Linux学习-文件列太多，很难识别想要的信息在哪列；别焦急，看这里。

经常会碰到列数特别多的文件，而屏幕又不足以放下这么多列；即便能放下，也不容易清晰的辨别出想提取的信息在第几列。

根据我们前面的学习，可以用一行命令或简单的写一个bash脚本来处理这个问题。

命令如下，命令的解释见 Linux学习-文件排序和FASTA文件操作 。

```bash

ct@ehbio:~$ vim test

ct@ehbio:~$ cat test

sample A B C D E F G H

ID1 1 2 3 4 5 6 7 8

ID2 1 2 3 4 5 6 7 8

ID3 1 2 3 4 5 6 7 8

ct@ehbio:~$ sed -n '1 s/\t/\n/g; 1p' test

sample

A

B

C

D

E

F

G

H

ct@ehbio:~$ sed -n '1 s/\t/\n/g; 1p' test | sed '=' | sed 'N;s/\n/\t/'

1 sample

2 A

3 B

4 C

5 D

6 E

7 F

8 G

9 H

```

完整脚本 `checkCol.sh` （后台回复 环境变量 查看如何像运行一个系统命令一样运行脚本 Linux学习-环境变量和可执行属性 ）。

```bash

#!/bin/bash

#set -x

set -e

#set -u

usage()

{

cat <

${txtcyn}

Usage:

$0 options${txtrst}

${bldblu}Function${txtrst}:

This script is used to check the number of columns in given line and

will output the column number before each column item.

${txtbld}OPTIONS${txtrst}:

-f Data file (- represents STDIN)${bldred}[NECESSARY]${txtrst}

-l lineNumber[${txtred}Default 1 meaning the first line${txtrst}]

EOF

}

file=

lineno=1

while getopts "hf:l:" OPTION

do

case $OPTION in

h)

usage

exit 1

;;

f)

file=$OPTARG

;;

l)

lineno=$OPTARG

;;

?)

usage

exit 1

;;

esac

done

if [ -z $file ]; then

usage

exit 1

fi