1
全身杂合敲除(
MPC1 +/-
)小鼠在高脂饮食下肝脂积累减少,但脂合成相关基因表达无变化。
MPC1
敲除通过调节肝细胞内乳酸水平影响多种蛋白的乳酸化,特别是脂肪酸合成酶。脂肪酸合成酶
K673
位点的乳酸化抑制了其活性,从而介导
MPC1
下调肝脂积累
。此外,尽管
MPC1
敲除导致乳酸积累,但由于线粒体保护和巨噬细胞极化,炎症水平得到控制。
H3K18乳酸化通过YTHDF1/m6A/NREP途径促进砷相关特发性肺纤维化进展。
研究主要关注
乳酸化和
N6-
甲基腺苷(
m6A
)修饰在砷相关特发性肺纤维化(
As-IPF
)中的分子机制。
研究发现,
在
As-IPF
中,肺泡上皮细胞(
AECs
)内
m6A
水平、
YTHDF1
和
m6A
修饰的神经蛋白
3.1
(
NREP
)水平升高,通过
YTHDF1/m6A/NREP
途径增加了
TGF-β1
的分泌,促进成纤维细胞向肌成纤维细胞的转化(
FMT
)。此外,肌成纤维细胞分泌的外源性乳酸通过乳酸单羧酸转运蛋白
1
(
MCT1
)提高了全局乳酸化(
Kla
)和
H3K18
乳酸化(
H3K18la
)水平,而在
AECs
中,
H3K18la
促进了
Ythdf1
的转录。
星形胶质细胞LRP1通过抑制ARF1乳酸化促进线粒体传递至神经元并减轻脑缺血中风。
研究主要关注
低密度脂蛋白受体相关蛋白
1
(
LRP1
)在神经退行性疾病发病机制中的作用,尤其是在维持大脑稳态中的功能
。研究发现
星形胶质细胞
LRP1
通过减少乳酸产生和
ADP-
核糖基化因子
1
(
ARF1
)乳酸化,促进星形胶质细胞至神经元的线粒体传递。
LRP1
在星形胶质细胞中抑制葡萄糖摄取、糖酵解和乳酸产生,导致
ARF1
乳酸化减少
。抑制星形胶质细胞
LRP1
会减少线粒体进入受损神经元,并在缺血性中风小鼠模型中加重缺血再灌注损伤。此外,研究还检测了中风患者的乳酸水平,发现脑脊液中乳酸水平升高与星形胶质细胞线粒体呈负相关。
眼巩膜通过糖酵解促进近视发展。
研究主要关注
眼巩膜糖酵解如何通过组蛋白乳酸化促进近视的发展
,研究发现
巩膜缺氧诱导的糖酵解酶表达和乳酸水平增加与近视相关,促进巩膜糖酵解或乳酸产生可以诱导纤维母细胞向肌成纤维细胞的转分化
(FMT)
和近视发展,而抑制糖酵解或乳酸产生则可以消除或抑制
FMT
和近视
。具体机制为
增加巩膜糖酵解
-
乳酸水平通过
H3K18
乳酸化促进
FMT
和近视,进而促进
Notch1
表达,遗传分析显示编码糖酵解酶的两个基因
ENO2
和
TPI1
显著富集。
此外,增加糖摄入量不仅在豚鼠中诱导近视,还通过巩膜糖酵解
-
乳酸
-
组蛋白乳酸化途径增强对近视诱导的反应。
葡萄糖驱动的组蛋白乳酸化促进胶质母细胞瘤中单核细胞源性巨噬细胞的免疫抑制活性。
研究主要关注
葡萄糖代谢如何通过组蛋白乳酸化影响单核细胞源性巨噬细胞
(MDMs)
的免疫抑制活性
,研究发现在胶质母细胞瘤
(GBM)
中,
MDMs
的数量超过微胶质细胞
(MGs)
并在晚期肿瘤阶段抑制
T
细胞活性。分子和功能分析
识别出一群表达
GLUT1
的糖酵解
MDMs
,具有强大的免疫抑制活性。
GBM
衍生因子促进
MDMs
中高糖酵解、乳酸和白介素
-10(IL-10)
的产生
。在
MDMs
中抑制糖酵解或乳酸产生会损害
IL-10
表达和
T
细胞抑制。具体机制为
细胞内乳酸驱动的组蛋白乳酸化促进
IL-10
表达,这是抑制
T
细胞活性所必需的。肿瘤衍生因子激活的
PERK-ATF4
轴下游诱导
MDMs
上
GLUT1
