1687年3月1日,牛顿写信告诉哈雷,第二编手稿已邮寄给他。哈雷与牛顿心照不宣,两人都避免谈起一件令人极不愉快的事。那是牛顿刚刚开始写作《自然哲学之数学原理》的时候,胡克看到了牛顿写的《论运动》,并以学会秘书的身份参与做出了出版牛顿著作的决定。
但他提了一个个人要求,牛顿必须在他的书中提到是他胡克最早发现了平方反比定律,因为牛顿是从他那里学到这一发现的。哈雷尽可能婉转地把这个消息告诉了牛顿。牛顿大发雷霆:他早在20年前就知道了这一关系,哪轮到胡克来教他!
胡克暗示牛顿剽窃他的发现,但他自己却从来没有从数学推导出这一平方反比关系!
盛怒之下,牛顿通知哈雷,他要推翻原先的写作计划,不发表已经考虑成熟的第三编了。哈雷十分耐心地在胡克和牛顿之间斡旋调解,最后终于使胡克降低了要求,只要牛顿提到他也考虑过平方反比就可以了。而牛顿则在《自然哲学之数学原理》第一编中加写了一个附注,其中提到了雷恩、哈雷和胡克,让他们三人共享了由行星周期正比于圆周半径3/2次幂定律、发现向心力反比于半径平方的荣誉。
哈雷为人忠厚,在处理牛顿手稿时把自己的名字与胡克对调一下,免得高居学会秘书要职的胡克排在他这个晚辈之后。
提到胡克并不等于抹杀牛顿是平方反比定律的真正发现者,他比胡克早近20年就已知道了这一点,
而且,唯独他才能从数学上推导出来。胡克猜到了,但拿不出证明,而牛顿写下的证明,胡克根本就看不懂,因为它是用最新、最难的数学语言写就的,是运用了流数法(就是我们今天高等数学里的微积分)才证明得出来的。
早在牛顿发表他的科学处女作光学论文时,胡克以居高临下的姿态对牛顿横加挑剔;在他们讨论动力学关系时,胡克扮演了一个偷袭者的不光彩角色;而到牛顿写作《自然哲学之数学原理》时,胡克差不多是在乞求牛顿让他分享一份虚荣。一旦《自然哲学之数学原理》出版,无论胡克再怎样与牛顿为敌都无济于事了,牛顿的名望和影响一跃而起,犹如展翅高飞的大鹏,而胡克只不过是一只小麻雀罢了。
不过,胡克没有停止小动作,只是牛顿不知道罢了。就在牛顿专心致志写作《自然哲学之数学原理》的时候,身为皇家学会秘书的胡克多次克扣学会工作人员哈雷的工资,而他不会不知道哈雷是在自费出版牛顿的书,每年50镑的学会工资对当时的哈雷不是小数目。而当牛顿写作《自然哲学之数学原理》第三编时,胡克甚至还指使亲信搞了一次听证会,对哈雷在学会的工作表现和实绩进行调查评价和表决。哈雷工作勤勉出色,无可挑剔,顺利通过了那次“考核”。否则,我们真的无法想象哈雷会遭遇到怎样的困难,《自然哲学之数学原理》会是怎样的命运!
牛顿为《自然哲学之数学原理》写了两个第三编,标题都叫“宇宙体系”,内容也大致相同,但是一个比较通俗,采用非数学表述,引证资料也较少;而另一个则是专业化的数学表述,引用了大量天文观测资料,充分表现出牛顿是一个非常出色的熟练天文学家。