专栏名称: 解螺旋
解螺旋——医生科研最好的帮手。无论你是科研零基础,抑或初窥门径,你都可以在解螺旋获得极大的提升,从而面对基金、论文、实验游刃有余。解螺旋课堂是所有热爱科研技能学习的医生聚集地,解螺旋会员是医生科研全方位的贴心助手,加入我们,体验改变。
51好读  ›  专栏  ›  解螺旋

Nature封面:500人队列研究告诉你转移性癌症中的基因变化

解螺旋  · 公众号  · 医学  · 2017-08-27 18:00

正文

经验 | 文献 | 实验 | | SCI写作 | 国自然



作者:叶子

转载请注明:解螺旋·临床医生科研成长平台



本期Nature的封面文章是比较少见的临床类文章,由Dan R. Robinson等人在Nature上发表关于人类转移癌症中DNA和RNA变化的文章。


作为密歇根肿瘤学测序计划的一部分,研究人员描述了癌症患者基因组改变的情况,为后续的研究提供了数据支持(以后做抗癌基因或者抑癌基因就可以从这篇文章的结果中找)。

癌症的大多数损害是由癌细胞从原发灶扩散到身体其他部位引起的。 这些转移性癌细胞产生的基因组变化也超出了原发性肿瘤中产生的变化,其中一些变化让转移性癌细胞在抗癌治疗中生存了下来。

转移性癌症组织的分子研究可以找出克服这种抗药性的办法,但由于技术上的障碍,这类研究目前还很少。


本文作者Robinson教授等人扩展了早期研究中的一些工作,从500个转移瘤病人(称为MET500队列)中获得了转移癌组织中基因组序列和免疫应答的详细数据。

作者报道了30例原发性癌症(最常见的是前列腺癌,乳腺癌和软组织肉瘤转移瘤)转移的患者。这些患者来自美国22个癌症中心,组织样本来自20多个器官。


作者对来自转移组织样本的基因组蛋白质编码部分进行测序,并将这些外显子序列与来自同一患者的非癌组织序列进行比较。

接下来,他们从转移组织中对mRNA进行测序,并将其与参考数据库中获取的正常组织mRNA谱进行比较。这些分析提供了有关遗传突变的信息,以及表征转移灶及其支持组织的改变的基因表达谱。


分析补充了原发性癌症的基因组研究,其中许多由两个大型联盟进行:癌症基因组图谱(http:// cancergenome.nih.gov)和国际癌症基因组联盟(http://icgc.org)。








请到「今天看啥」查看全文