的表达。
组蛋白乳酸化调控METTL3通过m6A修饰ACSL4促进脓毒症相关肺损伤中的铁死亡。
研究主要关注
组蛋白乳酸化如何通过
METTL3
介导的
m6A
修饰影响脓毒症相关肺损伤中的铁死亡
,研究发现
乳酸通过促进
p300
介导的
H3K18
乳酸化结合到
METTL3
启动子区域,调节
m6A
修饰水平。
METTL3
介导的
m6A
修饰在
ACSL4
上富集,并通过
YTHDC1
依赖途径调节其
mRNA
稳定性。短期乳酸刺激上调
ACSL4
,促进与线粒体相关的铁死亡。
通过敲低或靶向抑制
METTL3
可以有效抑制脓毒症高乳酸诱导的肺泡上皮细胞铁死亡,并减轻脓毒症小鼠的肺损伤。
孤儿核受体NR4A3通过组蛋白乳酸化促进血管钙化。
研究主要关注
孤儿核受体
NR4A3
在血管钙化中的作用及其机制
,研究发现
NR4A3
在慢性肾脏病小鼠、维生素
D3
过量诱导的小鼠和人类钙化主动脉组织中表达上调,
NR4A3
缺失保持了血管平滑肌细胞的收缩表型,抑制了成骨分化相关基因表达,并减少了血管中的钙沉积。
此外,
NR4A3
缺失降低了钙化过程中的糖酵解速率和乳酸产生,并减少了组蛋白乳酸化。机制研究表明
NR4A3
通过直接结合到糖酵解基因
ALDOA
和
PFKL
的启动子区域增强糖酵解活性,并驱动其转录启动
。
糖代谢重编程诱导的XRCC1乳酸化赋予ALDH1A3高表达胶质母细胞瘤治疗抵抗性。
研究主要关注
ALDH1A3
高表达胶质母细胞瘤(
ALDH1A3hi GBM
)对术后放化疗的抵抗机制
,研究发现
ALDH1A3
与
PKM2
之间的相互作用增强了
PKM2
的四聚体化,并促进了胶质母细胞瘤干细胞(
GSCs
)中乳酸的积累
。通过扫描乳酸积累的
GSCs
中的乳酸化蛋白质组,发现
XRCC1
在赖氨酸
247
(
K247
)位点发生乳酸化。乳酸化的
XRCC1
对
importin α
的亲和力更强,允许
XRCC1
更多的核内转移和增强的
DNA
修复能力。通过高通量筛选小分子库,发现
D34-919
能有效破坏
ALDH1A3-PKM2
的相互作用,阻止
ALDH1A3
介导的
PKM2
四聚体化增强。
D34-919
的体外和体内治疗增强了
GBM
细胞的放化疗诱导凋亡。具体机制为
ALDH1A3
介导的
PKM2
四聚体化是一个潜在的治疗靶点,可以改善
ALDH1A3hi GBM
对放化疗的反应。
H3K18乳酸化增强非小细胞肺癌的免疫逃逸能力。
研究主要关注
H3K18
乳酸化在非小细胞肺癌(
NSCLC
)中的免疫逃逸作用
,研究发现
NSCLC
组织中泛赖氨酸乳酸化和
H3K18
乳酸化(
H3K18la
)水平升高,与患者预后不良正相关。通过
2-
脱氧
-D-
葡萄糖和氧胺酸处理阻断糖酵解以及沉默乳酸脱氢酶
A
和
B
可以降低
H3K18la
水平,并通过增强
CD8+ T
细胞的细胞毒性来阻止
NSCLC
细胞的免疫逃逸。具体机制为
H3K18la
直接激活膜孔蛋白
121
(
POM121
)的转录,增强
MYC
核转运和直接结合到
CD274
启动子上诱导
PD-L1
表达。
组蛋白H3K9乳酸化通过LUC7L2介导的MLH1内含子保留赋予胶质母细胞瘤对替莫唑胺的耐药性。
研究主要关注
组蛋白
H3K9
乳酸化(
H3K9la
)在胶质母细胞瘤(
GBM
)对替莫唑胺(
TMZ
)耐药性中的作用
,研究发现
H3K9la
在复发
GBM
组织和
TMZ
耐药细胞中上调,主要集中在组蛋白
H3K9
上。通过
CUT&Tag
、
SLAM-seq
和
