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基于16 S rRNA基因测序的黄连对2型糖尿病大鼠肠道微生物多样性影响研究

中草药杂志社  · 公众号  · 药品  · 2017-10-26 15:38

正文

糖尿病的发展早期以湿热瘀阻为主,火热偏盛,表现为肝热、胃热、肠热、湿热、痰热、毒火等火热内盛之象,治疗以清泄火热为主,属于中医学“消渴病”范畴。中医药治疗“消渴病”具有悠久的历史。《本草纲目》:“治消渴,用酒蒸黄连”,名医别录也记载“黄连止消渴”。《东医宝鉴》记载,黄连为治消渴要药,用时酒浸蒸,晒干为末,蜜丸。黄连首载于《神农本草经》,《中国药典》 2015 年版规定黄连为毛茛科植物黄连 Coptis chinensis Franch 、三角叶黄连 Coptis deltoidea C. Y. Chenget Hsiao 或云连 Coptis teeta Wall. 的干燥根茎,其性味苦、寒,归心、脾、胃、肝、胆、大肠经。

本研究以“证”与“症”是人肠道内微生态变化产生的某些继发反应而导致的表观现象,通过药物调理肠内菌群的平衡,对“证”施以影响起到对症下药达到治疗疾病的目的为切入点,通过 16 S rRNA 基因测序,探究 2 型糖尿病肠道微生物的多样性变化,旨在找出药物治疗疾病时,肠道微生物的变化以及所起的作用,进而影响脑 - - 菌轴各部分相互作用,调控神经 - 免疫 - 内分泌网络,扶正机体,体现“疗热以寒药”的中医药理论。

1 材料

1.1 仪器

G-421S 血糖试纸、 G-421 血糖仪[爱奥乐医疗器械(深圳)有限公司];胰岛素检测试剂盒(天津九鼎生物技术有限公司); New Classic ML 分析天平(梅特勒 - 托利多公司); PHS-3C 雷氏 pH 计(上海精密科学仪器有限公司)。

1.2 药品与试剂

黄连药材(湖北省恩施州利川市佛宝山黄连种植基地),经南京中医药大学药学院陈建伟教授鉴定为黄连 Coptis chinensis Franch 的干燥根茎;链脲佐菌素( STZ ,批号 S0130 Sigma 公司);枸橼酸三钠、枸橼酸(广东汕头市西陇化工厂);羧甲基纤维素钠( CMC-Na ,上海康朗生物科技有限公司);氯化钠(南京化学试剂有限公司);葡萄糖(天津市科密欧化学试剂有限公司);二甲双胍(批号 02000913 ,中美上海施贵宝制药有限公司);液氮(南京光芒特种气体有限公司);高脂高糖饲料(北京科澳协力饲料有限公司)。

1.3 动物

健康雄性 SD 大鼠,体质量 200 220 g SPF 级,购买于南京市江宁区青龙山动物繁殖场,许可证号 SCXK (浙) 2014-0001 ,饲养于南京中医药大学实验动物中心屏障动物饲养室,按屏障环境内动物实验观察与操作规范进行实验。

2 方法

2.1 黄连提取物的制备

取黄连药材 2 kg ,加 5 倍量水,加热回流 2 次,每次 2 h ,真空干燥成粉状( HPLC 测得其中含盐酸小檗碱 7.5% 、巴马汀 1.68% 、黄连碱 2.7% ,表小檗碱 2.2% ),置于干燥器中待用。

2.2 糖尿病大鼠模型制备

SD 大鼠以特殊膳食与 STZ 联合诱导造模,即以高脂高糖饲料( 20% 蔗糖、 15% 猪油、 5% 蛋黄粉、 60% 基础饲料)喂养大鼠 1 个月,禁食不禁水 12 h ,一次性 ip 给予 5 mg/kg STZ (采用 pH 4.2 4.5 0.1 mol/L 枸橼酸三钠 - 枸橼酸缓冲液配制), 3 d 后测定血糖, 2 周后血糖依旧稳定,且空腹血糖≥ 11.1 mmol/L 者纳入 2 型糖尿病模型。

2.3 分组与给药

未造模前按体质量随机选取 10 只大鼠为对照组,将造模成功的 30 只大鼠,以血糖值随机分为 3 组,分别为模型组、阳性对照二甲双胍组、黄连提取物组,每组 10 只;二甲双胍组 ig 给予一定剂量( 0.097 g/kg )二甲双胍,黄连提取物组 ig 给予黄连提取物 4.36 g/kg (根据人临床剂量每天 45 g 折算),对照组与模型组 ig 等体积 0.5% CMC-Na ,每天给药 1 次,连续给药 30 d

2.4 口服糖耐量的测定

给药 4 周后,空腹 12 h ,每组以 2 g/kg 剂量 ig 葡萄糖,分别测定给予葡萄糖后 0 15 30 60 120 min 的血糖值。

2.5 空腹血糖和胰岛素水平的测定

末次给药后,各组大鼠禁食不禁水 12 h ,眼眶取血,用血糖仪测定空腹血糖值,按试剂盒方法测定胰岛素水平,计算其胰岛素抵抗指数( HOMA-IR )。

HOMA-IR =空腹胰岛素值×空腹血糖值 / 22.5

2.6 体质量 尿量的检测

给药期间,每周检测 1 次体质量。末次给药后,称各组大鼠体质量,将各组大鼠置于代谢笼中,收集每只大鼠 24 h 尿液,测定尿量。

2.7 粪便取样与检测

给药 4 周后无菌采集对照组、模型组、黄连提取物组大鼠的直肠段内容物于冻存管中,立即存放至液氮中, 2 h 后取出干冰运送至上海美吉生物医药科技有限公司,进行 16 S rRNA 基因测序检测。

