应制定废弃物存放和清除制度，有特殊要求的废弃物其处理方式应符合有关规定
设废弃物专用容器，与加工用容器有明显的区分标志
废弃物分类放置在有盖的容器中，做到日产日清，防止污染食品、食品接触面、水源及地面，防止不良气味或污水的溢出，清除后的容器应及时清洗，必要时进行消毒。设计专门的垃圾口，安装有防蝇帘，将生产废弃物直接投递出车间。使用外置的垃圾车。
由于使用了物流和人流分流的通道,垃圾是安排专人进行清理出车间的，交叉污染的机率减少。车间外废弃物放置场所应与食品加工场所隔离防止污染；应防止不良气味或有害有毒气体溢出；应防止虫害孳生。
废弃食用油脂必须按《食品安全法》等法律、法规进行管理。废弃食用油脂应存放在标有“废弃油脂专用”字样的专用密闭容器内，专人负责管理。
《出口水产品生产企注册卫生规范》第5.4条规定：厂区内不得有卫生死角和蚊蝇孳生地；废弃物、垃圾应用加盖的不漏水、防腐蚀的容器盛放及运输，废弃物和垃圾应及时清理出厂。
BRC第八版4.12条款中4.12.2规定：
内部和外部的废料收集容器和存放废料设施的房间应得到管理，以最大限度地减少风险。这具体包括：
明确的识别
设计易于使用和有效保洁
维护良好，以便于保洁以及必要情况下的消毒
以适当的频率清空。
根据具体情况，外部的废料收集容器应加以覆盖或将门保持关闭。