RNA-seq
等多组学分析,揭示
H3K9
乳酸化在
LUC7L2
启动子区域显著富集并激活
LUC7L2
转录,促进其表达。
LUC7L2
介导
MLH1
第
7
内含子保留,降低
MLH1
表达,抑制错配修复(
MMR
),最终导致
GBM
对
TMZ
的耐药性。
乳酸化稳定DCBLD1激活磷酸戊糖途径促进宫颈癌进展。
研究主要关注
乳酸化如何通过稳定
DCBLD1
蛋白激活磷酸戊糖途径(
PPP
)来促进宫颈癌的进展
,研究发现
乳酸增加了
DCBLD1
的表达,激活
PPP
以促进宫颈癌细胞的增殖和转移。
DCBLD1
主要通过上调葡萄糖
-6-
磷酸脱氢酶(
G6PD
)的表达和酶活性来刺激
PPP
。
具体机制涉及
HIF-1α
在
DCBLD1
启动子区域的富集增加,增强
DCBLD1 mRNA
的表达。此外,乳酸诱导的
DCBLD1
乳酸化稳定了
DCBLD1
的表达
。研究鉴定了
DCBLD1
作为乳酸化的底物,主要的乳酸化位点在
K172
。
糖酵解酶PFKFB3通过促进组蛋白乳酸化介导NF-κB家族激活来驱动肾脏纤维化。
研究主要关注
糖酵解酶
PFKFB3
在肾脏纤维化中的作用及其机制
,研究发现
在小鼠缺血再灌注损伤(
IRI
)后以及多种病因的慢性肾脏病(
CKD
)患者中,肾脏近曲小管细胞(
PTCs
)中
PFKFB3
的表达显著增加,与肾脏纤维化的严重程度正相关。
PTC
特异性敲除
PFKFB3
显著降低了肾脏乳酸水平,减轻炎症和纤维化,保护了
IRI
小鼠模型中的肾脏功能
。机制上,
PFKFB3
介导的肾小管糖酵解重编程产生的乳酸显著增强了组蛋白乳酸化,特别是
H4K12la
,其在
NF-κB
信号基因如
Ikbkb
、
Rela
和
Relb
的启动子区域富集,激活它们的转录并促进炎症反应。
核糖体蛋白Nucleolin的乳酸化通过RNA剪接调节MADD促进肝内胆管癌的发病。
研究主要关注
核糖体蛋白
Nucleolin
(
NCL
)的乳酸化在肝内胆管癌(
iCCA
)发病中的作用
,研究发现
NCL
是与
iCCA
发生和进展相关的功能性乳酸化靶标。
NCL
在糖酵解活性增强时,主要在赖氨酸
477
位点被乙酰转移酶
P300
乳酸化,促进
iCCA
细胞的增殖和侵袭
。具体机制为
乳酸化的
NCL
结合到
MAP
激酶激活死亡域蛋白(
MADD
)的初级转录本,并通过绕过产生过早终止密码子的替代剪接,
通过
RNA
剪接依赖性机制乳酸化上调
MADD
。
NCL
乳酸化、
MADD
翻译及随后的
ERK
激活促进了异种移植肿瘤的生长,并与
iCCA
患者的总体生存相关。
组蛋白乳酸化增强ALKBH3表达并通过m1A去甲基化SP100A减少早幼粒细胞白血病蛋白核凝聚体,促进肿瘤进展。
研究主要关注
组蛋白乳酸化在肿瘤进展中的作用及其机制
。研究发现
组蛋白乳酸化增强了
ALKBH3
的表达,并同时通过去除
SP100A
的
m1A
甲基化,减少了肿瘤抑制性早幼粒细胞白血病蛋白(
PML
)凝聚体的形成,促进了癌症的恶性转化。
ALKBH3
在高风险眼黑色素瘤中因组蛋白乳酸化水平过高而特异上调,表现为
m1A
低甲基化状态。从机制上讲,
YTHDF1
负责识别
m1A
甲基化的
SP100A
转录本,增加其
RNA
稳定性和翻译效率。
组蛋白H3K18乳酸化促进非小细胞肺癌免疫逃逸。
研究主要关注
组蛋白
H3K18
乳酸化(
H3K18la
)在非小细胞肺癌(
NSCLC
)中的作用及其对免疫逃逸的影响
。研究发现
H3K18la
水平在
NSCLC