2.8 数据处理

采用 SPSS 13.0 软件进行统计分析,数据用 表示,采用单因素方差分析进行统计,组间比较采用 LSD 多重比较。检测显著丰度差异特征、筛选与丰度有显著性差异的类群以及每个组分(物种)丰度对差异效果影响的大小使用 non-parametric factorial Kruskal-Wallis (KW) sum-ranktest (非参数因子克鲁斯卡尔 - 沃利斯秩和验检)以及线性判别分析( LDA )软件 LEfSe http://huttenhower.Sph. harvard.edu/galaxy/root?tool_id lefse_upload )。数据去杂和参数的设置使用软件 FLASH Trimmomatic ;使用软件平台: Usearch vsesion 7.0 http://drive5.com/uparse/ );分类学分析采用 RDP classifier 贝叶斯算法对 97% 相似水平的 OTU 代表序列进行分类学分析,参考 16 S 细菌和古菌核糖体数据库 Silva Release128 http://www.arb-silva.de )。

3 结果

3.1 口服糖耐量测定结果

由图 1-A 可以看出,黄连提取物组与模型组相比,血糖上升的幅度以及血糖的最大值都明显降低,说明黄连能够有效地改善 2 型糖尿病大鼠的糖耐量。

3.2 各组大鼠尿量与体质量比较

黄连提取物组与模型组相比大鼠体质量显著提高( P 0.05 ),大鼠尿量明显降低( P 0.05 ),说明黄连提取物能够改善 2 型糖尿病大鼠体质量减轻与尿量增多的症状,各组大鼠体质量和尿量测定结果见图 1

3.3 各组大鼠空腹血糖、胰岛素水平和 HOMA-IR 比较

与对照组比较,模型组大鼠空腹血糖和 HOMA-IR 显著升高( P 0.001 ),与模型组比较,黄连提取物组大鼠空腹血糖和 HOMA-IR 均显著降低( P 0.01 ),结果见表 1

3.4 肠道微生物测序结果

根据 16 S rRNA 的测序结果,采用 RDP classifier 贝叶斯算法对 97% 相似水平的 OTU 代表序列进行分类学分析,参考 16 S 细菌和古菌核糖体数据库 Silva Release128 http://www.arb-silva.de ),得到了 951 OTU 15 个门、 25 个纲、 43 个目、 69 个科、 182 个属、 357 个种。图 2 的数据结果得到 P 0.001 ,说明组间具有统计学意义。图 3 的聚类结果表明各组间微生物群落物种有明显差异。由图 4 可知对照组、模型组与黄连提取物组中拟杆菌 门( Bacteroides )、厚壁菌门( Firmicutes )的丰度都较高,为优势菌群;在对照组中拟杆菌门( Bacteroides )的丰度高达 53.07% ,厚壁菌门在模型组中的丰度高达 43.23% ,且在黄连提取物组中梭杆菌门( Fusobacteria )的丰度显著高于对照组与模型组( P 0.01 ),而在模型组中放线菌门 Actinobacteria )的丰度明显高于对照组与黄连提取物组( P 0.05 );脱铁杆菌门( Deferribacteres )只在模型组中含有,在对照组与黄连提取物组中, 未检测到,说明在经膳食联合 STZ 诱导的 2 型糖尿病模型中放线菌门与脱铁杆菌门可能是潜在的标志菌。螺旋体门( Spirochaetae )、柔膜菌门( Tenericutes )、脱铁杆菌门、黏胶球形菌( Lentisphaerae )在黄连提取物组中均未检测到,说明黄连提取物对其可能有一定的抑制作用;厚壁菌门、螺旋体门、柔膜菌门、迷踪菌门( Elusimicrobia )在模型组中丰度高于对照组,而黄连提取物组中的丰度有所降低;在黄连提取物组中变性菌门( Proteobacteria )、梭杆菌门、疣微菌门( Verrucomicrobia )的丰度略高于对照组与模型组,提示黄连提取物可能可以改善模型大鼠肠道菌群的紊乱。由图 5-A HeatMap 中颜色变化与相似程度可以更直接地比较对照组、模型组与黄连提取物组在门水平上群落组成的相似性与差异性,图 5-B 中,分析了 15 个门与口服糖耐量曲线下面积( AUC )与 HOMA-IR 的相关性,由图可知梭杆菌门的相关性较低,而放线菌门与脱铁杆菌门相关性较高。由图 6 可知不同门之间的进化远近关系,值得注意的是,拟杆菌门进化距离最大,说明其与厚壁菌门等菌种的进化关系较远。


4 讨论

运用黄连治疗消渴症具有一定的依据,有关研究报道黄连的主要成分是异喹啉类生物碱,主要包括小檗碱、巴马汀、黄连甲基碱等,其中小檗碱是其主要成分。小檗碱可以通过调节 P 细胞功能抑制 糖原异生或者促进糖酵解产生起到降血糖的作用 [1] 改善胰岛素抵抗,且小檗碱还具有降低血清胆固醇( TC )、三酰甘油( TG )、低密度脂蛋白胆固醇( LDL-C )等作用,其作用机制可能是通过调节细胞外信号调节激酶( ERK )的活性,转录后提高低密度脂蛋白受体(







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