浙大医学院14.3分研究揭示小檗碱抑制肝细胞癌进展新机制！干湿结合这玩法不就get?

书接上文，前面介绍了科学界的双胞胎 Science Advances 和 Advanced Science 之间的 5 个区分点，并速览了 Science Advances 上发表的干湿结合类文章类型（详见文末推荐阅读）。 今天一起来看 Advanced Science 近 1 个月见刊的医学领域的干湿结合类文章吧。

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题目 ： Berberine Protects against Hepatocellular Carcinoma Progression by Regulating Intrahepatic T Cell Heterogeneity

作者单位 ：浙江大学医学院

文章看点 ：小檗碱（ Berberine, BBR ）对肝细胞癌（ Hepatocellular Carcinoma, HCC ）的潜在治疗作用，特别是其如何通过调节肝脏内 T 细胞的异质性来抑制 HCC 的进展。研究通过建立 HCC 小鼠模型，并使用不同剂量的 BBR 进行治疗，发现 BBR 能有效减少肿瘤负担，并通过质谱细胞术（ CyTOF ）和单细胞 RNA 测序（ scRNA-seq ）分析揭示了 BBR 对肿瘤免疫微环境中 T 细胞亚群的影响，包括减少表达抑制性受体的效应 T 细胞比例和增加具有潜在抗肿瘤特性的中央记忆 T 细胞比例。此外，研究还发现 BBR 可能通过调节免疫细胞间的细胞因子介导的受体 - 配体相互作用来增强抗肿瘤免疫反应。

编者按 ：干实验主要在上游，且占比超过 90% ，涉及到的组学技术包括质谱流式和单细胞转录组。

题目 ： Endothelial Cell-Derived Extracellular Vesicles Promote Aberrant Neutrophil Trafficking and Subsequent Remote Lung Injury

作者单位 ：东南大学医学院中大医院

文章看点 ：这篇文章主要研究了在脓毒症引起的急性呼吸窘迫综合征（ ARDS ）中，内皮细胞释放的胞外囊泡（ EVs ）如何促进具有反向跨内皮迁移（ rTEM ）表型的中性粒细胞的异常迁移，以及这些中性粒细胞如何与远端肺损伤相关。研究通过单细胞 RNA 测序（ scRNA-seq ）技术鉴定了在脓毒症小鼠模型肺组织中功能性激活的中性粒细胞亚群，并利用蛋白质组学分析揭示了炎症内皮细胞释放的富含 karyopherin subunit beta-1 (KPNB1) 的 EVs 如何促进中性粒细胞的 rTEM 。此外，研究还通过临床样本分析，证实了内皮细胞来源的 EVs 在脓毒症患者中的水平升高，并与 rTEM 中性粒细胞的比例呈正相关。

编者按 ：干实验在上游，占比约为 20~30% ，涉及到的组学技术主要为单细胞 RNA 测序和 bulk 蛋白质组学。

题目 ： Forkhead Box Protein K1 Promotes Chronic Kidney Disease by Driving Glycolysis in Tubular Epithelial Cells

作者单位 ：武汉大学人民医院

文章看点 ：这篇文章主要探究了 FOXK1 在慢性肾脏病（ CKD ）进展中的作用，特别是其在肾小管上皮细胞（ TECs ）中促进糖酵解和加剧肾脏纤维化的能力。研究发现， FOXK1 在 TECs 中的表达与 CKD 的进展密切相关，其通过液 - 液相分离（ LLPS ）形成核内凝聚体，增强了其转录活性，从而驱动一系列糖酵解相关基因的表达，导致能量代谢从脂肪酸氧化（ FAO ）向糖酵解转变。研究还探索了通过靶向 FOXK1 基因治疗 CKD 的潜力。

编者按 ：干实验在上游和下游均存在，占比约为 10% ，涉及到的组学技术主要为单细胞转录组， ChIP-seq ， Bulk 蛋白组。

题目 ： GJB2 Promotes HCC Progression by Activating Glycolysis Through Cytoplasmic Translocation and Generating a Suppressive Tumor Microenvironment Based on Single Cell RNA Sequencing

