2017年9月16日-17日（15日下午报到） 上海
【课程简介】
随着新一代高通量测序技术的快速发展，在准确度大大提高的前提下,不断产生出巨量的分子生物学数据，这些数据其数量巨大、关系复杂。随着基因组学的发展，利用高通量测序等技术，全球生物研究机构建立了众多基因信息数据库，如NCBI数据库、全球最大的癌症基因信息数据库TCGA、KEGG数据库等。
这些数据库包含了海量的基因信息数据，如何借助多种生物数据挖掘工具对这些海量数据进行有效的分析和深入的研究，成为生命科学工作者们关注的焦点。生物数据挖掘技术已经成为当前生物信息领域的重要突破口。
有数据分析的需求却苦于不知从何着手？面对众多的生物信息学分析软件却不知该如何选择应用？对于软件繁杂的使用方法和众多参数不知如何取舍？在实验数据的质量评估时不知如何分析与校对？为此特举办“肿瘤基因组高通量测序与深度数据挖掘实操学习班”，以帮助学员掌握如何从高通量海量的数据中提炼有用信息，获取有价值的分析结果。
【主办单位】
上海玮瑜生物科技有限公司
【主讲老师】
宋伟 上海交大博士，专注生物信息学进十年。参与并主导尔云100多个专著和2项专利的撰写申请。精通perl、R等编程语言，有丰富的项目分析思路设计和个性化分析经验，擅长转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析及疾病预后与关联分析等。
【课程内容】
|
第一天
|
生信简介：
|
生信的特点、医学临床与生信的关联、生信包含的方向及作用等等
|
|
高通量数据介绍
|
基因芯片（microarray）和二代测序（NGS）的组学类型及数据介绍。
|
|
案例式讲解常用生信数据库的使用
|
NCBI数据库（包括GEO、pubmed、GENE等）
TCGA数据（样本量最大最权威的癌症研究数据库）
KEGG 数据库（信号通路、代谢通路、疾病通路等等）
mirBase数据库
其他常用数据库
|
|
生信文章解读
|
基于SCI文献，解读芯片或测序的分析思路
|
|
测序报告解读
|
测序标准化分析报告的解读
|
|
差异分析
|
常用的几种差异分析方法、原理及过程（GEO2R, LIMMA等）
|
|
上机实操
|
基因信息的查找；
某种方向的公共数据查找（例如乳腺癌）
高通量公共数据的查找和下载
差异表达基因分析
|
|
第二天
|
功能富集分析
|
GO功能富集分析、KEGG pathway功能富集分析的原理、过程（DAVID、Enrichr等）
|
|
蛋白互作分析
|
蛋白与蛋白互作分析的原理、作用及分析过程（string）
|
|
网络图构建
|
本地网络做图软件cytoscape工具的操作
|
|
网络分析
|
拓补学分析、聚类模块分析
|
|
上机实操
|
差异表达基因的功能富集分析（GO和pathway）
差异基因的蛋白互作网络（PPI）关系对的分析
蛋白互作网络图的构建
网络模块分析
|
【时间地点】
2017年9月16日-17日（15日下午报到） 上海莫泰酒店会场
【注册费用】
2400元/人 注册费包含教材、午餐等费用
。
【付款方式】
1，转账或支付宝： 2，现场刷卡或现金：（可以刷公务卡）
【缴费账号】
A：汇款账户
账户名称：上海服淡信息科技有限公司 账户号：31578103002581719
开 户 行：上海银行桃浦支行
B：支付宝转账
收款人：[email protected] 支付宝户名:上海玮瑜生物科技有限公司
【酒店入住】
上海莫泰酒店 单间（含早餐）260元/人 上海虹口区广灵二路5号
【说明】
1、请自带笔记本电脑,会场我们会布置足够电源插座。
2、现场使用的学习软件和练习素材参会当天统一发放并指导安装。
【联系方式】
谢老师 13611825136 E-mail：[email protected]
【报名方式】
医麦客
丨出品
为生物医药发声的专业媒体人
转载请联系：[email protected]
☟
阅读原文 免费加入「个人会员」
