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一文读懂 PCR 技术,从基础到高手进阶(附 96 页进阶资料)

生物制品圈  · 公众号  · 生物  · 2025-01-30 12:59

正文

一、前言


本文详细梳理了 PCR 技术知识,包括其定义、原理、操作步骤、类型、用途等。此外,还有一份 96 页的 PCR 进阶 PDF《How to Become a PCR PRO》,若你有需要,留言即可获取,记得关键词是“2025新年好”。下面是该 PDF 的目录:

二、什么是 PCR?


PCR 即聚合酶链反应,是一种核酸扩增技术,能在体外快速复制 DNA 或 RNA 片段,就像 “分子影印”。1983 年,美国生物化学家 Kary Mullis 突发灵感,后来这项技术让他在 1993 年获诺贝尔化学奖 。


该技术基于细胞内 DNA 复制原理,以 Sanger 的 DNA 测序为基础发展而来。1976 年发现的热稳定 Taq DNA 聚合酶,为 PCR 奠定基础。此前,因普通聚合酶无法耐受高温,每次扩增都需添加新酶。Taq 酶能耐受高温,使 PCR 可多次循环扩增,更高效便捷 。1985 年,《科学》杂志首次描述 PCR 技术,1993 年首个 FDA 批准的 PCR 试剂盒上市,此后 PCR 不断改进。

三、标准 PCR 实验概述


PCR 用于从复杂起始材料中扩增特定 DNA 片段,部分技术无需预纯化 DNA 或 RNA,但需知道待扩增片段两侧序列信息。

实验所需的 5 种关键试剂为:

  1. 模板 DNA:来源多样,如基因组 DNA、cDNA、质粒 DNA 等。

  2. DNA 聚合酶:常用 Taq 聚合酶,适用于标准 PCR。新一代聚合酶性能更优,有的可减少非特异性扩增,有的具有 “校对” 功能。

  3. 引物:是短单链 DNA 片段,设计时要避免与相似序列结合,保证熔融温度相似,防止形成二级结构或引物二聚体,可借助在线工具设计。

  4. dNTP:包含四种碱基核苷酸,等摩尔量添加用于合成新 DNA 链。

  5. PCR 缓冲液:含氯化镁、tris - HCl、氯化钾,维持反应最佳条件。


将试剂混合放入热循环仪,经历变性、退火、延伸三步为一个循环,通常重复 30 - 40 次。

  1. 变性:95°C 加热使 DNA 双链分离。

  2. 退火:冷却至 50 - 65°C,引物与模板 DNA 结合,退火温度需根据引物优化。

  3. 延伸:升温至 72°C 左右,DNA 聚合酶合成新链。


反应结束后,常用凝胶电泳检测扩增是否成功,根据实验目的,PCR 产物可能是终点,也可能用于后续测序、克隆等研究。

四、PCR 变体


  1. 定量实时 PCR(qPCR):可实时监测扩增并定量,借助荧光染料(如 SYBR® Green)或荧光探针(如 TaqMan 探针),随着目标 DNA 增加,荧光增强,通过标准品实现定量,使用带荧光检测系统的热循环仪。

  2. 逆转录 PCR(RT-PCR)和逆转录定量 PCR(RT-qPCR):用于病毒 RNA 分析和定量。RT 是将 RNA 转为 cDNA 的过程。RT-PCR 有一步法和两步法;RT-qPCR 同样分一步法和两步法,先逆转录再 qPCR 扩增 。

  3. 数字 PCR(dPCR)和数字液滴 PCR(ddPCR):基于有限稀释,将反应分成众多小分区扩增,dPCR 根据分区结果分析,ddPCR 利用水油乳剂形成分区,2011 年推出,用于新冠检测等。

  4. 微流控 PCR:利用微流体技术,在芯片上扩增 DNA,具有速度快、试剂消耗少等优势,适用于即时检测,样品流经微通道经不同温度区完成循环。

五、各种 PCR 优缺点


六、PCR 的应用
  1. 研究应用:用于基因转录研究、基因分型、克隆和诱变、测序等实验,在基因工程、生物研究等方面意义重大。

  2. 多学科应用:在基因研究中,助力基因转录分析、生物基因序列操纵、基因分型等;医学上用于疾病诊断、产前基因检测、植入前遗传学诊断;法医学中用于亲子鉴定、法医调查、真实性测试;环境微生物学和食品安全领域用于病原体检测。


PCR 技术应用广泛,改变了众多学科研究方式,是现代科学研究的重要工具。

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