组织中升高,并与患者预后不良相关。通过抑制糖酵解和沉默乳酸脱氢酶
A
和
B
,降低
H3K18la
水平,增强
CD8+ T
细胞毒性,从而抑制
NSCLC
细胞的免疫逃逸
。具体机制为
H3K18la
直接激活膜孔蛋白
POM121
的转录,增强
MYC
核转运和直接结合
CD274
启动子,诱导
PD-L1
表达
。
组蛋白乳酸化增强ALKBH3表达并减少早幼粒细胞白血病蛋白核凝聚体。
研究主要关注
N1-
甲基腺苷
(m1A) RNA
修饰在癌变中的作用
。研究发现
组蛋白乳酸化增强了
ALKBH3
的表达,并通过去除
SP100A
的
m1A
甲基化,减少肿瘤抑制性早幼粒细胞白血病蛋白
(PML)
凝聚体的形成,促进癌症的恶性转化
。
ALKBH3
在高风险眼黑色素瘤中因组蛋白乳酸化水平过高而特异上调,表现为
m1A
低甲基化状态。多组学分析进一步确定
SP100A
作为
ALKBH3
的下游候选靶标。治疗上,沉默
ALKBH3
在体外和体内对黑色素瘤都显示出有效的治疗效果,可通过耗尽
SP100A
来逆转。
机制上,
YTHDF1
负责识别
m1A
甲基化的
SP100A
转录本,增加其
RNA
稳定性和翻译效率。
TRAP1通过HDAC3介导的组蛋白H4赖氨酸12乳酸化促进平滑肌细胞衰老和动脉粥样硬化。
研究主要关注
肿瘤坏死因子受体相关蛋白
1
(
TRAP1
)在平滑肌细胞(
VSMC
)衰老和动脉粥样硬化中的作用
。研究发现
VSMC
特异性
TRAP1
缺乏可以通过代谢重编程减轻
VSMC
衰老和动脉粥样硬化。具体机制为
TRAP1
显著增加有氧糖酵解,导致乳酸产生增加
。
积累的乳酸通过下调独特的组蛋白赖氨酸去乳酸化酶
HDAC3
,促进组蛋白
H4
赖氨酸
12
乳酸化(
H4K12la
)。
H4K12la
在衰老相关分泌表型(
SASP
)启动子区域富集,激活
SASP
转录,加剧
VSMC
衰老。
在
VSMC
特异性
Trap1
敲除的
ApoeKO
小鼠中,斑块面积、衰老标志物、
H4K12la
和
SASP
均减少。此外,药物抑制和蛋白降解靶向嵌合体(
PROTAC
)介导的
TRAP1
降解在体内有效减轻动脉粥样硬化。
HBO1催化赖氨酸乳酸化并介导组蛋白H3K9乳酸化以调控基因转录。
研究主要关注
赖氨酸乳酸化(
Kla
)在基因调控中的作用及其调控机制
。研究发现
HBO1
作为一种赖氨酸乳酸基转移酶,能够调节基因转录。
HBO1
在体外和细胞内催化
Kla
的添加,其中
E508
是
HBO1
乳酸基转移酶活性的关键位点。
定量蛋白质组学分析进一步揭示了
95
个由
HBO1
靶向的内源性
Kla
位点,其中大多数位于组蛋白上。
使用位点特异性抗体,发现
HBO1
可能优先催化组蛋白
H3K9
乳酸化,而
JADE1
和
BRPF2
等脚手架蛋白可以促进组蛋白
Kla
的酶活性。
Lumican通过H3组蛋白乳酸化促进钙化性主动脉瓣膜病。
研究主要关注
瓣膜间质细胞(
VICs
)向成骨细胞群体转化过程中的关键调控分子。
研究发现
Lumican
(
LUM
)在
VICs
的病理转化过程中起到新的调控作用,通过激活炎症途径和增强细胞糖酵解,导致乳酸积累。
LUM
诱导
VICs
成骨化,通过促进
H3
组蛋白乳酸化,特别是
H3K14la
和
H3K9la
两个位点,促进瓣膜钙化过程。
YY1乳酸化通过增强视网膜小胶质细胞功能加剧自身免疫性葡萄膜炎
。
研究主要关注
Yin-Yang 1
(
YY1
)乳酸化在自身免疫性葡萄膜炎(
EAU
)中的作用
