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分享4个基因分析的网址

实验万事屋 · 公众号 · 科研 · 2017-05-23 11:34

正文

之前给大家介绍过两个数据库，GeneCard和MalaCard数据库，大家不要一脸懵逼地看着我们，会心碎，实在记不得了请点这两个超链接（如何快速了解一个疾病的综合性信息？基因信息查询网址，一个就够）。

今天给大家接着讲这两个数据库里好用的小工具。需要提醒的是，这些分析需要教育机构的邮箱进行注册，如果没有的请火速读博，从此过上幸福生活（博士的幸福生活I, II, III）。

1、GeneAnalysis（https://ga.genecards.org/#input）：这个在线工具只能分析人的基因和老鼠的基因。这个在线工具其实就是对于多个基因进行整合的分析，如图即是网页的初始界面。

我们点击分析以后，会发现看到这些基因共同的汇总信息，如图

我们可以通过结果的分类来观察这些结果的具体信息。其主要分类有：组织中的表达情况；和输入基因相关的疾病；通路分析；GO分析；表型分析和分子组成分析

2、GeneAlaCart(https://genealacart.genecards.org/Query): 假如我有一些基因，我想下载这些基因所有各自相关的信息，那么我就可以用这个软件。网页的初始界面如图，我们只需要填入基因，选择自己想要保存的分类内容，然后点击提交即可，然后结果会以excel的形式保存下来。

在下载下来的excel格式中，如果全选的话一共有26个分类，包括molecular function descriptions, phenotypes, human phenotyeontology, biological Processes, Cellular Components, Molecular Functions, Pathways, Interactions, Super Pathway等等。

3、Genes Likes me(https://glm.genecards.org/#input):，如果我有一个基因，我想知道和基因相似的其他基因有哪些，那么这个软件就可以帮我们做到。

如图数据基因名即可

我们来输入TP53，即可看到结果如下，排在前面的TP63\TP73为TP53同家族的：

4、VarElect（https://ve.genecards.org/#input）如果我有一些基因，我想知道这些基因的哪些基因是和某一临床表型相关，我就可以用这个分析工具。如图，我们在左边的方框输入基因名，enter phenotype keywords(输入临床表型关键词)输入deaf(举个例子)。