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代谢组学研究通常需要多个地点进行材料制备和分析，大多数研究都是“高通量”，这意味着样品组的化学分析不可避免地要在很长一段时间内进行。在
《植物代谢组学：方法和方案》
中，该领域的专家研究人员详细介绍了现在常用于研究植物代谢组学工作流程的许多阶段，比如统计分析、元数据的准确和详细收集对于良好的流程管理、满足报告要求并确保更广泛的可解释性和重复使用结果都至关重要，本书旨在帮助科学家进一步研究植物代谢组学工作流程所有阶段的方法。
目录
2 植物代谢组学实验和植物材料生长指南的实验设计方面
3 分离不可分割的：植物-病原体相互作用的代谢组学分析
4 作物代谢组学样品的收获、取样、储存和运输注意事项
6 瓜类和大米中天然挥发性成分的固相微萃取 GC-MS 分析
11 用于植物代谢物分析和代谢物鉴定的傅立叶变换离子回旋共振质谱法
12 用于十字花科代谢组学的 NMR 和流动注射 ESI-MS 组合
13 ICP-MS 和 LC-ICP-MS 用于分析谷物中的微量元素含量和形态
14 使用基因组学和代谢组学方法量化草中的真菌内共生体和生物碱
15 使用 MetAlign 对标称和精确质量 LC-MS 或 GC-MS 数据进行数据（预）处理
16 TagFinder：用于基于气相色谱-质谱的代谢组分析的指纹和分析的预处理软件
17 化学鉴定策略使用液相色谱-光电二极管阵列-固相萃取-核磁共振/质谱法
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