近几年国自然申请越来越卷已经是不争的事实,申请人前期基础文章要求水涨船高,基本上青年项目申请有5分+,面上项目有8分+的文章在手里才比较稳妥。而随着基金委要求
申请人代表作论文需上传“公开发表的全文 PDF电子版”
规定出台,仅接收的文章已经很难作为代表作出现在申请中。因此如果有计划申请基金,前期基础一定要趁早准备!
我们之前为大家介绍过,作
为和肿瘤结合比较紧密的新热点,
瘤内菌的文章无疑在各分段,特别是高分的期刊投稿中,占据明显优势
。
然而,粉丝反映
微生物实验的复杂度
让很多研究者望而却步,怎么曲线救国
降低瘤内菌研究的实验难度
则是瘤内菌研究方向的痛点。(相关推文见:
毕业生、临床医生发文最优选!近两年发文统计揭示2024年期刊最青睐热点方向,中山大学最新佳作轻松拿下Q1文章,发文快+成本低~
)
好在经过对高分文章的分析,我们发现
瘤内菌研究具备“走捷径”的条件,可以通过课题设计技巧大大降低实验难度,轻松发文章
!
鉴于肿瘤内微生物组通过在肿瘤微环境中产生代谢物和下游相互作用来调节有效的免疫反应、治疗效果和细胞存活,所以很多研究者将目光锁定到了瘤内菌产生的代谢物。
下面,我们具体为大家介绍一下如何
优化瘤内菌方向实验设计,提高科研效率
。
题目
:
Dietary tryptophan metabolite released by intratumoral Lactobacillus reuteri facilitates immune checkpoint inhibitor treatment
.
期刊:
CELL
文章看点
:在已有研究报道益生菌双歧杆菌可能促进免疫治疗响应的前提下,作者通过动物模型的口饲来测试不同益生菌的抗瘤潜力,随后发现罗伊氏乳杆菌能诱导抗肿瘤免疫并促进黑色素瘤免疫治疗疗效。随后证明罗伊氏乳杆菌释放的色氨酸分解代谢物I3A是抗瘤免疫的关键,且I3A可促进晚期黑色素瘤患者免疫治疗的疗效。
(详情可点击图片链接阅读)
题目
:Intratumor microbiome features reveal antitumor potentials of intrahepatic cholangiocarcinoma.
期刊:
Gut Microbes
文章看点
:这篇文章来自复旦大学团队。作者首先通过16S测序检测瘤内菌的含量,随后发现发现Burkholderia tuberum和P. fungorum的丰度与癌抗原CA199呈负相关,推测它们可能具有抗肿瘤特性。进一步实验发现P. fungorum上清液可以抑制细胞增殖、迁移,携带活菌的小鼠其肿瘤体积显著降低。LC-MS对裸鼠移植瘤小鼠进行代谢组学和转录组学分析,证实细菌可以影响氨基酸代谢途径。
(详情可点击图片链接阅读)
题目
:
Clostridium butyricum and its metabolite butyrate promote ferroptosis susceptibility in pancreatic ductal adenocarcinoma.
期刊:CELLULAR ONCOLOGY
文章看点
:本文来自上海交通大学医学院。作者在分析TCGA数据中不同生存情况的胰腺癌瘤内菌数据发现,产丁酸的微生物即丁酸梭菌的丰度与疾病预后良好相关,随后作者通过口服丁酸梭菌干预动物模型并观察肿瘤增殖表型,结果发现,口服丁酸梭菌及其主要代谢产物丁酸盐均可以抑制胰腺癌的进展。随后作者基于丁酸盐处理细胞系和动物模型,进行进一步的机制研究。
(详情可点击图片链接阅读)
从上面的案例文章可以看出,如果直接进行瘤内菌相关实验,一般是通过
口服或者上清液
,但是都有一个前提——
主角微生物需要可培养且操作过程无污染
,这也是瘤内菌实验研究的痛点。
曲线救国的方法则是
对瘤内菌相关的代谢物进行机制研究
,瘤内菌相关代谢物的筛选则可以基于
代谢组学或生信的相关性分析
来锁定,瞬间将实验难度等级降低到常规实验水平,瘤内菌实验也从高不可攀变成了平易近人有木有~~