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查找一个基因的基因序列其实好多网站都可以做到的，一般常用的应该就NCBI、ensembl和UCSC吧，这几个网站各有个的好处，大家可以根据需要选择不同得网站就行了。下面我们就用TP53为例看一下每个网站都怎么使用吧
1、NCBI:我们可以通过NCBI中Gene选项可以用来查找基因我们输入TP53后，主界面后，找到这个分类
不管是DNA还是RNA进去以后的界面是一样的，我们就拿RNA的界面来进行讲解吧。我们点击NM_000546.5。点击进去以后，我们可以看到这样的界面：
在我们可以看到关于TP53转录本1的程序的主要内容包括三个部分，我们可以通过GO to快速的定位到我们想要的部分。每个页面的最低端是这个转录本的序列。我想大多数同学都知道这个最基本的应用，这次主要讲的是在这个页面里面右侧的”Analyze this sequence”的功能。我们看到一共有四个
a）Run BLAST, 通过这个功能，我们可以比对出和这个基因相似的其他基因有哪些。这个是结果的其中一个部分的功能。
b）Pick Primer:通过这个功能我们可以设计关于这个基因的引物。NCBI的primer-blast是基于primerprimer3设计的所以设计的还是挺好的，设计加比对何乐而不为呢。
至于primer-blast的使用我记得实验万事屋之前讲过，大家可以找找。
c）Highlight Sequence Feature:点击之后，我们可以在序列上显示成这个样子：
我们可以在左下角选择我们想看的内容，比如：CDS，exon等，在序列部分会显示这个序列的内容的位置，在右下角可以看到这个部分的详细信息。如图中就是这个CDS的显示内容。
d）Find in this Sequence：这个功能就是查找的功能，我们输入我们要找的序列即可显示这个序列的位置，如图：
2、UCSC：相较于NCBI，可视化的程度其实可能并没有NCBI强，但是对于基因的定位序列而言，比如我们要找这个基因的启动子，那UCSC会比NCBI好一些的。
如图我们在UCSC的Tools中，选择Gene Sorter,在Search中输入”TP53”,点击GO
即可出现我们搜索的相关基因：我们选择TP53
即可看到TP53的浏览界面，这个界面中我们可以看到TP53在各个组织中的基本表达情况，其基因位置和描述，我们点击“Sequence”即可选择我们想看的序列
我们可以选择我们想要的序列。如果我们要看启动子区，选择想看的范围，然后查看即可，这个功能相较于NCBI要计算位置在查看要简单的很多。同时我们也可以看mRNA的序列
如图即是一个mRNA的序列，USCS会通过大小写来区分不同外显子的部分的。也算是可视化的一种吧
3、Ensembl：相较于NCBI和UCSC的话，emsembl好的一点是，可以直接下载序列，不需要我们把序列粘贴复制啥的，同时可以通过不同的颜色标记显示，还可以显示序列中的SNP信息，可视化相较于两个还是很强的。
我们打开emsembl后，搜索TP53，选择TP53(Human Gene)
进去以后，在右侧选择“sequence”即可看到TP53相关的序列了
如图显示的为：TP53这个序列的结果：我们可以看到序列中深红色的部分是外显子，另外在下载序列哪里下载序列。如果大家和我显示的不一样那是可以通过旁边的”Configure this page”来更改我们可以的内容
如图我们可以选择可以的内容，同时可以让可视序列中显示SNP的显示
我们选择显示多态信息后，同时可以选择隐藏MAF值小的SNP。如图即是隐藏了MAF<0.1以后的结果。至于其中的V是啥意思。大家发鼠标放上去就可以看到是啥SNP的改变啦。
基因序列查看的网站就介绍到这里。如果可以根据自己的需要选择合适的网站进行查找吧。建议可以把自己研究的基因序列下下来，在DNA star里面注释一下，这样就有了自己的离线的数据了。如果下载ensembl也可以，但是emsembl并不是特别稳定，这个还是我翻墙做好的，大家可以试一下。
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