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[程序分享] R绘制基因突变circos图的方法

VG生信软件  · 公众号  ·  · 2017-09-13 16:54

正文

Circos图,又称Chord Diagram,中文名:和弦图,在基因突变的高大上文章中非常常见,主要用于快速查看个体基因突变位点的主要染色体分布区,以及不同染色体突变频率的分布情况。偶然间看到R绘制该图的方法,学习了一下, 跟大家分享一下。


如下表是经过整理过的一个样板数据:



ID



Chr.1



Chr.2



Chr.3



Chr.4


1

105

450

92

96

2

20

46

78

33

3

118

553

94

317


4



100



18



108



104



简单解释即是:个体1在1号染色体上有105个突变位点,2号染色体上有450个突变位点,3号93个突变位点……

这张表如果用Circos图来表示如下:








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