。研究发现
YY1
乳酸化在
EAU
模型中视网膜小胶质细胞内增加,并通过调节包括
STAT3
、
CCL5
、
IRF1
、
IDO1
和
SEMA4D
在内的一系列炎症基因的转录,促进小胶质细胞的激活、增殖和迁移能力。
抑制乳酸化可抑制小胶质细胞激活并减轻
EAU
中的炎症。
此外,
p300
被鉴定为
YY1
乳酸化的
“
写入器
”
,抑制
p300
可减少
YY1
乳酸化并抑制体内外小胶质细胞炎症。
丙氨酰-tRNA合成酶AARS1作为乳酸感受器和乳酸基转移酶通过乳酸化p53促进肿瘤形成。
研究主要关注
赖氨酸乳酸化这一翻译后修饰如何将细胞代谢与蛋白质功能联系起来,并在肿瘤细胞中发挥作用
。研究发现
AARS1
作为乳酸感受器介导肿瘤细胞中全局赖氨酸乳酸化。
AARS1
与乳酸结合并催化乳酸
-AMP
的形成,然后将乳酸转移到赖氨酸受体残基上。
蛋白质组学研究揭示了
AARS1
的大量靶标,包括
p53
的
DNA
结合域中的赖氨酸
120
和赖氨酸
139
乳酸化。
生成并利用携带恒定乳酸化赖氨酸残基的
p53
变体,发现
AARS1
对
p53
的乳酸化阻碍了其液
-
液相分离、
DNA
结合和转录激活。
甲基化CpG结合蛋白2 K271乳酸化介导M2型巨噬细胞极化抑制动脉粥样硬化。
研究主要
关注运动如何通过乳酸化改善动脉粥样硬化(
ASCVD
)
。研究发现在
ApoE-/-
小鼠模型中,甲基化
CpG
结合蛋白
2
(
MeCP2
)
K271
位点的乳酸化在主动脉根部斑块巨噬细胞中促进了促修复的
M2
型巨噬细胞极化,减少了斑块面积,缩小了坏死核心,减少了斑块脂质沉积,并增加了胶原含量。
通过重组腺病毒转染引入
K271
位点突变,过表达
MeCP2 K271
乳酸化,增强了运动诱导的
M2
型巨噬细胞极化并提高了斑块稳定性。从机制上讲,
运动诱导的动脉保护效应需要
MeCP2 K271
乳酸化与
H3K36me3
之间的相互作用,导致染色质可及性增加和
RUNX1
的转录抑制。
此外,转录因子
RUNX1
的药理抑制通过促进斑块巨噬细胞向促修复的
M2
表型极化,发挥动脉保护效应。
组蛋白乳酸化促进CD8+ T细胞代谢和功能。
研究主要关注
组蛋白乳酸化在
CD8+ T
细胞激活和功能中的作用
。研究发现人类和小鼠
CD8+ T
细胞中
H3K18
乳酸化(
H3K18la
)和
H3K9
乳酸化(
H3K9la
)的富集,它们作为调控
CD8+ T
细胞功能的关键基因的转录启动子。此外,不同
CD8+ T
细胞亚群中
H3K18la
和
H3K9la
的特定模式与其特定的代谢轮廓相关联。
研究还发现,通过靶向代谢和表观遗传途径调节
H3K18la
和
H3K9la
可以影响
CD8+ T
细胞的效应功能,包括在临床前模型中的抗肿瘤免疫。
丙氨酰-tRNA合成酶AARS1作为乳酸基转移酶促进胃癌中YAP信号传导
。
研究主要关注
丙氨酰
-tRNA
合成酶
1
(
AARS1
)在胃癌中的新角色
。研究发现
AARS1
能够作为真正的乳酸基转移酶,直接利用乳酸和
ATP
催化蛋白质乳酸化。
AARS1
能够感应细胞内乳酸,转移到细胞核中乳酸化并激活
YAP-TEAD
复合体;
AARS1
本身被鉴定为
Hippo
途径的靶基因,与
YAP-TEAD
形成正反馈循环,促进胃癌细胞增殖。
AARS1
在胃癌中的表达被发现上调,且高表达的
AARS1
与胃癌患者的预后不良相关。
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