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三代和10X genomics,你说谁会赢

生信人  · 公众号  · 生物  · 2017-05-12 07:19

正文

说起三代和10 x ,有人很熟悉,有人不是很了解。

我简单的跟大家说一下,

这个可以说是一对冤家,他们都是一种测序技术。


三代是指三代单分子测序技术,

优点是测得长,没有GC偏好,缺点是贵。

现在虽然Sequel可以正常使用,但是仍然很贵。


10 x是类似分组鸟枪法的一种技术,他有点是测得长,便宜,缺点是有GC偏好,说白了就是二代测不到的,它也测不到。但是便宜。


曾经有人说过10x就是生不逢时。

套用最近徐晓东和太极大师比武的热点。


三代就是徐晓东,非常简单粗暴,包括最近发表的基因组包括山羊,水稻,藜麦等等,几乎就是纯三代的天下。

反观10 x是久经沙场的经典的二代测序,沉稳,老辣,太极大家,号称是三代的在组装领域的强劲对手。但是没啥信息出来。

包括原来鼓吹10x 的某些公司  貌似也在悄悄的或者大张旗鼓的引进三代。

搞事情啊。

10x完了吗?


最近10x 在Genome Research 上做了一个宣传。号称他们能用超级便宜的手段组装出真正的二倍体基因组。


这个的优势在于,像某些物种,比如人,要测好多好多个的,都用三代denovo进行做,这个成本是吃不消的。

同时,

去年罗氏跟Pacbio公司泪别,去拥抱了二代测序,这个也是很有意思的。


现在三代和10x 一个高调,一个低调。一个大红大紫,一个隐居深山。


到底谁在未来,更有发展优势和空间,你怎么看。

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