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Linux学习-文件列太多,很难识别想要的信息在哪列;别焦急,看这里。

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2017-07-12 07:05

正文

经常会碰到列数特别多的文件,而屏幕又不足以放下这么多列;即便能放下,也不容易清晰的辨别出想提取的信息在第几列。


根据我们前面的学习,可以用一行命令或简单的写一个bash脚本来处理这个问题。


命令如下,命令的解释见 Linux学习-文件排序和FASTA文件操作


```bash

ct@ehbio:~$ vim test

ct@ehbio:~$ cat test

sample A B C D E F G H

ID1 1 2 3 4 5 6 7 8

ID2 1 2 3 4 5 6 7 8

ID3 1 2 3 4 5 6 7 8

ct@ehbio:~$ sed -n '1 s/\t/\n/g; 1p' test

sample

A

B

C

D

E

F

G

H

ct@ehbio:~$ sed -n '1 s/\t/\n/g; 1p' test | sed '=' | sed 'N;s/\n/\t/'

1 sample

2 A

3 B

4 C

5 D

6 E

7 F

8 G

9 H

```


完整脚本 `checkCol.sh` (后台回复 环境变量 查看如何像运行一个系统命令一样运行脚本 Linux学习-环境变量和可执行属性 )。



```bash

#!/bin/bash


#set -x

set -e

#set -u


usage()

{

cat <

${txtcyn}

Usage:







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