说起三代和10 x ,有人很熟悉,有人不是很了解。
我简单的跟大家说一下,
这个可以说是一对冤家,他们都是一种测序技术。
三代是指三代单分子测序技术,
优点是测得长,没有GC偏好,缺点是贵。
现在虽然Sequel可以正常使用,但是仍然很贵。
10 x是类似分组鸟枪法的一种技术,他有点是测得长,便宜,缺点是有GC偏好,说白了就是二代测不到的,它也测不到。但是便宜。
曾经有人说过10x就是生不逢时。
套用最近徐晓东和太极大师比武的热点。
三代就是徐晓东,非常简单粗暴,包括最近发表的基因组包括山羊,水稻,藜麦等等,几乎就是纯三代的天下。
反观10 x是久经沙场的经典的二代测序,沉稳,老辣,太极大家,号称是三代的在组装领域的强劲对手。但是没啥信息出来。
包括原来鼓吹10x 的某些公司 貌似也在悄悄的或者大张旗鼓的引进三代。
搞事情啊。
10x完了吗?
最近10x 在Genome Research 上做了一个宣传。号称他们能用超级便宜的手段组装出真正的二倍体基因组。
这个的优势在于,像某些物种,比如人,要测好多好多个的,都用三代denovo进行做,这个成本是吃不消的。
同时,
去年罗氏跟Pacbio公司泪别,去拥抱了二代测序,这个也是很有意思的。
现在三代和10x 一个高调,一个低调。一个大红大紫,一个隐居深山。
到底谁在未来,更有发展优势和空间,你怎么看。
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