小白不用R照样画热图

MeV可以应用于芯片数据及NGS数据分析。其单机版下载地址：

https://sourceforge.net/projects/mev-tm4/

同时他也具有在线版本供大家使用：

http://www.tm4.org/#/welcome

下面小编说一下单机版画热图过程

（1）选择数据格式：数据格式可以为为txt格式，具体内容如下图。就是一个基因在不同样本中的表达值了。

（2）软件运行。下载完毕解压后，点击下面的最后一个文件TEMV.bat文件，打开程序。

结果出现如下程序中间运行界面

最终主程序打开了

（2）数据导入：选择“File—>Load Data”，弹出“Expression File Loader”窗口。如下：

点击“Browse”按钮，打开你的表达量数据文件，出现如下界面：

（3）点击load后就出现下面热图了

（4）设置聚类参数：单击MeV主界面“Clustering”按钮，选择层次聚类（Hierarchical Clustering）。出现下面界面，选择相应参数（可以默认），单击“OK”按钮。

（5）展开窗口左侧的“HCL(1)”结点，点击层次聚类树（HCL tree）可查看不同基因表达谱及其聚类的信息。

聚类结果

（5）此外此软件还可以做差异表达分析，具体功能在Statistics中。

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