作者单位 ：南京医科大学附属南京第一医院

文章看点 ：这篇文章主要探究了 GJB2 在肝细胞癌（ HCC ）中的促进作用，特别是其通过细胞质转位激活糖酵解，并在肿瘤微环境中产生抑制性影响，从而促进 HCC 的进展。研究发现， GJB2 在 HCC 恶性细胞中高度富集，并且其高表达与预后不良相关。 GJB2 与糖酵解相关，通过促进 NF-κB 通路和 HIF-1α/GLUT-1/PD-L1 通路的激活来发挥作用。此外， GJB2 的敲低可以重塑肿瘤免疫微环境，而丹参素 B （ Salvianolic acid B ）能够抑制 GJB2 的活性，增强抗 PD-1 治疗的敏感性。

编者按 ：干实验在上游，占比约为 30% ，涉及到的组学技术主要为单细胞转录组， Bulk 蛋白组及代谢组。

题目 ： Neutrophils Recruited by NKX2-1 Suppression via Activation of CXCLs/CXCR2 Axis Promote Lung Adenocarcinoma Progression

作者单位 ：台湾国立阳明交通大学

文章看点 ：这篇文章主要探究了 NKX2-1 在肺腺癌（ LUAD ）进展中的作用，特别是它如何通过激活 CXCLs/CXCR2 轴来招募中性粒细胞，从而促进肿瘤的发展。研究发现， NKX2-1 的表达下调与高级别的 LUAD 相关，并且与中性粒细胞的招募和浸润有关。本研究揭示了 NKX2-1 低表达的肿瘤与中性粒细胞之间的强细胞间通讯。 NKX2-1 的缺失会触发 LUAD 细胞中 CXCL1 、 CXCL2 、 CXCL3 和 CXCL5 的表达和分泌，而 CXCR2 的拮抗剂 SB225002 能够抑制这种招募，减少肿瘤生长。这些发现表明， NKX2-1 通过抑制 CXCLs/CXCR2 依赖机制来调节促进肿瘤的中性粒细胞的浸润，因此，针对 CXCR2 在 NKX2-1 低表达的肿瘤中可能是一个潜在的抗肿瘤治疗策略。

编者按 ：干实验主要在下游，占比约为 50% 。主要涉及到的组学为单细胞转录组， bulk RNAseq ， Chipseq ， ATACseq ，蛋白组。

题目 ： PTBP3 Mediates IL-18 Exon Skipping to Promote Immune Escape in Gallbladder Cancer

作者单位 ：上海交通大学医学院附属新华医院

文章看点 ：这篇文章主要探究了剪接因子 PTBP3 在胆囊癌（ GBC ）中的作用，特别是它如何通过促进 IL-18 的外显子跳跃，导致肿瘤特异性表达的 ΔIL-18 ，进而促进胆囊癌的免疫逃逸。研究发现， PTBP3 的高表达与胆囊癌患者的不良预后相关， PTBP3 通过减少 CD8+ T 细胞中 FBXO38 的转录水平，降低 PD-1 的泛素介导降解，从而促进胆囊癌的免疫逃逸。此外，研究还发现 H3K36me3 通过招募 PTBP3 来促进 IL-18 的外显子跳跃，而 SETD2 （一种 H3K36 甲基转移酶）与 hnRNPL 的结合干扰了 PTBP3 与 IL-18 前 mRNA 的结合。这些发现为胆囊癌的免疫治疗提供了新的视角。

编者按 ：干实验主要在上游，占比约为 25% 。涉及到的组学技术主要为单细胞转录组， bulk RNAseq ， RIPseq ， ATACseq ，蛋白组。

写在最后

（1） 整体来看， Advanced Science 虽然也是综合性期刊，但是其中的医学类文章的占比很高，小编仅仅是速览近一个月的文章，已经可以挑出很多干湿结合类的 ~

（2） 以前总听人说， Advanced Science 的国人文章占比高，这次小编真信了 ~

留个悬念

今天介绍的文章中都有单细胞测序，那么没有单细胞的文章， Advanced Science 到底收不收呢？

且听下回分解 ~